曽我　朋義 (ソガ　トモヨシ)

Soga, Tomoyoshi

写真a

所属（所属キャンパス）

政策・メディア研究科 （湘南藤沢）

職名

教授

HP

外部リンク
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教員からのメッセージ 【 表示 ／ 非表示 】

  • 自分のこれまでの経験では、実験がうまくいってもそこから得られるものは何もありません。失敗して、原因をあれこれ考えることで自分が知らなかった知見を得たり、新しい発見をしたりします。したがって、多くのことに果敢にチェレンジしてたくさんの失敗を重ねて欲しいと思います。失敗が必ず皆さんの糧になります。

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経歴 【 表示 ／ 非表示 】

  • 1984年04月
    -
    1992年03月

    横河電機株式会社

  • 1992年04月
    -
    2001年03月

    横河アナリティカルシステムズ株式会社

  • 2001年04月
    -
    2002年03月

    琉球大学 , 客員教授

  • 2001年04月
    -
    2005年03月

    慶應義塾大学環境情報学部/先端生命科学研究所, 助教授（有期）

  • 2003年07月
    -
    2010年03月

    ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社, 取締役

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学歴 【 表示 ／ 非表示 】

  • 1980年04月
    -
    1984年03月

    慶應義塾大学, 工学部, 応用化学科

    大学, 卒業

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学位 【 表示 ／ 非表示 】

  • 工学博士, 豊橋技術科学大学, 論文, 2000年03月

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研究テーマ 【 表示 ／ 非表示 】

  • 枯草菌、大腸菌、酵母等のバクテリアからイネやマウスの組織、ヒトの血液、尿、赤血球、ガン細胞等のあらゆる生物種の細胞内全代謝物質（メタボローム）の測定法, 

    　

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著書 【 表示 ／ 非表示 】

  • Amino Acid Analysis : Methods and Protocols

    Alterman M.Ed., (Hirayama, A., Ikeda, S., Sato, A., Soga, T., contribution for Chapter 23）, Humana Press, 2019年07月

    担当範囲: Chapter 23: Amino Acid Analysis by Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ： 307-313

    　概要を見る

    Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has been developed as a powerful tool in the analysis of charged compounds. To simultaneously analyze free amino acids, an electrolyte with low pH was used to positively charge all of the amino acids. In this condition, all protonated amino acids migrated toward the cathode in CE and then were sensitively and selectively detected by MS. This method is simple, rapid, and selective and could readily be applied to the analysis of free amino acids in various samples. In this chapter, the detailed procedure to analyze amino acids using CE-tandem mass spectrometry (MS/MS) is described.

  • Oceanography Challenges to Future Earth : Human and Natural Impacts on our Seas

    Komatsu, T., Ceccaldi, H-J., Yoshida, J., Prouzet, P., Henocque, Y. Ed., (Nakano, T., Shirakawa, H., Yeo, G., Devlin, R.H., Soga, T., contribution for Part IV ), Springer, 2019年02月,  ページ数： 430

    担当範囲: Part IV Innovative Research: Metabolome profiling of growth hormone transgenic coho salmon by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry,  担当ページ： 223-234

  • Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry for Metabolomics

    Ramautar R. Ed., (Hirayama A, Soga T. contribution for CHAPTER 7), The Royal Society of Chemistry, 2018年07月,  ページ数： 300

    担当範囲: CHAPTER 7: CE-MS for anionic and cationic metabolic profiling: system optimization and applications,  担当ページ： 134-160

  • ONCO-METABOLOMICS; A NEW CLUE TO UNDERSTAND CARCINOGENESIS, CANCER BIOLOGY AND TO DEVELOP NOVEL DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS

    Esmi, H., Mak, T.W., Soga, T., Suematsu, M.,Mori, M. Ed, Princess Takamatsu Cancer Research Fund, 2016年04月

  • Metabolomics: Methods and Protocols

    Bjerrum, J. T. Ed. (Wakayama, M., Hirayama, A., Soga, T., contribution for Chapter 13), Humana Press, 2015年04月,  ページ数： 269

    担当範囲: Chapter 13: Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ： 113-122

    　概要を見る

    Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has proven to be useful for metabolomics studies. Charged metabolites are first separated by CE based on charge and size and are subsequently selectively detected using MS. The major advantages of CE-MS are its high resolution and the fact that almost any charged species can be analyzed by two methods, both cationic and anionic. This technique can readily be applied to various types of biological samples originating from bacteria, plants, mammals, and body fluids. This chapter highlights detailed practical procedures for using this technology.

