曽我　朋義 (ソガ　トモヨシ)

Soga, Tomoyoshi

写真a

所属（所属キャンパス）

政策・メディア研究科 （湘南藤沢）

職名

教授

HP

外部リンク
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教員からのメッセージ 【 表示 ／ 非表示 】

  • 自分のこれまでの経験では、実験がうまくいってもそこから得られるものは何もありません。失敗して、原因をあれこれ考えることで自分が知らなかった知見を得たり、新しい発見をしたりします。したがって、多くのことに果敢にチェレンジしてたくさんの失敗を重ねて欲しいと思います。失敗が必ず皆さんの糧になります。

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その他公開情報 【 表示 ／ 非表示 】

  • メタボロミクス、分析化学

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経歴 【 表示 ／ 非表示 】

  • 1984年04月
    -
    1992年03月

    横河電機株式会社

  • 1992年04月
    -
    2001年03月

    横河アナリティカルシステムズ株式会社

  • 2001年04月
    -
    2002年03月

    琉球大学 , 客員教授

  • 2001年04月
    -
    2005年03月

    慶應義塾大学環境情報学部/先端生命科学研究所, 助教授（有期）

  • 2003年07月
    -
    2010年03月

    ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社, 取締役

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学歴 【 表示 ／ 非表示 】

  • 1980年04月
    -
    1984年03月

    慶應義塾大学, 工学部, 応用化学科

    大学, 卒業

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学位 【 表示 ／ 非表示 】

  • 工学博士, 豊橋技術科学大学, 論文, 2000年03月

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研究テーマ 【 表示 ／ 非表示 】

  • 枯草菌、大腸菌、酵母等のバクテリアからイネやマウスの組織、ヒトの血液、尿、赤血球、ガン細胞等のあらゆる生物種の細胞内全代謝物質（メタボローム）の測定法, 

    　

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著書 【 表示 ／ 非表示 】

  • Amino Acid Analysis : Methods and Protocols

    Alterman M.Ed., (Hirayama, A., Ikeda, S., Sato, A., Soga, T., contribution for Chapter 23）, Humana Press, 2019年07月

    担当範囲: Chapter 23: Amino Acid Analysis by Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ： 307-313

    　概要を見る

    Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has been developed as a powerful tool in the analysis of charged compounds. To simultaneously analyze free amino acids, an electrolyte with low pH was used to positively charge all of the amino acids. In this condition, all protonated amino acids migrated toward the cathode in CE and then were sensitively and selectively detected by MS. This method is simple, rapid, and selective and could readily be applied to the analysis of free amino acids in various samples. In this chapter, the detailed procedure to analyze amino acids using CE-tandem mass spectrometry (MS/MS) is described.

  • Oceanography Challenges to Future Earth : Human and Natural Impacts on our Seas

    Komatsu, T., Ceccaldi, H-J., Yoshida, J., Prouzet, P., Henocque, Y. Ed., (Nakano, T., Shirakawa, H., Yeo, G., Devlin, R.H., Soga, T., contribution for Part IV ), Springer, 2019年02月,  ページ数： 430

    担当範囲: Part IV Innovative Research: Metabolome profiling of growth hormone transgenic coho salmon by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry,  担当ページ： 223-234

  • Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry for Metabolomics

    Ramautar R. Ed., (Hirayama A, Soga T. contribution for CHAPTER 7), The Royal Society of Chemistry, 2018年07月,  ページ数： 300

    担当範囲: CHAPTER 7: CE-MS for anionic and cationic metabolic profiling: system optimization and applications,  担当ページ： 134-160

  • ONCO-METABOLOMICS; A NEW CLUE TO UNDERSTAND CARCINOGENESIS, CANCER BIOLOGY AND TO DEVELOP NOVEL DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS

    Esmi, H., Mak, T.W., Soga, T., Suematsu, M.,Mori, M. Ed, Princess Takamatsu Cancer Research Fund, 2016年04月

  • Metabolomics: Methods and Protocols

    Bjerrum, J. T. Ed. (Wakayama, M., Hirayama, A., Soga, T., contribution for Chapter 13), Humana Press, 2015年04月,  ページ数： 269

    担当範囲: Chapter 13: Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ： 113-122

    　概要を見る

    Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has proven to be useful for metabolomics studies. Charged metabolites are first separated by CE based on charge and size and are subsequently selectively detected using MS. The major advantages of CE-MS are its high resolution and the fact that almost any charged species can be analyzed by two methods, both cationic and anionic. This technique can readily be applied to various types of biological samples originating from bacteria, plants, mammals, and body fluids. This chapter highlights detailed practical procedures for using this technology.

