齋藤 駿 (サイトウ シュン)

SAITO Shun

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所属(所属キャンパス)

理工学部 生命情報学科 (矢上)

職名

専任講師(有期)

HP

外部リンク

経歴 【 表示 / 非表示

  • 2017年04月
    -
    2019年03月

    東京大学, 農学生命科学研究科 応用生命工学専攻, 特任研究員

  • 2019年04月
    -
    2020年03月

    富山県立大学, 工学研究科 生物・医薬品工学専攻, 嘱託研究員

  • 2020年04月
    -
    2023年03月

    慶應義塾大学, 理工学部 生命情報学科, 助教(有期)

学歴 【 表示 / 非表示

  • 2008年04月
    -
    2012年03月

    慶應義塾大学, 理工学部, 生命情報学科

    大学, 卒業

  • 2012年04月
    -
    2014年03月

    慶應義塾大学, 理工学研究科 基礎理工学専攻, 生命システム情報専修

    大学院, 修了, 博士前期

  • 2014年04月
    -
    2017年03月

    慶應義塾大学, 理工学研究科 基礎理工学専攻, 生命システム情報専修

    大学院, 修了, 博士後期

学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(理学), 慶應義塾大学, 課程, 2017年03月

    微生物由来新規アンドロゲン受容体アンタゴニストAntarlideに関する化学生物学研究

 

研究分野 【 表示 / 非表示

  • ナノテク・材料 / ケミカルバイオロジー

  • ライフサイエンス / 応用微生物学

  • ライフサイエンス / 薬系化学、創薬科学

研究キーワード 【 表示 / 非表示

  • ケミカルバイオロジー

  • 創薬

  • 天然物化学

  • 微生物学

  • 生合成

 

論文 【 表示 / 非表示

  • The Heat-Shock Metabolite Streptolactam D, Produced by High-Temperature Culture of Streptomyces sp. JA74, Promotes Thermotolerance via Self-Membrane Stabilization

    Saito S., Okumura Y., Kataoka S., Fukaya K., Urabe D., Arai M.A.

    Journal of the American Chemical Society 147 ( 18 ) 15676 - 15685 2025年05月

    ISSN  00027863

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    A new streptolactam derivative featuring a 4-membered ring fused to a 6-membered ring in the macrolactam structure, streptolactam D (1), was isolated from the culture extract of thermotolerant Streptomyces sp. JA74. Production of compound 1 increased with high-temperature cultivation, and this type of compound was previously designated as a “heat-shock metabolite (HSM)” by our research group. The structure of 1 was determined by NMR and MS spectroscopic analyses, calculation of NMR and ECD spectra, and analysis of the biosynthetic gene cluster. Surprisingly, 1 promoted the growth of strain JA74 under high-temperature conditions and increased the growth limit temperature. Analysis of the mode of action using ultracentrifugation and scanning electron microscopy suggested that 1 localizes in the cell membrane and causes the cell to assume a short and thick morphology. Furthermore, 1 is predicted to maintain cell membrane fluidity and impart thermotolerance to strain JA74, similar to cholesterol and saturated fatty acids. These data suggest that 1 is produced to promote the survival of strain JA74 under high-temperature conditions.

  • Co-culture of Aspergillus niger IFM 59706 and RAW264 cells enhances the production of aurasperone A with nitric oxide inhibitory activity

    Ujie Y., Saito S., Banno T., Yaguchi T., Arai M.A.

    Bioscience Biotechnology and Biochemistry 89 ( 4 ) 541 - 547 2025年04月

    ISSN  09168451

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    Most actinomycetes and fungi have a multitude of silent biosynthetic genes whose activation could lead to the production of new natural products. Our group recently designed and used a co-culture method to isolate new natural products, based on the idea that pathogens might produce immune suppressors to avoid attack by immune cells. Here, we searched for compounds produced by the co-culture of immune cells with pathogenic fungi isolated from clinical specimens. The production of dimeric naphtho-γ-pyrone aurasperone A (1) was enhanced by the co-culture of pathogenic fungus Aspergillus niger IFM 59706 and RAW264 mouse macrophage-like cells. The absolute configuration of 1 was confirmed by comparison with the reported electronic circular dichroism spectrum. This is the first report of the inhibitory activity of 1 on nitric oxide production, an inflammatory mediator.

  • Aspergillus terreus IFM 65899-THP-1 cells interaction triggers production of the natural product butyrolactone Ia, an immune suppressive compound

    Ujie Y., Saito S., Fukaya K., Urabe D., Yaguchi T., Arai M.A.

    Scientific Reports 14 ( 1 )  2024年12月

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    We focused on the possibility that pathogenic microorganisms might produce immune suppressors to evade the action of immune cells. Based on this possibility, we have recently developed new co-culture method of pathogenic actinomyces and immune cells, however, the interaction mechanism between pathogens and cells was still unclear. In this report, co-culturing pathogenic fungi and immune cells were investigated. Pathogenic fungus Aspergillus terreus IFM 65899 and THP-1 cells were co-cultured and isolated a co-culture specific compound, butyrolactone Ia (1). 1 inhibits the production of nitric oxide by RAW264 cells and exhibits regulatory effects on autophagy, suggesting 1 plays a defensive role in the response of A. terreus IFM 65899 to immune cells. Furthermore, dialysis experiments and micrographs indicated that “physical interaction” between A. terreus IFM 65899 and THP-1 cells may be required for the production of 1. This is the first report of co-culture method of fungi with immune cells and its interaction mechanism.

  • Activation of Secondary Metabolism and Protease Activity Mechanisms in the Black Koji Mold Aspergillus luchuensis through Coculture with Animal Cells

    Asano Y., Saito S., Ujie Y., Iwata C., Yaguchi T., Arai M.A.

