曽我 朋義 (ソガ トモヨシ)

Soga, Tomoyoshi

写真a

所属(所属キャンパス)

環境情報学部 (湘南藤沢)

職名

教授

HP

外部リンク

教員からのメッセージ 【 表示 / 非表示

  • 自分のこれまでの経験では、実験がうまくいってもそこから得られるものは何もありません。失敗して、原因をあれこれ考えることで自分が知らなかった知見を得たり、新しい発見をしたりします。したがって、多くのことに果敢にチェレンジしてたくさんの失敗を重ねて欲しいと思います。失敗が必ず皆さんの糧になります。

経歴 【 表示 / 非表示

  • 1984年04月
    -
    1992年03月

    横河電機株式会社

  • 1992年04月
    -
    2001年03月

    横河アナリティカルシステムズ株式会社

  • 2001年04月
    -
    2002年03月

    琉球大学 , 客員教授

  • 2001年04月
    -
    2005年03月

    慶應義塾大学環境情報学部/先端生命科学研究所, 助教授(有期)

  • 2003年07月
    -
    2010年03月

    ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社, 取締役

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学位 【 表示 / 非表示

  • 工学博士, 豊橋技術科学大学, 論文, 2000年03月

 

研究テーマ 【 表示 / 非表示

  • 枯草菌、大腸菌、酵母等のバクテリアからイネやマウスの組織、ヒトの血液、尿、赤血球、ガン細胞等のあらゆる生物種の細胞内全代謝物質(メタボローム)の測定法, 

     

 

著書 【 表示 / 非表示

  • Amino Acid Analysis : Methods and Protocols

    Alterman M.Ed., (Hirayama, A., Ikeda, S., Sato, A., Soga, T., contribution for Chapter 23), Humana Press, 2019年07月

    担当範囲: Chapter 23: Amino Acid Analysis by Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ: 307-313

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    Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has been developed as a powerful tool in the analysis of charged compounds. To simultaneously analyze free amino acids, an electrolyte with low pH was used to positively charge all of the amino acids. In this condition, all protonated amino acids migrated toward the cathode in CE and then were sensitively and selectively detected by MS. This method is simple, rapid, and selective and could readily be applied to the analysis of free amino acids in various samples. In this chapter, the detailed procedure to analyze amino acids using CE-tandem mass spectrometry (MS/MS) is described.

  • Oceanography Challenges to Future Earth : Human and Natural Impacts on our Seas

    Komatsu, T., Ceccaldi, H-J., Yoshida, J., Prouzet, P., Henocque, Y. Ed., (Nakano, T., Shirakawa, H., Yeo, G., Devlin, R.H., Soga, T., contribution for Part IV ), Springer, 2019年02月,  ページ数: 430

    担当範囲: Part IV Innovative Research: Metabolome profiling of growth hormone transgenic coho salmon by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry,  担当ページ: 223-234

  • Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry for Metabolomics

    Ramautar R. Ed., (Hirayama A, Soga T. contribution for CHAPTER 7), The Royal Society of Chemistry, 2018年07月,  ページ数: 300

    担当範囲: CHAPTER 7: CE-MS for anionic and cationic metabolic profiling: system optimization and applications,  担当ページ: 134-160

  • ONCO-METABOLOMICS; A NEW CLUE TO UNDERSTAND CARCINOGENESIS, CANCER BIOLOGY AND TO DEVELOP NOVEL DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS

    Esmi, H., Mak, T.W., Soga, T., Suematsu, M.,Mori, M. Ed, Princess Takamatsu Cancer Research Fund, 2016年04月

  • Metabolomics: Methods and Protocols

    Bjerrum, J. T. Ed. (Wakayama, M., Hirayama, A., Soga, T., contribution for Chapter 13), Humana Press, 2015年04月,  ページ数: 269

    担当範囲: Chapter 13: Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ: 113-122

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    Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has proven to be useful for metabolomics studies. Charged metabolites are first separated by CE based on charge and size and are subsequently selectively detected using MS. The major advantages of CE-MS are its high resolution and the fact that almost any charged species can be analyzed by two methods, both cationic and anionic. This technique can readily be applied to various types of biological samples originating from bacteria, plants, mammals, and body fluids. This chapter highlights detailed practical procedures for using this technology.

