慶應義塾研究者情報データベース

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• 自分のこれまでの経験では、実験がうまくいってもそこから得られるものは何もありません。失敗して、原因をあれこれ考えることで自分が知らなかった知見を得たり、新しい発見をしたりします。したがって、多くのことに果敢にチェレンジしてたくさんの失敗を重ねて欲しいと思います。失敗が必ず皆さんの糧になります。

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• メタボロミクス、分析化学

経歴 【 表示 ／ 非表示 】

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• 1984年04月

  -

  1992年03月

  横河電機株式会社

• 1992年04月

  -

  2001年03月

  横河アナリティカルシステムズ株式会社

• 2001年04月

  -

  2002年03月

  琉球大学 , 客員教授

• 2001年04月

  -

  2005年03月

  慶應義塾大学環境情報学部/先端生命科学研究所, 助教授（有期）

• 2003年07月

  -

  2010年03月

  ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社, 取締役

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学歴 【 表示 ／ 非表示 】

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• 1980年04月

  -

  1984年03月

  慶應義塾大学, 工学部, 応用化学科

  大学, 卒業

学位 【 表示 ／ 非表示 】

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• 工学博士, 豊橋技術科学大学, 論文, 2000年03月

研究テーマ 【 表示 ／ 非表示 】

研究テーマ 【 表示 ／ 非表示 】

• 枯草菌、大腸菌、酵母等のバクテリアからイネやマウスの組織、ヒトの血液、尿、赤血球、ガン細胞等のあらゆる生物種の細胞内全代謝物質（メタボローム）の測定法, 

  　

著書 【 表示 ／ 非表示 】

著書 【 表示 ／ 非表示 】

• Advances in Microscale Electro-and Liquid Phase-Based Separation Techniques

  El Rassi, Z., Ed. (Soga, T., contribution for Chapter Chapter 9), Elsevier Inc., 2026年03月

  担当範囲: Chapter 9: “Capillary electrophoresis-mass spectrometry”,  担当ページ： pp.279-294

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  Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has gained a great deal of attention as a powerful tool for the analysis of charged compounds. This approach offers high-resolution, high-sensitivity, and wide versatility. Over the past three decades, several CE-MS methods have been developed and have made significant advances in analytical chemistry. In this chapter, the general strategies and principles of CE-MS methods will be discussed, including CE separation modes, interface techniques, mass spectrometry, new techniques to increase the throughput capability of CE-MS analysis, metabolomics, and even single-cell analysis, which has received much attention in recent years. Finally, general conclusions and perspectives are provided.

  • Access to Document (DOI)

• Amino Acid Analysis : Methods and Protocols

  Alterman M.Ed., (Hirayama, A., Ikeda, S., Sato, A., Soga, T., contribution for Chapter 23）, Humana Press, 2019年07月

  担当範囲: Chapter 23: Amino Acid Analysis by Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ： 307-313

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  Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has been developed as a powerful tool in the analysis of charged compounds. To simultaneously analyze free amino acids, an electrolyte with low pH was used to positively charge all of the amino acids. In this condition, all protonated amino acids migrated toward the cathode in CE and then were sensitively and selectively detected by MS. This method is simple, rapid, and selective and could readily be applied to the analysis of free amino acids in various samples. In this chapter, the detailed procedure to analyze amino acids using CE-tandem mass spectrometry (MS/MS) is described.

• Oceanography Challenges to Future Earth : Human and Natural Impacts on our Seas

  Komatsu, T., Ceccaldi, H-J., Yoshida, J., Prouzet, P., Henocque, Y. Ed., (Nakano, T., Shirakawa, H., Yeo, G., Devlin, R.H., Soga, T., contribution for Part IV ), Springer, 2019年02月,  ページ数： 430

  担当範囲: Part IV Innovative Research: Metabolome profiling of growth hormone transgenic coho salmon by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry,  担当ページ： 223-234

• Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry for Metabolomics

  Ramautar R. Ed., (Hirayama A, Soga T. contribution for CHAPTER 7), The Royal Society of Chemistry, 2018年07月,  ページ数： 300

  担当範囲: CHAPTER 7: CE-MS for anionic and cationic metabolic profiling: system optimization and applications,  担当ページ： 134-160

• ONCO-METABOLOMICS; A NEW CLUE TO UNDERSTAND CARCINOGENESIS, CANCER BIOLOGY AND TO DEVELOP NOVEL DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS

  Esmi, H., Mak, T.W., Soga, T., Suematsu, M.,Mori, M. Ed, Princess Takamatsu Cancer Research Fund, 2016年04月

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論文 【 表示 ／ 非表示 】

論文 【 表示 ／ 非表示 】

• Elevated glucose metabolism via the hexosamine biosynthesis pathway: A metabolic signature of high-fluorodeoxyglucose-uptake lung adenocarcinoma

  Watanabe, H., Makinoshima, H., Kanauchi, N., Kabasawa, T., Suzuki, J., Takamori, S., Sasage, T., Abe, K., Hoshijima, K., Uchida, T., Soga, T., Shiono, S.