    ACS Omega 9 ( 42 ) 43129 - 43137 2024年10月

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    The activation of secondary metabolism plays a pivotal role in the discovery of novel natural products. We recently developed a coculture method involving actinomycetes and mouse macrophage-like cells to stimulate the production of bioactive compounds. A black koji mold, Aspergillus luchuensis IFM 61405, markedly enhanced the production of (3S,8R)-8-hydroxy-3-carboxy-2-methylenenonanoic acid (1a), (3S,8S)-8-hydroxy-3-carboxy-2-methylenenonanoic acid (1b), and (3S)-9-hydroxy-3-carboxy-2-methylenenonanoic acid (2) when coincubated with J774.1 mouse macrophage cells. The production of 1 and 2 increased by at least 3.5-fold and 2.7-fold, respectively, compared to monoculture after 7 days. A mechanistic investigation revealed that a protease from strain IFM 61405 plays a key role in enhancing the production of 1 and 2. This enhancement was not replicated in A. niger IFM 59706, a nonkoji mold, despite the presence of biosynthetic genes for 1 and 2 in A. niger IFM 59706. Furthermore, the addition of protease inhibitors suppressed the production of 1 and 2, suggesting that proteins secreted from animal cells, likely degraded by proteases secreted by strain IFM 61405, serve as precursors for 1 and 2. The results show that the strategy of coculturing koji mold with animal cells has the potential to enhance the production of natural products.

  • 3-Hydroxy-3-(2-oxopropyl)indolin-2-one, a product of a human-derived Enterocloster strain, is an inhibitor of nitric oxide production

    Saito S., Banno T., Arai M.A.

    Bioscience, Biotechnology and Biochemistry (Bioscience, Biotechnology and Biochemistry)  88 ( 3 ) 316 - 321 2024年03月

    ISSN  09168451

     概要を見る

    When cultured anaerobically, Enterocloster sp. RD014215 was found to produce 1 . Using nuclear magnetic resonance and mass spec- troscopy, the planar structure of 1 was determined to be 3-hydroxy-3-(2-oxopropyl)indolin-2-one. The chirality of 1 was implied as S by comparing the optical rotation value of 1 with literature reports of the synthesized compounds. To our knowledge, this work represents the first discovery of the metabolite produced by Enterocloster strain. 1 exhibited inhibition of nitric oxide (NO) production, demonstrating a 50% inhibitory activity (IC50 ) of 34 μm for NO production by murine macrophage cells subjected to lipopolysaccharide stimulation.

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KOARA(リポジトリ)収録論文等 【 表示 / 非表示

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総説・解説等 【 表示 / 非表示

  • 天然物ケミカルバイオロジー研究の現状 –前立腺がん治療薬を例として–

    齋藤 駿, 井本 正哉

    月刊「ケミカルエンジニヤリング」 (化学工業社)  62   52 - 58 2017年10月

    共著, 筆頭著者

  • 新奇天然化合物ハンティング

    齋藤 駿, 井本 正哉

    月刊化学 (株式会社 化学同人)  71   68 - 69 2016年07月

    共著, 筆頭著者

  • 創薬を志向した天然化合物の探索研究

    齋藤 駿, 田代 悦, 井本 正哉

    化学と生物 (公益社団法人 日本農芸化学会)  52   466 - 472 2014年07月

    共著, 筆頭著者

競争的研究費の研究課題 【 表示 / 非表示

  • 放線菌が生産する熱ショック代謝物(HSM)が生み出す生命力の分子機構

    2025年04月
    -
    2027年03月

    公益財団法人発酵研究所, 2025年度 若手研究者助成, 研究代表者

  • 放線菌が生産する熱ショック代謝物(HSM)の生産制御および耐熱性促進機構の解析

    2023年04月
    -
    2026年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 齋藤 駿, 若手研究, 研究代表者

  • 放線菌が生産する熱ショック代謝物 (HSM) の耐熱性促進機構の解析

    2023年04月
    -
    2024年03月

    公益財団法人 野田産業科学研究所, 齋藤 駿, 奨励研究助成, 研究代表者

  • 未研究希少放線菌の二次代謝能の解明を通じた新規植物生長制御物質の探索

    2020年04月
    -
    2023年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 齋藤 駿, 若手研究, 研究代表者

受賞 【 表示 / 非表示

  • 浜田賞(研究奨励賞)

    齋藤 駿, 2025年05月, 日本放線菌学会, 放線菌が生産する二次代謝産物の多様性および機能性の拡大を目指したケミカルバイオロジー研究

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 2025年度大会トピックス演題

    齋藤 駿, 2025年03月, 日本農芸化学会, 放線菌が生産するマクロラクタム系二次代謝物は細胞膜を安定化させ高温耐性を促進する

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • BCSJ Award

    齋藤 駿, 2024年09月, 第66回天然有機化合物討論会, 耐熱性放線菌JA74株が生産する熱ショック代謝物(HSM)の単離・構造決定および耐熱性促進機構の解析

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 令和5年度生薬天然物部会奨励研究

    2023年10月, 日本薬学会 生薬天然物部会

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 2021 JA Ōmura Awards

    2022年12月, The Journal of Antibiotics

    受賞区分: 学会誌・学術雑誌による顕彰

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担当授業科目 【 表示 / 非表示

  • 生命情報特別講義第2

    2025年度

  • 生命情報輪講

    2025年度

  • 理工学基礎実験

    2025年度

  • 現代生物学概論

    2025年度

  • 基礎生命実験

    2025年度

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担当経験のある授業科目 【 表示 / 非表示

  • 生命情報特別講義第2

    慶應義塾大学

    2020年04月
    -
    継続中

    春学期, 講義