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論文 【 表示 ／ 非表示 】

  • Comparative Metabolomics of Small Molecules Specifically Expressed in the Dorsal or Ventral Marginal Zones in Vertebrate Gastrula

    Suzuki, Y., Hayasaka, R., Hasebe, M., Ikeda, S., Soga, T., Tomita, M., Hirayama, A., Kuroda, H.

    Metabolites 12 （ 6 ） 566 2022年06月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

    　概要を見る

    Many previous studies have reported the various proteins specifically secreted as inducers in the dorsal or ventral regions in vertebrate gastrula. However, little is known about the effect on cell fate of small molecules below 1000 Da. We therefore tried to identify small molecules specifically expressed in the dorsal marginal zone (DMZ) or ventral marginal zone (VMZ) in vertebrate gastrula. Small intracellular and secreted molecules were detected using explants and supernatant samples. Hydrophilic metabolites were analyzed by capillary ion chromatography–mass spectrometry and liquid chromatography–mass spectrometry, and lipids were analyzed by supercritical fluid chromatography–tandem mass spectrometry. In total, 190 hydrophilic metabolites and 396 lipids were identified. The DMZ was found to have high amounts of glycolysis- and glutathione metabolism-related metabolites in explants, and the VMZ was richer in purine metabolism-related metabolites. We also discovered some hydrophilic metabolites and lipids differentially contained in the DMZ or VMZ. Our research would contribute to a deeper understanding of the cellular physiology that regulates early embryogenesis.

  • AGE/RAGE axis regulates reversible transition to quiescent states of ALK-rearranged NSCLC and pancreatic cancer cells in monolayer cultures

    Kadonosono, T., Miyamoto, K., Sasaki, S., Matsuo, Y., Kitajima, S., Wang, Q., Endo, M., Nibori, M., Kuchimaru, T., Soga, T., Hirota, K., Kizaka-Kondoh, S.

    Sci. Rep. 12   9886 2022年06月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

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    Cancer recurrence due to tumor cell quiescence after therapy and long-term remission is associated with cancer-related death. Previous studies have used cell models that are unable to return to a proliferative state; thus, the transition between quiescent and proliferative states is not well understood. Here, we report monolayer cancer cell models wherein the human non-small cell lung carcinoma cell line H2228 and pancreatic cancer cell line AsPC-1 can be reversibly induced to a quiescent state under hypoxic and serum-starved (HSS) conditions. Transcriptome and metabolome dual-omics profiles of these cells were compared with those of the human lung adenocarcinoma cell line A549, which was unable to enter a quiescent state under HSS conditions. The quiescence-inducible cells had substantially lower intracellular pyruvate and ATP levels in the quiescent state than in the proliferative state, and their response to sudden demand for energy was dramatically reduced. Furthermore, in quiescence-inducible cells, the transition between quiescent and proliferative states of these cells was regulated by the balance between the proliferation-promoting Ras and Rap1 signaling and the suppressive AGE/RAGE signaling. These cell models elucidate the transition between quiescent and proliferative states, allowing the development of drug-screening systems for quiescent tumor cells.

  • Different types of reactions to E7386 among colorectal cancer patient-derived organoids and corresponding CAFs

    Imai, T., Naruse, M., Ochiai M., Matsumoto K., Ikeda S., Kani, M., Kato, Y., Hirayama, A., Soga, T., Hori, Y., Yokoi, A., Ochiai, A.