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論文 【 表示 / 非表示

  • Methionine restriction breaks obligatory coupling of cell proliferation and death by an oncogene Src in Drosophila

    Nishida, H., Okada, M., Yang, L., Takano, T., Tabata, S., Soga, T., Ho, D.M., Chung, J., Minami, Y., Yoo, S.K.

    eLife  10   e59809 2021年04月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

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    Oncogenes often promote cell death as well as proliferation. How oncogenes drive these diametrically opposed phenomena remains to be solved. A key question is whether cell death occurs as a response to aberrant proliferation signals or through a proliferation-independent mechanism. Here, we reveal that Src, the first identified oncogene, simultaneously drives cell proliferation and death in an obligatorily coupled manner through parallel MAPK pathways. The two MAPK pathways diverge from a lynchpin protein Slpr. A MAPK p38 drives proliferation whereas another MAPK JNK drives apoptosis independently of proliferation signals. Src-p38-induced proliferation is regulated by methionine-mediated Tor signaling. Reduction of dietary methionine uncouples the obligatory coupling of cell proliferation and death, suppressing tumorigenesis and tumor-induced lethality. Our findings provide an insight into how cells evolved to have a fail-safe mechanism that thwarts tumorigenesis by the oncogene Src. We also exemplify a diet-based approach to circumvent oncogenesis by exploiting the fail-safe mechanism.

  • Reliability of urinary charged metabolite concentrations in a large-scale cohort study using capillary electrophoresis-mass spectrometry

    Ishibashi Y., Harada S., Takeuchi A., Iida M., Kurihara A., Kato S., Kuwabara K., Hirata A., Shibuki T., Okamura T., Sugiyama D., Sato A., Amano K., Hirayama A., Sugimoto M., Soga T., Tomita M., Takebayashi T.

    Sci. Rep  11 ( 1 ) 7407 2021年04月

    研究論文(学術雑誌), 査読有り

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    Currently, large-scale cohort studies for metabolome analysis have been launched globally. However, only a few studies have evaluated the reliability of urinary metabolome analysis. This study aimed to establish the reliability of urinary metabolomic profiling in cohort studies. In the Tsuruoka Metabolomics Cohort Study, 123 charged metabolites were identified and routinely quantified using capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS). We evaluated approximately 750 quality control (QC) samples and 6,720 participants’ spot urine samples. We calculated inter- and intra-batch coefficients of variation in the QC and participant samples and technical intraclass correlation coefficients (ICC). A correlation of metabolite concentrations between spot and 24-h urine samples obtained from 32 sub-cohort participants was also evaluated. The coefficient of variation (CV) was less than 20% for 87 metabolites (70.7%) and 20–30% for 19 metabolites (15.4%) in the QC samples. There was less than 20% inter-batch CV for 106 metabolites (86.2%). Most urinary metabolites would have reliability for measurement. The 96 metabolites (78.0%) was above 0.75 for the estimated ICC, and those might be useful for epidemiological analysis. Among individuals, the Pearson correlation coefficient of 24-h and spot urine was more than 70% for 59 of the 99 metabolites. These results show that the profiling of charged metabolites using CE-MS in morning spot human urine is suitable for epidemiological metabolomics studies.

  • Metabolomic analysis of small extracellular vesicles derived from pancreatic cancer cells cultured under normoxia and hypoxia

    Hayasaka R., Tabata S., Hasebe M., Ikeda S., Ohnuma S., Mori M., Soga T., Tomita M., Hirayama A.