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論文 【 表示 ／ 非表示 】

  • Human acute leukemia uses branched-chain amino acid catabolism to maintain stemness through regulating PRC2 function

    Kikushige, Y., Miyamoto, T., Kochi, Y., Semba, Y., Ohishi, M., Irifune, H., Hatakeyama, K., Kunisaki, Y., Sugio, T., Sakoda, T., Miyawaki, K., Kato, K., Soga, T., Akashi, K.

    Blood Adv.  7   3592 - 3603 2023年07月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

    　概要を見る

    Cancer-specific metabolic activities play a crucial role in the pathogenesis of human malignancies. To investigate human acute leukemia-specific metabolic properties, we comprehensively measured the cellular metabolites within the CD34+ fraction of normal hematopoietic stem progenitor cells (HSPCs), primary human acute myelogenous leukemia (AML), and acute lymphoblastic leukemia (ALL) cells. Here, we show that human leukemia cells are addicted to the branched-chain amino acid (BCAA) metabolism to maintain their stemness, irrespective of myeloid or lymphoid types. Human primary acute leukemias had BCAA transporters for BCAA uptake, cellular BCAA, α-ketoglutarate (α-KG), and cytoplasmic BCAA transaminase-1 (BCAT1) at significantly higher levels than control HSPCs. Isotope-tracing experiments showed that in primary leukemia cells, BCAT1 actively catabolizes BCAA using α-KG into branched-chain α-ketoacids, whose metabolic processes provide leukemia cells with critical substrates for the trichloroacetic acid cycle and the synthesis of nonessential amino acids, both of which reproduce α-KG to maintain its cellular level. In xenogeneic transplantation experiments, deprivation of BCAA from daily diet strongly inhibited expansion, engraftment and self-renewal of human acute leukemia cells. Inhibition of BCAA catabolism in primary AML or ALL cells specifically inactivates the function of the polycomb repressive complex 2, an epigenetic regulator for stem cell signatures, by inhibiting the transcription of PRC components, such as zeste homolog 2 and embryonic ectoderm development. Accordingly, BCAA catabolism plays an important role in the maintenance of stemness in primary human AML and ALL, and molecules related to the BCAA metabolism pathway should be critical targets for acute leukemia treatment.

  • Convergent genomic diversity and novel BCAA metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma

    Kitagawa, A., Osawa, T., Noda, M., Kobayashi, Y., Aki, S., Nakano, Y., Saito, T., Shimizu, D., Komatsu, H., Sugaya, M., Takahashi, J., Kosai, K., Takao, S., Motomura, Y., Sato, K., Hu, Q., Fujii, A., Wakiyama, H., Tobo, T., Uchida, H., Sugimachi, K., Shibata, K., Utsunomiya, T., Kobayashi, S., Ishii, H., Hasegawa, T., Masuda, T., Matsui, Y., Niida, A., Soga, T., Suzuki, Y., Miyano, S., Aburatani, H., Doki, Y., Eguchi, H., Mori, M., Nakayama, K., Shimamura, T., Shibata, T., Mimori, K.

    Br. J. Cancer 128 （ 12 ） 2206 - 2217 2023年06月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り,  ISSN  00070920

    　概要を見る

    Background: Driver alterations may represent novel candidates for driver gene-guided therapy; however, intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) with multiple genomic aberrations makes them intractable. Therefore, the pathogenesis and metabolic changes of ICC need to be understood to develop new treatment strategies. We aimed to unravel the evolution of ICC and identify ICC-specific metabolic characteristics to investigate the metabolic pathway associated with ICC development using multiregional sampling to encompass the intra- and inter-tumoral heterogeneity.

    Methods: We performed the genomic, transcriptomic, proteomic and metabolomic analysis of 39-77 ICC tumour samples and eleven normal samples. Further, we analysed their cell proliferation and viability.

    Results: We demonstrated that intra-tumoral heterogeneity of ICCs with distinct driver genes per case exhibited neutral evolution, regardless of their tumour stage. Upregulation of BCAT1 and BCAT2 indicated the involvement of 'Val Leu Ile degradation pathway'. ICCs exhibit the accumulation of ubiquitous metabolites, such as branched-chain amino acids including valine, leucine, and isoleucine, to negatively affect cancer prognosis. We revealed that this metabolic pathway was almost ubiquitously altered in all cases with genomic diversity and might play important roles in tumour progression and overall survival.