    Oncol. Lett.  24 （ 1 ） 221 2022年05月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

    　概要を見る

    Colorectal cancer (CRC) harbors genetic alterations in a component of the Wnt signaling pathway in ~90% of cases. In addition, the Wnt signaling pathway has been previously suggested to serve a notable role in the pathophysiology of CRC cells and cancer‑associated fibroblasts (CAFs). In the present study, the possible effects of E7386, a selective inhibitor of the interaction between β‑catenin and the cAMP response element‑binding protein‑binding protein, were evaluated using organoids and the corresponding CAFs derived from patients with CRC. E7386 at 100 nM was revealed to decrease the viability of CRC organoids and CAFs. Analysis of the gene expression profiles revealed marked changes in the expression levels of different types of cancer‑associated genes associated with E7386 concentrations in the organoids and/or CAFs, such as those regulating glucose and amino acid metabolism [phosphoenolpyruvate carboxykinase 2, asparagine synthetase (glutamine‑hydrolyzing), phosphoserine aminotransferase 1 and phosphoglycerate dehydrogenase], stimulation of natural killer cell‑mediated cytotoxicity (UL16‑binding protein 1) and modification of the Wnt/β‑catenin signaling pathway (indicated by very low density lipoprotein receptor). Results of the hydrophilic metabolome analysis in the organoids were consistent with those of the transcriptomic analysis. In vivo experiments used corresponding xenograft models, although changes in volume of tumor tissues could not be observed at 50 mg/kg body weight twice a day for 14 days, results on the protein expression levels partially supported those in the in vitro experiments. In conclusion, different types of reactions, such as alterations in the glucose and amino acid metabolic pathways, stimulation of stress responses and NK‑cell mediated cytotoxicity and components in the Wnt/β‑catenin signaling pathway, to E7386 in the CRC organoids and corresponding CAFs were observed under conditions with decreased cell viability. However, further mechanistic studies to clarify the relationships with Wnt/β‑catenin signaling pathway and these reactions using preclinical models and biomarker studies using clinical human samples are required for verification of the present preclinical biomarkers.

  • Differing impact of phosphoglycerate mutase 1-deficiency on brown and white adipose tissue

    Yoshida, Y., Shimizu, I., Hsiao, Y.T., Suda, M., Katsuumi, G., Seki, M., Suzuki, Y., Okuda, S., Soga, T., Minamino, T.

    iScience  25 （ 5 ） 104268 2022年05月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

    　概要を見る

    Brown adipose tissue (BAT) is a metabolically active organ that contributes to the thermogenic response to cold exposure. In addition, other thermogenic cells termed beige adipocytes are generated in white adipose tissue (WAT) by cold exposure. Although activation of brown/beige adipose tissue is associated with mobilization of both glucose and lipids, few studies have focused on the role of glycolytic enzymes in regulating adipose tissue function. We generated mouse models with specific deletion of the glycolytic enzyme phosphoglycerate mutase 1 (PGAM1) from adipose tissue. Deletion of Pgam1 from both BAT and WAT promoted whitening of BAT with beiging of visceral WAT, whereas deletion of Pgam1 from BAT alone led to whitening of BAT without beiging of WAT. Our results demonstrate a potential role of glycolytic enzymes in beiging of visceral WAT and suggest that PGAM1 would be a novel therapeutic target in obesity and diabetes.

  • Polarity protein SCRIB interacts with SLC3A2 to regulate proliferation and tamoxifen resistance in ER+ breast cancer

    Saito, Y., Matsuda, S., Ohnishi, N., Endo, K., Ashitani, S., Ohishi, M., Ueno, A., Tomita, M., Ueda, K., *Soga, T., *Muthuswamy, S.K

    Commun. Biol.  5 （ 1 ） 403 2022年05月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

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    Estrogen receptor (ER) positive breast cancer represents 75% of all breast cancers in women. Although patients with ER+ cancers receive endocrine therapies, more than 30% develop resistance and succumb to the disease, highlighting the need to understand endocrine resistance. Here we show an unexpected role for the cell polarity protein SCRIB as a tumor-promoter and a regulator of endocrine resistance in ER-positive breast cancer cells. SCRIB expression is induced by estrogen signaling in a MYC-dependent manner. SCRIB interacts with SLC3A2, a heteromeric component of leucine amino acid transporter SLC7A5. SLC3A2 binds to the N-terminus of SCRIB to facilitate the formation of SCRIB/SLC3A2/LLGL2/SLC7A5 quaternary complex required for membrane localization of the amino acid transporter complex. Both SCRIB and SLC3A2 are required for cell proliferation and tamoxifen resistance in ER+ cells identifying a new role for the SCRIB/SLC3A2 complex in ER+ breast cancer.