    Metabolites 11 ( 4 ) 215 2021年04月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

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    Extracellular vesicles (EVs) released from cancer cells contribute to various malignant phenotypes of cancer, including metastasis, cachexia, and angiogenesis. Although DNA, mRNAs, miRNAs, and proteins contained in EVs have been extensively studied, the function of metabolites in EVs remains unclear. In this study, we performed a comprehensive metabolomic analysis of pancreatic cancer cells, PANC-1, cultured under different oxygen concentrations, and small EVs (sEVs) released from them, considering the fact that hypoxia contributes to the malignant behavior of cells in pancreatic cancer, which is a poorly diagnosed cancer. sEVs were collected by ultracen-trifugation, and hydrophilic metabolites were analyzed using capillary ion chromatography-mass spectrometry and liquid chromatography-mass spectrometry, and lipids were analyzed by supercrit-ical fluid chromatography-tandem mass spectrometry. A total of 140 hydrophilic metabolites and 494 lipids were detected in sEVs, and their profiles were different from those in cells. In addition, the metabolomic profile of sEVs was observed to change under hypoxic stress, and an increase in metabolites involved in angiogenesis was also detected. We reveal the hallmark of the metabolites contained in sEVs and the effect of tumor hypoxia on their profiles, which may help in understanding EV-mediated cancer malignancy.

  • Cardiac Mitofusin-1 is Reduced in Non-responding Patients with Idiopathic Dilated Cardiomyopathy

    Hsiao, Y.T., Shimizu, I., Wakasugi, T., Yoshida, Y., Ikegami, R., Hayashi, Y., Suda, M., Katsuumi, G., Nakao, M., Ozawa, T., Izumi, D., Kashimura, T., Ozaki, K., Soga, T., Minamino, T.

    Sci. Rep 11 ( 1 ) 6722 2021年03月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

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    Prognosis of severe heart failure remains poor. Urgent new therapies are required. Some heart failure patients do not respond to established multidisciplinary treatment and are classified as "non-responders". The outcome is especially poor for non-responders, and underlying mechanisms are largely unknown. Mitofusin-1 (Mfn1), a mitochondrial fusion protein, is significantly reduced in non-responding patients. This study aimed to elucidate the role of Mfn1 in the failing heart. Twenty-two idiopathic dilated cardiomyopathy (IDCM) patients who underwent endomyocardial biopsy of intraventricular septum were included. Of the 22 patients, 8 were non-responders (left ventricular (LV) ejection fraction (LVEF) of < 10% improvement at late phase follow-up). Electron microscopy (EM), quantitative PCR, and immunofluorescence studies were performed to explore the biological processes and molecules involved in failure to respond. Studies in cardiac specific Mfn1 knockout mice (c-Mfn1 KO), and in vitro studies with neonatal rat ventricular myocytes (NRVMs) were also conducted. A significant reduction in mitochondrial size in cardiomyocytes, and Mfn1, was observed in non-responders. A LV pressure overload with thoracic aortic constriction (TAC) c-Mfn1 KO mouse model was generated. Systolic function was reduced in c-Mfn1 KO mice, while mitochondria alteration in TAC c-Mfn1 KO mice increased. In vitro studies in NRVMs indicated negative regulation of Mfn1 by the β-AR/cAMP/PKA/miR-140-5p pathway resulting in significant reduction in mitochondrial respiration of NRVMs. The level of miR140-5p was increased in cardiac tissues of non-responders. Mfn1 is a biomarker of heart failure in non-responders. Therapies targeting mitochondrial dynamics and homeostasis are next generation therapy for non-responding heart failure patients.