    Conclusions: We propose a novel ICC onco-metabolic pathway that could enable the development of new therapeutic interventions.

  • Tumor-infiltrating Leukocyte Profiling Defines Three Immune Subtypes of NSCLC with Distinct Signaling Pathways and Genetic Alterations

    Aoki, K., Nishito, Y., Motoi, N., Arai, Y., Hiraoka, N., Shibata, T., Sonobe, Y., Kayukawa, Y., Hashimoto, E., Takahashi, M., Fujii, E., Nishizawa, T., Fukuda, H., Ohashi, K., Arai, K., Mizoguchi, Y., Yoshida, Y., Watanabe, S., Yamashita, M., Kitano, S., Sakamoto, H., Nagata, A., Mitsumori, R., Ozaki, K., Niida, S., Kanai, Y., Hirayama, A., Soga, T., Maruyama, T., Tsukada, K., Yabuki, N., Shimada, M., Kitazawa, T., Natori, O., Sawada, N., Kato, A., Yoshida, T., Yasuda, K., Mizuno, H., Tsunoda, H., Ochiai, A.

    Cancer Res. Commun. 3   6 - 1026-1040 2023年06月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

    　概要を見る

    Resistance to immune checkpoint blockade remains challenging in patients with non-small cell lung cancer (NSCLC). Tumor-infiltrating leukocyte (TIL) quantity, composition, and activation status profoundly influence responsiveness to cancer immunotherapy. This study examined the immune landscape in the NSCLC tumor microenvironment by analyzing TIL profiles of 281 fresh resected NSCLC tissues. Unsupervised clustering based on numbers and percentages of 30 TIL types classified adenocarcinoma (LUAD) and squamous cell carcinoma (LUSQ) into the cold, myeloid cell-dominant, and CD8+ T cell-dominant subtypes. These were significantly correlated with patient prognosis; the myeloid cell subtype had worse outcomes than the others. Integrated genomic and transcriptomic analyses, including RNA sequencing, whole-exome sequencing, T-cell receptor repertoire, and metabolomics of tumor tissue, revealed that immune reaction-related signaling pathways were inactivated, while the glycolysis and K-ras signaling pathways activated in LUAD and LUSQ myeloid cell subtypes. Cases with ALK and ROS1 fusion genes were enriched in the LUAD myeloid subtype, and the frequency of TERT copy-number variations was higher in LUSQ myeloid subtype than in the others. These classifications of NSCLC based on TIL status may be useful for developing personalized immune therapies for NSCLC.

    Significance: The precise TIL profiling classified NSCLC into novel three immune subtypes that correlates with patient outcome, identifying subtype-specific molecular pathways and genomic alterations that should play important roles in constructing subtype-specific immune tumor microenvironments. These classifications of NSCLC based on TIL status are useful for developing personalized immune therapies for NSCLC.

  • Tumor cell-derived spermidine is an oncometabolite that suppress TCR clustering for intratumoral CD8+ T cell activation

    Hibino, S., Eto, S., Hangai, S., Endo, K., Ashitani, S., Sugaya, M., Osawa, T., Soga, T., Taniguchi, T., Yanai, H.

    Proc. Natl. Acad. Sci. USA 120 （ 24 ） 245120 - 245120 2023年06月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

    　概要を見る

    The activation and expansion of T cells that recognize cancer cells is an essential aspect to antitumor immunity. Tumors may escape destruction by the immune system through ectopic expression of inhibitory immune ligands typically exemplified by the PD-L1/PD-1 pathway. Here, we reveal another facet of tumor evasion from T cell surveillance. By secretome profiling of necrotic tumor cells, we identified an oncometabolite spermidine as a unique inhibitor of T cell receptor (TCR) signaling. Mechanistically, spermidine causes the downregulation of the plasma membrane cholesterol levels, resulting in the suppression of TCR clustering. Using syngeneic mouse models, we show that spermidine is abundantly detected in the tumor immune microenvironment (TIME) and that administration of the polyamine synthesis inhibitor effectively enhanced CD8+ T cell–dependent antitumor responses. Further, the combination of the polyamine synthesis inhibitor with anti-PD-1 immune checkpoint antibody resulted in a much stronger antitumor immune response. This study reveals an aspect of immunosuppressive TIME, wherein spermidine functions as a metabolic T cell checkpoint that may offer a unique approach for promoting tumor immunotherapy.

