慶應義塾研究者情報データベース

経歴 【 表示 ／ 非表示 】

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• 2014年04月

  -

  2014年09月

  大阪大学, 大学院医学系研究科, 特任研究員

• 2014年10月

  -

  2015年08月

  大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教

• 2015年09月

  -

  2015年12月

  Institute of Genetics and Molecular and Cellular Biology, Post doctoral fellow

• 2016年01月

  -

  2025年03月

  Helmholtz Zentrum Munich, Institute of Epigenetics and Stem cells, Post doctoral fellow

• 2025年04月

  -

  継続中

  慶応義塾大学 医学部 坂口光洋記念, エピジェネティクス・幹細胞生物学講座, 准教授

学歴 【 表示 ／ 非表示 】

学歴 【 表示 ／ 非表示 】

• 2010年04月

  -

  2014年03月

  大阪大学, 大学院医学系研究科

研究分野 【 表示 ／ 非表示 】

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• ライフサイエンス / 分子生物学 （エピジェネティクス、初期発生、クロマチン）

• ライフサイエンス / 進化生物学

研究キーワード 【 表示 ／ 非表示 】

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• DNA複製

• エピジェネティクス

• クロマチン

• ゲノムインプリンティング

• ヒストン修飾

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著書 【 表示 ／ 非表示 】

著書 【 表示 ／ 非表示 】

• DNA複製フォークの速度は細胞の運命決定に寄与し，その低下によりリプログラミングを促進する

  羊土社, 実験医学, vol 40, 2022年

論文 【 表示 ／ 非表示 】

論文 【 表示 ／ 非表示 】

• TBP regulates transposable element expression in early mouse embryos

  Clara Hermant, Carlos Michel Mourra-Díaz, Marlies E Oomen, Natasha Jansz, Camille Noll, Antoine Canat, Mrinmoy Pal, Tsunetoshi Nakatani, Tamas Schauer, Maria-Elena Torres-Padilla

  The EMBO Journal （Springer Science and Business Media LLC）  2026年03月

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  Abstract
  
  The activation of the embryonic genome is a crucial step in development. In addition to thousands of genes, many transposable elements (TEs) are robustly transcribed during early mammalian development. However, their transcriptional regulators remain largely unexplored. Here, we set out to identify transcription factors regulating the expression of TEs from the LINE, SINE and ERVL families during mouse preimplantation development. In particular, the MaLR family are the most abundant ERVL in the mouse genome and are also the most abundant constituent of the transcriptome in early mouse embryos. We find that the general transcription factor TBP binds and activates MaLRs in mouse embryos. Loss-of-function of TBP leads to downregulation of MaLRs, specifically the ORR1A family, which is the youngest ORR subclass and contributes a significant portion of major zygotic genome activation transcripts. Our work identifies regulators of TE expression in vivo and highlights a previously unrecognised role for the general transcription factor TBP in regulating a highly specific TE transcriptional programme.

  • Access to Document (DOI)

• The establishment of nuclear organization in mouse embryos is orchestrated by multiple epigenetic pathways

  Mrinmoy Pal, Tamas Schauer, Adam Burton, Tsunetoshi Nakatani, Federico Pecori, Alicia Hernández-Giménez, Iliya Nadelson, Marc A. Marti-Renom, Maria-Elena Torres-Padilla

  Cell （Elsevier BV）  2025年04月

  ISSN  0092-8674

  • Access to Document (DOI)

• RIF1 controls replication timing in early mouse embryos independently of lamina-associated nuclear organization

  Tsunetoshi Nakatani, Tamas Schauer, Mrinmoy Pal, Andreas Ettinger, Luis Altamirano-Pacheco, Julia Zorn, David M. Gilbert, Maria-Elena Torres-Padilla

  Developmental Cell （Elsevier BV）  2025年04月

  筆頭著者,  ISSN  1534-5807

  • Access to Document (DOI)