  • Trans-Omic Analysis Reveals Obesity-Associated Dysregulation of Inter-Organ Metabolomic Cycles between the Liver and Skeletal Muscle

    Egami, R., Kokaji, T., Hatano, A., Yugi, K., Eto, M., Morita, K., Ohno, S., Fujii, M., Hironaka, K., Uematsu, S., Terakawa, A., Bai, Y., Pan, Y., Tsuchiya, T., Ozaki, H., Inoue, H., Uda, S., Kubota, H., Suzuki, Y., Matsumoto, M., Nakayama, K., Hirayama, A., Soga, T., Kuroda, S.

    iScience  24 ( 3 ) 102217 2021年03月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

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    Systemic metabolic homeostasis is regulated by inter-organ metabolic cycles involving multiple organs. Obesity impairs inter-organ metabolic cycles, resulting in metabolic diseases. The systemic landscape of dysregulated inter-organ metabolic cycles in obesity has yet to be explored. Here, we measured the transcriptome, proteome, and metabolome in the liver and skeletal muscle and the metabolome in blood of fasted wild-type and leptin-deficient obese (ob/ob) mice, identifying components with differential abundance and differential regulation in ob/ob mice. By constructing and evaluating the trans-omic network controlling the differences in metabolic reactions between fasted wild-type and ob/ob mice, we provided potential mechanisms of the obesity-associated dysfunctions of metabolic cycles between liver and skeletal muscle involving glucose-alanine, glucose-lactate, and ketone bodies. Our study revealed obesity-associated systemic pathological mechanisms of dysfunction of inter-organ metabolic cycles.

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KOARA(リポジトリ)収録論文等 【 表示 / 非表示

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総説・解説等 【 表示 / 非表示

  • メタボロミクスによるがん幹細胞の代謝研究

    北島正二朗、曽我朋義

    (別冊 医学のあゆみ) 治療標的としてのがん幹細胞 (医歯薬出版株式会社)     117 - 121 2021年03月

    総説・解説(学術雑誌), 共著

  • メタボローム解析に基づく癌診断法の開発

    曽我朋義、杉本昌弘

    消化器・肝臓内科 (科学評論社)  8 ( 2 ) 137 - 143 2020年08月

    共著

  • はじめに-メタボローム解析UPDATE

    曽我朋義

    (別冊・医学のあゆみ) メタボローム解析UPDATE (医歯薬出版株式会社)   2020年06月

    単著

  • メタボロミクスによるがん幹細胞の代謝研究

    北島正二朗、曽我朋義

    医学のあゆみ (医歯薬出版株式会社)  273 ( 5 ) 469 - 473 2020年05月

    総説・解説(学術雑誌), 共著

  • はじめに-メタボローム解析UPDATE

    曽我朋義

    医学のあゆみ (医歯薬出版株式会社)  270 ( 5 ) 377 - - 2019年08月

    総説・解説(学術雑誌)

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研究発表 【 表示 / 非表示

  • Multi Omics analysis of colorectal cancer metabolism

    2018 International Meeting on 22nd MDO and 33rd JSSX (Ishikawa Ongakudo, Kanazawa, Ishikawa) , 2018年10月, 口頭(招待・特別), JSSX (The Japanese Society for the Study of Xenobiotics)、MDO(Microsomes and Drug Oxidations)

  • Malti-omics reveals MYC as a master regulator of colorectal cancer metabolism

    曽我 朋義

    The 1st International Symposium for Trans-Omics (Koshiba Hall, The University of Tokyo, Hongo Campus) , 2017年11月, 口頭(招待・特別)

  • Onco-metabolites and cancer specific metabolic pathways

    SOGA TOMOYOSHI

    American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017, AACR2017, 2017年04月, 口頭(招待・特別)

  • What Causes Altered Metabolism in Colon Cancer Cells

    SOGA TOMOYOSHI

    46th International Symposium of The Princess Takamatsu Cancer Research Found (Palece Hotel Tokyo, Japan) , 2015年11月, 口頭(招待・特別)