  • Quality Control of Targeted Plasma Lipids in a Large-Scale Cohort Study Using Liquid Chromatography–Tandem Mass Spectrometry

    Hirayama, A., Ishikawa, T., Takahashi, H., Yamanaka, S., Ikeda, S., Hirata, A., Harada, S., Sugimoto, M., Soga, T., Tomita, M., Takebayashi, T.

    Metabolites 13 （ 4 ） 558 - 558 2023年04月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

    　概要を見る

    High-throughput metabolomics has enabled the development of large-scale cohort studies. Long-term studies require multiple batch-based measurements, which require sophisticated quality control (QC) to eliminate unexpected bias to obtain biologically meaningful quantified metabolomic profiles. Liquid chromatography–mass spectrometry was used to analyze 10,833 samples in 279 batch measurements. The quantified profile included 147 lipids including acylcarnitine, fatty acids, glucosylceramide, lactosylceramide, lysophosphatidic acid, and progesterone. Each batch included 40 samples, and 5 QC samples were measured for 10 samples of each. The quantified data from the QC samples were used to normalize the quantified profiles of the sample data. The intra- and inter-batch median coefficients of variation (CV) among the 147 lipids were 44.3% and 20.8%, respectively. After normalization, the CV values decreased by 42.0% and 14.7%, respectively. The effect of this normalization on the subsequent analyses was also evaluated. The demonstrated analyses will contribute to obtaining unbiased, quantified data for large-scale metabolomics.

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KOARA（リポジトリ）収録論文等 【 表示 ／ 非表示 】

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総説・解説等 【 表示 ／ 非表示 】

  • 腫瘍における分岐鎖アミノ酸トランスポーターの役割

    齊藤康弘、曽我朋義

    実験医学 (羊土社)  40 ( 14 ) 2239 - 2244 2022年08月

    記事・総説・解説・論説等（その他）, 共著

  • アミノ酸トランスポーターを標的とした個別化医療

    Precision Medicine 4 ( 13 ) 18 - 22 2021年11月

    記事・総説・解説・論説等（その他）, 共著

  • メタボロミクスによるがん幹細胞の代謝研究

    北島正二朗、曽我朋義

    （別冊 医学のあゆみ）　治療標的としてのがん幹細胞 (医歯薬出版株式会社)     117 - 121 2021年03月

    記事・総説・解説・論説等（その他）, 共著

  • メタボローム解析に基づく癌診断法の開発

    曽我朋義、杉本昌弘

    消化器・肝臓内科 (科学評論社)  8 ( 2 ) 137 - 143 2020年08月

    共著

  • はじめに-メタボローム解析UPDATE

    曽我朋義

    （別冊・医学のあゆみ） メタボローム解析UPDATE (医歯薬出版株式会社)   2020年06月

    単著

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研究発表 【 表示 ／ 非表示 】

  • Multi Omics analysis of colorectal cancer metabolism

    2018 International Meeting on 22nd MDO and 33rd JSSX (Ishikawa Ongakudo, Kanazawa, Ishikawa) , 

    2018年10月
    , 

    口頭発表（招待・特別）, JSSX (The Japanese Society for the Study of Xenobiotics)、MDO(Microsomes and Drug Oxidations)

  • Malti-omics reveals MYC as a master regulator of colorectal cancer metabolism

    曽我 朋義

    The 1st International Symposium for Trans-Omics (Koshiba Hall, The University of Tokyo, Hongo Campus) , 

    2017年11月
    , 

    口頭発表（招待・特別）

  • Onco-metabolites and cancer specific metabolic pathways

    SOGA TOMOYOSHI

    American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017, AACR2017, 

    2017年04月
    , 

    口頭発表（招待・特別）

  • What Causes Altered Metabolism in Colon Cancer Cells

    SOGA TOMOYOSHI

    46th International Symposium of The Princess Takamatsu Cancer Research Found (Palece Hotel Tokyo, Japan) , 

    2015年11月
    , 

    口頭発表（招待・特別）

  • CE-MS Metabolomics and Application to Cancer cell Metabolism

    SOGA TOMOYOSHI

    11th International Conference of the Metabolomics Society, Metabolomics 2015, (Hyatt Regency San Francisco Airport, Burlingame, California, USA) , 