• Dynamics of replication timing during mammalian development

  Tsunetoshi Nakatani

  Trends in Genetics （Elsevier BV）  2025年03月

  筆頭著者, 責任著者,  ISSN  0168-9525

  • Access to Document (DOI)

• The transcription factor SRF regulates MERVL retrotransposons and gene expression during zygotic genome activation

  Clara Hermant, Carlos Michel Mourra-Díaz, Marlies E. Oomen, Luis Altamirano-Pacheco, Mrinmoy Pal, Tsunetoshi Nakatani, Maria-Elena Torres-Padilla

  Genes & Development （Cold Spring Harbor Laboratory）  39 （ 7-8 ） 490 - 509 2025年02月

  ISSN  0890-9369

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  The regulatory circuitry of cell-specific transcriptional programs is thought to be influenced by transposable elements (TEs), whereby TEs serve as raw material for the diversification and genome-wide distribution of genetic elements that containcis-regulatory activity. However, the transcriptional activators of TEs in relevant physiological contexts are largely unknown. Here, we undertook an evolutionary approach to identify regulators of two main families of MERVL, a major regulator of transcription during early mouse development. Using a combination of phyloregulatory, transcriptomic, and loss-of-function approaches, we demonstrate that SRF is a novel regulator of MERVL and embryonic transcription during zygotic genome activation. By resolving the phylogenetic history of two major MERVL families, we delineate the evolutionary acquisition of SRF and DUX binding sites and show that the acquisition of the SRF site precedes that of DUX. SRF contributes to embryonic transcription through the regulation of MERVLs, which in turn serve as promoters for host genes. Our work identifies new transcriptional regulators and TEs that shape the gene expression programs in early embryos and highlights the process of TE domestication via the sequential acquisition of transcription factor binding sites and coevolution with the host.

  • Access to Document (DOI)

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総説・解説等 【 表示 ／ 非表示 】

総説・解説等 【 表示 ／ 非表示 】

• Nakatani T and Torres-Padilla ME: Totipotent durch Schneckentempo. LABORJOURNAL. 2022.

  Nakatani T., Torres-Padilla ME

  LABORJOURNAL  2022年

競争的研究費の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】

競争的研究費の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】

• 胎生ヘビにおけるインプリント遺伝子の探索

  2026年06月

  -

  2029年03月

  中谷 庸寿, 挑戦的研究（萌芽）, 補助金,  研究代表者

• 卵子形成過程における減数分裂前複製タイミング解析

  2026年04月

  -

  2030年03月

  中谷 庸寿, 基盤研究(B), 補助金,  研究代表者

• 単一生細胞レベルでの複製タイミング解析による細胞運命の早期予測

  2026年04月

  -

  2028年03月

  中谷 庸寿, 学術変革領域研究(A), 補助金,  研究代表者

• 複製タイミングから解明するマウス核移植胚のリプログラミング機構

  2025年07月

  -

  2027年03月

  中谷 庸寿, 研究活動スタート支援, 補助金,  研究代表者

受賞 【 表示 ／ 非表示 】

受賞 【 表示 ／ 非表示 】

• Best presentation award of Basic Biology Forum of Young Scientists, Osaka University.

  2014年02月

担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

• エピジェネティクス・幹細胞生物学演習

  2026年度

• エピジェネティクス・幹細胞生物学実習

  2026年度

• エピジェネティクス・幹細胞生物学

  2026年度

• エピジェネティクス・幹細胞生物学特論

  2026年度

• エピジェネティクス・幹細胞生物学特論

  2025年度

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委員歴 【 表示 ／ 非表示 】

委員歴 【 表示 ／ 非表示 】

• 2025年10月

  -

  継続中

  慶應義塾大学医学部 ヒト胚性幹細胞・ヒトiPS細胞・ヒト組織幹細胞に関する生命倫理委員会

• 2025年10月

  -

  継続中

  慶應義塾大学医学部国際交流委員会