  • CE-MS Metabolomics and Application to Cancer cell Metabolism

    SOGA TOMOYOSHI

    11th International Conference of the Metabolomics Society, Metabolomics 2015, (Hyatt Regency San Francisco Airport, Burlingame, California, USA) , 2015年07月, 口頭(招待・特別)

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競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • SUCLA2遺伝子欠失によって生じる代謝脆弱性を標的とする新規がん治療法探索

    2019年08月
    -
    2021年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療創生研究事業(P-CREATE) , 髙橋 智聡, 分担

  • メタボロミクスを用いたフレイル・認知機能低下に対する超早期リスク判別指標の開発

    2018年04月
    -
    2023年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(A), 武林 亨, 補助金,  分担

  • メタボロ-ム解析による膵癌術前化学放射線療法における治療抵抗性の病態解明

    2018年04月
    -
    2021年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 岡野圭一, 分担

  • 全てのヒト骨髄性腫瘍が依存する、新規がん幹細胞維持機構の解明

    2016年04月
    -
    2021年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(S) , 赤司浩一, 基盤研究S, 補助金,  分担

  • メタボロームワイドな代謝プロファイリングに基づく生活習慣病予防の地域コホート研究

    2015年04月
    -
    2018年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(B), 武林 亨, 補助金,  分担

     備考を見る

    基盤Aが採択されたことにより、基盤BについてはH29(2017)年度で終了

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Works 【 表示 / 非表示

  • 経済産業省主催「バイオ人材育成事業」メタボローム実習講師

    曽我 朋義

    2004年12月

    その他, 共同

  • 日経BP社主催バイオファイナンスギルド メタボローム講座

    曽我 朋義

    2004年08月

    その他, 共同

  • キャピラリー電気泳動による無機陰イオン、有機酸、アミノ酸の分析

    曽我朋義

    2001年10月
    -
    継続中

    その他

     発表内容を見る

    キャピラリー電気泳動法の装置、測定法の原理および様々な測定例を解説した

受賞 【 表示 / 非表示

  • 第2回寺部茂賞

    2015年11月, 日本分析化学会 電気泳動分析研究懇談会, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞,  受賞国: 日本

  • 義塾賞

    曽我 朋義, 2011年11月, 慶應義塾大学, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

    受賞区分: 塾内表彰等

  • 第7回酸化ストレスと肝研究会 奨励賞

    曽我 朋義, 2010年11月, 酸化ストレスと肝研究会, メタボロミクスによる新規酸化ストレスマーカーの同定と肝臓疾患スクリーニング

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

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    第7回酸化ストレスと肝研究会における研究発表による

  • 平成21年度全国発明表彰 発明協会会長賞

    曽我 朋義, 2009年07月, 社団法人 発明協会, メタボローム測定装置の発明

    受賞区分: その他の賞

  • 平成19年度科学技術分野の文部科学大臣表彰科学技術賞

    曽我 朋義、冨田 勝, 2007年04月, 文部科学省, メタボローム解析技術に基づくバイオマーカーの探索研究

    受賞区分: その他の賞

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    細胞内に存在する数千種類の代謝物質を一斉に分析する分析技術を世界に先駆けて開発した。代謝物質のほとんどがイオン性を持つことに着目し、イオン性物質に対して高分離能を有するキャピラリー電気泳動(CE)と高選択・高感度検出器である質量分析計(MS)を組み合わせた独創的なものである。数千種類の代謝物質の変化を瞬時に可視化する情報処理技術も開発した。本研究により、急性肝炎時に血中で急増するバイオマーカーと、特定のがん細胞にのみ増加するバイオマーカー候補をすでに発見した。本成果は、バイオマーカーの探索にブレイクスルーをもたらすものであり、医薬分野の進展を促進することが期待される。

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担当授業科目 【 表示 / 非表示

  • 研究会B

    2021年度

  • メタボロミクス

    2021年度

  • メタボローム解析実習

    2021年度

  • 修士研究会

    2021年度

  • 特別研究

    2021年度

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