  Surg. Today 2026年03月

  共著, 査読有り

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  Purpose
  To evaluate hexosamine biosynthetic pathway (HBP) involvement in high-fluorodeoxyglucose (FDG)-uptake lung adenocarcinoma.
  
  Methods
  We conducted metabolomic analysis to evaluate the HBP in patients with lung adenocarcinoma, who underwent preoperative 18-FDG positron emission tomography. Capillary electrophoresis-time-of-flight mass spectrometry was done to obtain 511 small-molecule metabolite spectra, and a principal component analysis was performed.
  
  Results
  We examined 80 tissue samples: 40 tumor-adjacent non-tumor tissue samples and 40 resected lung adenocarcinomas. The principal component analysis confirmed good clustering between the tumor and non-tumor tissues. The non-tumor tissues comprised uniform materials, whereas the tumor tissues comprised a mixture of materials. Heatmaps for 50 metabolites revealed lower glucose and citrate levels and higher levels of lactate, glycolysis metabolites, succinate, fumarate, adenosine di- and -monophosphate, and all essential amino acids in the tumor tissues than the non-tumor tissues. HBP intermediate and uridine diphosphate N-acetylglucosamine levels were also higher in the tumor tissues. Both lactate and HBP intermediate levels were higher in hypermetabolic tumor tissues (standardized uptake value ≥ 3) than in non-hypermetabolic tumor tissues (standardized uptake value < 3). Low-FDG-uptake cells showed strong expression for glucose transporter SLC2A1 and weak expression for O-linked N-acetylglucosamine, whereas high-FDG-uptake cells showed strong expression for both markers.
  
  Conclusions
  Hypermetabolic adenocarcinoma may be associated with intensified glycolysis and HBP activation.

  • Access to Document (DOI)

• Global loss of metabolic responsiveness and elevated enzyme in leptin deficient obese mice during starvation

  Li, D., Morita, K., Kokaji, T., Hatano, A., Hirayama, A., Soga, T., Suzuki, Y., Matsumoto, M., Tsuchiya, T., Ozaki, H., Ohno, S., Inoue, H., Inaba, Y., Sugimoto, H., Pan, Y., Kuroda, S.

  npj Syst. Biol. Appl. online 2026年03月

  研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

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  Starvation induces complex metabolic adaptations in skeletal muscle, a key tissue for maintaining energy homeostasis; however, these adaptations are largely impaired in obesity. How obesity alters global metabolic adaptations to starvation in skeletal muscle remains unclear. Here, we analyzed the metabolic adaptations on a trans-omics scale during starvation in skeletal muscle from wild-type (WT) and leptin-deficient obese (ob/ob) mice. We measured multi-omics data during starvation and constructed global trans-omics networks in WT and ob/ob mice. We found that starvation induces “responsiveness” in WT mice, characterized by increases or decreases in key regulator metabolites, including ATP and AMP, as well as enzyme proteins, leading to global regulation of metabolic pathways, which was lost in ob/ob mice. In contrast, during starvation, ob/ob mice exhibit “difference” in comparison to WT mice, manifested by the persistently elevated expression of metabolic enzymes. These features were similarly found in liver, another key metabolic organ. Thus, global loss of responsiveness and elevated enzyme proteins are systemic features of metabolic dysregulation in ob/ob mice.

  • Access to Document (DOI)

• Guanine nucleotides drive ribosome biogenesis and glycolytic reprogramming in acute myeloid leukemia stem cells

  Kawano, G., Ikeda, R., Ishihara, D., Shima, T., Sakoda, T., Yamamoto, S., Kochi, Y., Semba, Y., Ashitani, S., Mori, Y., Kato K., Maeda, T., Miyamoto, T., Soga, T., Akashi, K., Kikushige, Y.