    2015年07月
    , 

    口頭発表（招待・特別）

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競争的研究費の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】

  • 時空間トランスオミクスを用いた多細胞・臓器連関代謝制御の解明

    2021年10月
    -
    2024年03月

    国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST),  戦略的創造研究推進事業 CREST, 黒田 真也, 受託研究,  研究分担者

  • SUCLA2遺伝子欠失を標的とする進行前立腺がんの新規治療法開発

    2021年05月
    -
    2022年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療創生研究事業 , 髙橋 智聡, 受託研究,  研究分担者

  • ミトコンドリア先制医療

    2021年04月
    -
    2024年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), ムーショット型研究開発事業, 阿部 高明, 受託研究,  研究分担者

  • SUCLA2遺伝子欠失によって生じる代謝脆弱性を標的とする新規がん治療法探索

    2019年08月
    -
    2021年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） , 髙橋 智聡, 受託研究,  研究分担者

  • メタボロミクスを用いたフレイル・認知機能低下に対する超早期リスク判別指標の開発

    2018年04月
    -
    2023年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(A), 武林　亨, 補助金,  研究分担者

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Works 【 表示 ／ 非表示 】

  • 経済産業省主催「バイオ人材育成事業」メタボローム実習講師

    曽我 朋義

    2004年12月
    , 

    その他, 共同

  • 日経BP社主催バイオファイナンスギルド　メタボローム講座

    曽我 朋義

    2004年08月
    , 

    その他, 共同

  • キャピラリー電気泳動による無機陰イオン、有機酸、アミノ酸の分析

    曽我朋義

    2001年10月
    -
    継続中
    , 

    その他

    　発表内容を見る

    キャピラリー電気泳動法の装置、測定法の原理および様々な測定例を解説した

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知的財産権等 【 表示 ／ 非表示 】

  • カテコールアミン類の分析方法

    出願日： 特願平01-272206  1989年10月 

    公開日： 特開平03-134561  1991年06月 

    発行日： 特許第2833058号  1998年10月

    特許権, 単独

  • 陰イオン性化合物の分析方法

    出願日： 特願平08-143048  1996年06月 

    公開日： 特開平09-325130  1997年12月 

    発行日： 特許第2912232号  1999年04月

    特許権, 単独

  • キャピラリー電気泳動による陰イオン、アミノ酸、糖類の分析方法及び装置

    出願日： 特願平10-145244  1998年05月 

    公開日： 特開平11-337524  1999年12月 

    発行日： 特許第3038184号  2000年02月

    特許権, 単独

  • 陰イオン性化合物の分離分析方法及び装置

    出願日： 特願2001-224341  2001年07月 

    公開日： 特開2003-035698  2003年02月 

    発行日： 特許第3341765号  2002年08月

    特許権, 単独

  • 電気泳動測定によるイオン性化合物の移動時間予想方法

    出願日： 特願2004-245728  2004年08月 

    公開日： 特開2006-064472  2006年03月 

    発行日： 特許第3871689号  2006年10月

    特許権, 共同

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受賞 【 表示 ／ 非表示 】

  • 福澤賞

    曽我 朋義, 2022年11月, 慶應義塾, メタボローム（細胞内全代謝物質）解析技術の開発と実用化

    受賞区分： 塾内表彰等

  • 第2回寺部茂賞

    2015年11月, 日本分析化学会 電気泳動分析研究懇談会, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

    受賞区分： 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 義塾賞

    曽我 朋義, 2011年11月, 慶應義塾大学, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

    受賞区分： 塾内表彰等

  • 第7回酸化ストレスと肝研究会　奨励賞

    曽我 朋義, 2010年11月, 酸化ストレスと肝研究会, メタボロミクスによる新規酸化ストレスマーカーの同定と肝臓疾患スクリーニング

    受賞区分： 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

    　説明を見る

    第7回酸化ストレスと肝研究会における研究発表による

  • 平成21年度全国発明表彰　発明協会会長賞

    曽我 朋義, 2009年07月, 社団法人　発明協会, メタボローム測定装置の発明

    受賞区分： その他

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担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

  • 研究会Ｂ

    2023年度

  • メタボロミクス

    2023年度

  • メタボローム解析実習

    2023年度

  • 修士研究会

    2023年度

  • 特別研究

    2023年度

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