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KOARA（リポジトリ）収録論文等 【 表示 ／ 非表示 】

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総説・解説等 【 表示 ／ 非表示 】

  • メタボロミクスによるがん幹細胞の代謝研究

    北島正二朗、曽我朋義

    （別冊 医学のあゆみ）　治療標的としてのがん幹細胞 (医歯薬出版株式会社)     117 - 121 2021年03月

    記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）, 共著

  • メタボローム解析に基づく癌診断法の開発

    曽我朋義、杉本昌弘

    消化器・肝臓内科 (科学評論社)  8 ( 2 ) 137 - 143 2020年08月

    共著

  • はじめに-メタボローム解析UPDATE

    曽我朋義

    （別冊・医学のあゆみ） メタボローム解析UPDATE (医歯薬出版株式会社)   2020年06月

    単著

  • メタボロミクスによるがん幹細胞の代謝研究

    北島正二朗、曽我朋義

    医学のあゆみ (医歯薬出版株式会社)  273 ( 5 ) 469 - 473 2020年05月

    記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）, 共著

  • はじめに-メタボローム解析UPDATE

    曽我朋義

    医学のあゆみ (医歯薬出版株式会社)  270 ( 5 ) 377 - - 2019年08月

    記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

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研究発表 【 表示 ／ 非表示 】

  • Multi Omics analysis of colorectal cancer metabolism

    2018 International Meeting on 22nd MDO and 33rd JSSX (Ishikawa Ongakudo, Kanazawa, Ishikawa) , 

    2018年10月
    , 

    口頭発表（招待・特別）, JSSX (The Japanese Society for the Study of Xenobiotics)、MDO(Microsomes and Drug Oxidations)

  • Malti-omics reveals MYC as a master regulator of colorectal cancer metabolism

    曽我 朋義

    The 1st International Symposium for Trans-Omics (Koshiba Hall, The University of Tokyo, Hongo Campus) , 

    2017年11月
    , 

    口頭発表（招待・特別）

  • Onco-metabolites and cancer specific metabolic pathways

    SOGA TOMOYOSHI

    American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017, AACR2017, 

    2017年04月
    , 

    口頭発表（招待・特別）

  • What Causes Altered Metabolism in Colon Cancer Cells

    SOGA TOMOYOSHI

    46th International Symposium of The Princess Takamatsu Cancer Research Found (Palece Hotel Tokyo, Japan) , 

    2015年11月
    , 

    口頭発表（招待・特別）

  • CE-MS Metabolomics and Application to Cancer cell Metabolism

    SOGA TOMOYOSHI

    11th International Conference of the Metabolomics Society, Metabolomics 2015, (Hyatt Regency San Francisco Airport, Burlingame, California, USA) , 

    2015年07月
    , 

    口頭発表（招待・特別）

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競争的研究費の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】

  • 時空間トランスオミクスを用いた多細胞・臓器連関代謝制御の解明

    2021年10月
    -
    2024年03月

    国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST),  戦略的創造研究推進事業 CREST, 黒田 真也, 受託研究,  研究分担者

  • SUCLA2遺伝子欠失を標的とする進行前立腺がんの新規治療法開発

    2021年05月
    -
    2022年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療創生研究事業 , 髙橋 智聡, 受託研究,  研究分担者

  • ミトコンドリア先制医療

    2021年04月
    -
    2024年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), ムーショット型研究開発事業, 阿部 高明, 受託研究,  研究分担者

  • SUCLA2遺伝子欠失によって生じる代謝脆弱性を標的とする新規がん治療法探索

    2019年08月
    -
    2021年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE） , 髙橋 智聡, 受託研究,  研究分担者