  Blood 147 （ 7 ） 768 - 782 2026年02月

  研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

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  Therapy resistance in acute myeloid leukemia (AML) remains a major clinical obstacle, particularly due to the persistence of leukemia stem cells (LSCs) capable of metabolic adaptation. While venetoclax (Ven) inhibits oxidative phosphorylation (OXPHOS), we found that Ven-resistant LSCs undergo glycolytic reprogramming to bypass OXPHOS inhibition. This metabolic shift is supported by enhanced ribosome biogenesis, sustained by upregulated de novo guanine nucleotide biosynthesis. Abundant guanine nucleotides suppress the impaired ribosome biogenesis checkpoint (IRBC), leading to TP53 destabilization and persistent MYC expression. Inhibition of inosine monophosphate dehydrogenases (IMPDH1/2) depletes guanine nucleotides, activates IRBC, stabilizes TP53, represses MYC, and impairs the metabolic shift to glycolysis. This metabolic rewiring disrupts LSC stemness and suppresses the reconstitution of human AML cells in xenotransplantation experiments. Notably, the suppression of LSC stemness was observed regardless of Ven resistance or the TP53 mutational status of AML cells. These findings reveal that mutation-independent TP53 inactivation is involved in resistant AML and suggest that targeting guanine nucleotide biosynthesis may offer a clinically actionable strategy to eradicate therapy-resistant LSCs.

  • Access to Document (DOI)

• Cross-sectional associations between CES-D scores and the salivary metabolome in nonclinical adults

  Kubo, Y., Yamauchi, F., Goshima, N., Ohishi, M., Hasegawa, T., Soga, T., Ikeda, M., *Aoki, K.

  Discov. Ment. Heatlh 6 （ 1 ） 15 - 15 2026年01月

  研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

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  Background: Depression represents a major global disease burden. While the Center for Epidemiologic Studies Depression Scale (CES-D) is widely used, it relies on subjective self-reporting. Saliva enables non-invasive metabolite analysis, but existing metabolomics studies have focused on clinical depression using blood or urine, with limited investigation of salivary metabolites in community populations. This study investigated associations between CES-D scores and salivary metabolite concentrations in Tokyo residents. Methods: This cross-sectional study collected CES-D responses and morning saliva samples from Tokyo residents. Salivary metabolites were analyzed using capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry. Statistical analyses included permutational multivariate analysis of variance (PERMANOVA) for overall metabolite-CES-D associations, pathway enrichment analysis using fast gene set enrichment analysis (FGSEA), and principal component analysis, adjusted for age and sex. Results: Analysis included 107 participants (40 males, 67 females; mean age 55.3 ± 14.2 years). PERMANOVA revealed significant association between 112 salivary metabolites and CES-D scores (F = 2.870, p = 0.003), with metabolites explaining 7.7% of depressive symptom variance. Pathway enrichment analysis identified significant alterations in amino acid metabolism (normalized enrichment score =-1.750, q = 0.007). Glycolysis and amine/polyamine metabolism showed trend-level enrichment (both q = 0.066). Principal component analysis revealed significant correlations between CES-D scores and pathway activity for amino acid metabolism (r = 0.216, p = 0.027) and amine/polyamine metabolism (r = 0.216, p = 0.027). Conclusion: This study demonstrates significant associations between salivary metabolite profiles and depressive symptoms in a nonclinical community population, with amino acid metabolism emerging as the most robustly altered pathway. These findings provide preliminary evidence for associations between salivary metabolomic profiles and depressive symptoms in a nonclinical community population.

  • Access to Document (DOI)

• Abrogation of aberrant glycolytic interactions eliminates senescent cells and alleviates aging-related dysfunctions

  Mikawa, T., Kameda, M., Ikari, S., Shibata, E., Liu, S., Miyagawa, S., Ono, K., Ito, T., Yoshizawa, A., Sugimoto, M., Shibuya, S., Shimizu, T., Almunia, J., Ogiso, N., Revêchon, G., Palazzo, A., Bernard, D., Kanda, H., Soga, T., Takubo, K., Morioka, S., Sasaki, J., Sasaki, T., Itamoto, A., Fujii, T., Seno, H., Inagaki, N., Kondoh, H.

  Signal Transduct. Target. Ther.  10 （ 1 ） 402 - 402 2025年12月

  研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り,  ISSN  20959907

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  Cellular senescence is deeply involved in physiological homeostasis, development, tissue repair, aging, and diseases. Senescent cells (SnCs) accumulate in aged tissues and exert deleterious effects by secreting proinflammatory molecules that contribute to chronic inflammation and aging-related diseases. We revealed that an aberrant interaction between glycolytic PGAM1 and Chk1 kinase is augmented in SnCs associated with increased glycolysis, whose byproduct, lactate, promotes this binding in a noncell autonomous manner. The pseudo-Warburg effect of SnCs with enhanced PPP (pentose phosphate pathway) activity is maintained by HIF-2α phosphorylation by Chk1 and subsequent upregulation of glycolytic enzymes, creating a vicious cycle reprogramming the glycolytic pathway in SnCs. HIF-2α also activates FoxM1 expression, which transcriptionally suppresses proapoptotic profiles, including BIM, and upregulates DNA repair machineries in SnCs. FoxM1 thus supports the genomic integrity and survival capacity of SnCs during their glycolytic changes. Chemical abrogation of PGAM1-Chk1 binding reverts these phenotypes and eliminates SnCs through senolysis. Inhibition of the PGAM1-Chk1 interaction improves physiological parameters during aging and inhibits lung fibrosis in mouse models. Our study highlights a novel pathway contributing to the metabolic reprogramming of SnCs and how the use of a new senolytic molecule that targets the PGAM-Chk1 interaction creates a specific vulnerability of those cells to potentially fight age-related diseases.

  • Access to Document (DOI)

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KOARA（リポジトリ）収録論文等 【 表示 ／ 非表示 】

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• メタボロミクスを用いたフレイル・認知機能低下に対する超早期リスク判別指標の開発

  曽我, 朋義

  科学研究費補助金研究成果報告書 2022年

• 癌幹細胞の命運を決定する代謝物質の同定とその機能解析

  曽我, 朋義

  科学研究費補助金研究成果報告書 2022年

• メタボローム (全代謝産物) 測定法の開発とがん検査への応用

  曽我, 朋義

  Keio SFC journal （慶應SFC学会）  22 （ 2 ） 320 - 330 2022年

  ISSN  13472828

• メタボロームワイドな代謝プロファイリングに基づく生活習慣病予防の地域コホート研究

  曽我, 朋義

  科学研究費補助金研究成果報告書 2018年

• Comprehensive analysis of microbes and metabolites in human tear fluids

  曽我, 朋義

  Keio SFC journal （慶應義塾大学湘南藤沢学会）  15 （ 1 ） 382 - 400 2015年

  ISSN  13472828

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総説・解説等 【 表示 ／ 非表示 】

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• メタボロームデータの取得

  曽我朋義

  実験医学別冊 実験デザインからわかる　マルチオミクス研究実践テキスト （羊土社）     86 - 94 2025年03月

  記事・総説・解説・論説等（その他）, 単著

• タボローム測手技術の開発と生命科学における意義

  曽我朋義

  生化学 （日本生化学会）  96 （ 2 ） 222 - 231 2024年04月

  記事・総説・解説・論説等（その他）, 単著

• マルチオミクスによる大腸がんの代謝解析 100年来のがん代謝の謎を解明

  曽我朋義

  化学と工業 （日本化学会）  77 （ 4 ） 268 - 270 2024年04月

  記事・総説・解説・論説等（その他）, 単著

• メタボローム解析からマルチオミクスへの展開―マルチオミクスによるがん代謝解析

  曽我朋義

  実験医学 （羊土社）  41 （ 15 ） 59(2399) - 67(2407) 2023年09月

  記事・総説・解説・論説等（その他）, 単著

• 腫瘍における分岐鎖アミノ酸トランスポーターの役割

  齊藤康弘、曽我朋義

  実験医学 （羊土社）  40 （ 14 ） 2239 - 2244 2022年08月

  記事・総説・解説・論説等（その他）, 共著

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研究発表 【 表示 ／ 非表示 】

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• Development of CE-MS Metabolomics and Its Application in Cancer

  Tomoyoshi Soga

  [国際会議]  AOMS2025, The 10th Asia-Oceania Mass Spectrometry Conference （ANA InterContinental, Ishigaki island, Okinawa） , 

  2025年06月

  , 

  口頭発表（招待・特別）, he Mass Spectrometry Society of Japan

• Development of CE-MS Metabolomics and its Application in Cancer

  Tomoyoshi Soga

  [国際会議]  Metabolomics2024, 20th Annual Confereence of the Metabolomics Society （Osaka） , 

  2024年06月

• Multi Omics analysis of colorectal cancer metabolism

  [国際会議]  2018 International Meeting on 22nd MDO and 33rd JSSX （Ishikawa Ongakudo, Kanazawa, Ishikawa） , 

  2018年10月

  , 

  口頭発表（招待・特別）, JSSX (The Japanese Society for the Study of Xenobiotics)、MDO(Microsomes and Drug Oxidations)

• Malti-omics reveals MYC as a master regulator of colorectal cancer metabolism

  曽我 朋義

  [国際会議]  The 1st International Symposium for Trans-Omics （Koshiba Hall, The University of Tokyo, Hongo Campus） , 