  • メタボロミクスを用いたフレイル・認知機能低下に対する超早期リスク判別指標の開発

    2018年04月
    -
    2023年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(A), 武林　亨, 補助金,  研究分担者

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Works 【 表示 ／ 非表示 】

  • 経済産業省主催「バイオ人材育成事業」メタボローム実習講師

    曽我 朋義

    2004年12月
    , 

    その他, 共同

  • 日経BP社主催バイオファイナンスギルド　メタボローム講座

    曽我 朋義

    2004年08月
    , 

    その他, 共同

  • キャピラリー電気泳動による無機陰イオン、有機酸、アミノ酸の分析

    曽我朋義

    2001年10月
    -
    継続中
    , 

    その他

    　発表内容を見る

    キャピラリー電気泳動法の装置、測定法の原理および様々な測定例を解説した

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知的財産権等 【 表示 ／ 非表示 】

  • カテコールアミン類の分析方法

    出願日： 特願平01-272206  1989年10月 

    公開日： 特開平03-134561  1991年06月 

    発行日： 特許第2833058号  1998年10月

    特許権, 単独

  • 陰イオン性化合物の分析方法

    出願日： 特願平08-143048  1996年06月 

    公開日： 特開平09-325130  1997年12月 

    発行日： 特許第2912232号  1999年04月

    特許権, 単独

  • キャピラリー電気泳動による陰イオン、アミノ酸、糖類の分析方法及び装置

    出願日： 特願平10-145244  1998年05月 

    公開日： 特開平11-337524  1999年12月 

    発行日： 特許第3038184号  2000年02月

    特許権, 単独

  • 陰イオン性化合物の分離分析方法及び装置

    出願日： 特願2001-224341  2001年07月 

    公開日： 特開2003-035698  2003年02月 

    発行日： 特許第3341765号  2002年08月

    特許権, 単独

  • 電気泳動測定によるイオン性化合物の移動時間予想方法

    出願日： 特願2004-245728  2004年08月 

    公開日： 特開2006-064472  2006年03月 

    発行日： 特許第3871689号  2006年10月

    特許権, 共同

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受賞 【 表示 ／ 非表示 】

  • 第2回寺部茂賞

    2015年11月, 日本分析化学会 電気泳動分析研究懇談会, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

    受賞区分： 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 義塾賞

    曽我 朋義, 2011年11月, 慶應義塾大学, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

    受賞区分： 塾内表彰等

  • 第7回酸化ストレスと肝研究会　奨励賞

    曽我 朋義, 2010年11月, 酸化ストレスと肝研究会, メタボロミクスによる新規酸化ストレスマーカーの同定と肝臓疾患スクリーニング

    受賞区分： 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

    　説明を見る

    第7回酸化ストレスと肝研究会における研究発表による

  • 平成21年度全国発明表彰　発明協会会長賞

    曽我 朋義, 2009年07月, 社団法人　発明協会, メタボローム測定装置の発明

    受賞区分： その他

  • 平成19年度科学技術分野の文部科学大臣表彰科学技術賞

    曽我 朋義、冨田 勝, 2007年04月, 文部科学省, メタボローム解析技術に基づくバイオマーカーの探索研究

    受賞区分： その他

    　説明を見る

    細胞内に存在する数千種類の代謝物質を一斉に分析する分析技術を世界に先駆けて開発した。代謝物質のほとんどがイオン性を持つことに着目し、イオン性物質に対して高分離能を有するキャピラリー電気泳動（CE）と高選択・高感度検出器である質量分析計（MS）を組み合わせた独創的なものである。数千種類の代謝物質の変化を瞬時に可視化する情報処理技術も開発した。本研究により、急性肝炎時に血中で急増するバイオマーカーと、特定のがん細胞にのみ増加するバイオマーカー候補をすでに発見した。本成果は、バイオマーカーの探索にブレイクスルーをもたらすものであり、医薬分野の進展を促進することが期待される。

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担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

  • 研究会Ｂ

    2022年度

  • メタボロミクス

    2022年度

  • メタボローム解析実習

    2022年度

  • 修士研究会

    2022年度

  • 特別研究

    2022年度

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