  2017年11月

  , 

  口頭発表（招待・特別）

• Onco-metabolites and cancer specific metabolic pathways

  SOGA TOMOYOSHI

  [国際会議]  American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017, AACR2017, 

  2017年04月

  , 

  口頭発表（招待・特別）

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競争的研究費の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】

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• SUCLA2欠失疾患の治療薬開発と応用

  2024年05月

  -

  2026年03月

  日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療加速化研究事業（P-PROMOTE）, 髙橋　智聡, 受託研究,  研究分担者

• 冬眠・休眠のトランスオミクス解析

  2023年06月

  -

  2026年03月

  文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 学術変革領域研究（A）, 黒田　真也, 補助金,  研究分担者

• 大腸がんにおけるオンコメタボライト・L-2HGの分子基盤の解明

  2022年06月

  -

  2025年03月

  文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業　基盤研究(C), 田畑　祥, その他,  研究分担者

• 時空間トランスオミクスを用いた多細胞・臓器連関代謝制御の解明

  2021年10月

  -

  2026年03月

  国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST),  戦略的創造研究推進事業 CREST, 黒田 真也, 受託研究,  研究分担者

• SUCLA2遺伝子欠失を標的とする進行前立腺がんの新規治療法開発

  2021年05月

  -

  2023年03月

  日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療創生研究事業 , 髙橋 智聡, 受託研究,  研究分担者

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Works 【 表示 ／ 非表示 】

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• 経済産業省主催「バイオ人材育成事業」メタボローム実習講師

  曽我 朋義

  2004年12月

  , 

  その他, 共同

• 日経BP社主催バイオファイナンスギルド　メタボローム講座

  曽我 朋義

  2004年08月

  , 

  その他, 共同

• キャピラリー電気泳動による無機陰イオン、有機酸、アミノ酸の分析

  曽我朋義

  2001年10月

  -

  継続中

  , 

  その他

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  キャピラリー電気泳動法の装置、測定法の原理および様々な測定例を解説した

知的財産権等 【 表示 ／ 非表示 】

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• カテコールアミン類の分析方法

  出願日： 特願平01-272206  1989年10月 

  公開日： 特開平03-134561  1991年06月 

  発行日： 特許第2833058号  1998年10月

  特許権, 単独

• 陰イオン性化合物の分析方法

  出願日： 特願平08-143048  1996年06月 

  公開日： 特開平09-325130  1997年12月 

  発行日： 特許第2912232号  1999年04月

  特許権, 単独

• キャピラリー電気泳動による陰イオン、アミノ酸、糖類の分析方法及び装置

  出願日： 特願平10-145244  1998年05月 

  公開日： 特開平11-337524  1999年12月 

  発行日： 特許第3038184号  2000年02月

  特許権, 単独

• 陰イオン性化合物の分離分析方法及び装置

  出願日： 特願2001-224341  2001年07月 

  公開日： 特開2003-035698  2003年02月 

  発行日： 特許第3341765号  2002年08月

  特許権, 単独

• 電気泳動測定によるイオン性化合物の移動時間予想方法

  出願日： 特願2004-245728  2004年08月 

  公開日： 特開2006-064472  2006年03月 

  発行日： 特許第3871689号  2006年10月

  特許権, 共同

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受賞 【 表示 ／ 非表示 】

受賞 【 表示 ／ 非表示 】

• 福澤賞

  曽我 朋義, 2022年11月, 慶應義塾, メタボローム（細胞内全代謝物質）解析技術の開発と実用化

  受賞区分： 塾内表彰等

• 第2回寺部茂賞

  2015年11月, 日本分析化学会 電気泳動分析研究懇談会, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

  受賞区分： 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

• 義塾賞

  曽我 朋義, 2011年11月, 慶應義塾大学, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

  受賞区分： 塾内表彰等

• 第7回酸化ストレスと肝研究会　奨励賞

  曽我 朋義, 2010年11月, 酸化ストレスと肝研究会, メタボロミクスによる新規酸化ストレスマーカーの同定と肝臓疾患スクリーニング

  受賞区分： 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

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  第7回酸化ストレスと肝研究会における研究発表による

• 平成21年度全国発明表彰　発明協会会長賞

  曽我 朋義, 2009年07月, 社団法人　発明協会, メタボローム測定装置の発明

  受賞区分： その他

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担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

• 研究会Ｂ

  2024年度

• メタボロミクス

  2024年度

• メタボローム解析実習

  2024年度

• 修士研究会

  2024年度

• 特別研究

  2024年度

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