曽我 朋義 (ソガ トモヨシ)

Soga, Tomoyoshi

写真a

所属(所属キャンパス)

政策・メディア研究科 (湘南藤沢)

職名

教授

HP

外部リンク

教員からのメッセージ 【 表示 / 非表示

  • 自分のこれまでの経験では、実験がうまくいってもそこから得られるものは何もありません。失敗して、原因をあれこれ考えることで自分が知らなかった知見を得たり、新しい発見をしたりします。したがって、多くのことに果敢にチェレンジしてたくさんの失敗を重ねて欲しいと思います。失敗が必ず皆さんの糧になります。

その他公開情報 【 表示 / 非表示

  • メタボロミクス、分析化学

経歴 【 表示 / 非表示

  • 1984年04月
    -
    1992年03月

    横河電機株式会社

  • 1992年04月
    -
    2001年03月

    横河アナリティカルシステムズ株式会社

  • 2001年04月
    -
    2002年03月

    琉球大学 , 客員教授

  • 2001年04月
    -
    2005年03月

    慶應義塾大学環境情報学部/先端生命科学研究所, 助教授(有期)

  • 2003年07月
    -
    2010年03月

    ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社, 取締役

全件表示 >>

学歴 【 表示 / 非表示

  • 1980年04月
    -
    1984年03月

    慶應義塾大学, 工学部, 応用化学科

    大学, 卒業

学位 【 表示 / 非表示

  • 工学博士, 豊橋技術科学大学, 論文, 2000年03月

 

研究テーマ 【 表示 / 非表示

  • 枯草菌、大腸菌、酵母等のバクテリアからイネやマウスの組織、ヒトの血液、尿、赤血球、ガン細胞等のあらゆる生物種の細胞内全代謝物質(メタボローム)の測定法, 

     

 

著書 【 表示 / 非表示

  • Amino Acid Analysis : Methods and Protocols

    Alterman M.Ed., (Hirayama, A., Ikeda, S., Sato, A., Soga, T., contribution for Chapter 23), Humana Press, 2019年07月

    担当範囲: Chapter 23: Amino Acid Analysis by Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ: 307-313

     概要を見る

    Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has been developed as a powerful tool in the analysis of charged compounds. To simultaneously analyze free amino acids, an electrolyte with low pH was used to positively charge all of the amino acids. In this condition, all protonated amino acids migrated toward the cathode in CE and then were sensitively and selectively detected by MS. This method is simple, rapid, and selective and could readily be applied to the analysis of free amino acids in various samples. In this chapter, the detailed procedure to analyze amino acids using CE-tandem mass spectrometry (MS/MS) is described.

  • Oceanography Challenges to Future Earth : Human and Natural Impacts on our Seas

    Komatsu, T., Ceccaldi, H-J., Yoshida, J., Prouzet, P., Henocque, Y. Ed., (Nakano, T., Shirakawa, H., Yeo, G., Devlin, R.H., Soga, T., contribution for Part IV ), Springer, 2019年02月,  ページ数: 430

    担当範囲: Part IV Innovative Research: Metabolome profiling of growth hormone transgenic coho salmon by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry,  担当ページ: 223-234

  • Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry for Metabolomics

    Ramautar R. Ed., (Hirayama A, Soga T. contribution for CHAPTER 7), The Royal Society of Chemistry, 2018年07月,  ページ数: 300

    担当範囲: CHAPTER 7: CE-MS for anionic and cationic metabolic profiling: system optimization and applications,  担当ページ: 134-160

  • ONCO-METABOLOMICS; A NEW CLUE TO UNDERSTAND CARCINOGENESIS, CANCER BIOLOGY AND TO DEVELOP NOVEL DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS

    Esmi, H., Mak, T.W., Soga, T., Suematsu, M.,Mori, M. Ed, Princess Takamatsu Cancer Research Fund, 2016年04月

  • Metabolomics: Methods and Protocols

    Bjerrum, J. T. Ed. (Wakayama, M., Hirayama, A., Soga, T., contribution for Chapter 13), Humana Press, 2015年04月,  ページ数: 269

    担当範囲: Chapter 13: Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry,  担当ページ: 113-122

     概要を見る

    Capillary electrophoresis-mass spectrometry (CE-MS) has proven to be useful for metabolomics studies. Charged metabolites are first separated by CE based on charge and size and are subsequently selectively detected using MS. The major advantages of CE-MS are its high resolution and the fact that almost any charged species can be analyzed by two methods, both cationic and anionic. This technique can readily be applied to various types of biological samples originating from bacteria, plants, mammals, and body fluids. This chapter highlights detailed practical procedures for using this technology.

全件表示 >>

論文 【 表示 / 非表示

  • Fusobacterium species are distinctly associated with patients with Lynch Syndrome colorectal cancer

    Salim, F., Mizutani, S., Shiba, S., Takamaru, H., Yamada, M., Nakajima, T., Yachida, T., Soga, T., Saito, Y., Fukuda, S., Yachida, S., Yamada, T.

    iScience 27 ( 7 ) 110181 - 110181 2024年07月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

     概要を見る

    Accumulating evidence demonstrates clear correlation between the gut microbiota and sporadic colorectal cancer (CRC). Despite this, there is limited understanding of the association between the gut microbiota and CRC in Lynch Syndrome (LS), a hereditary type of CRC. Here, we analyzed fecal shotgun metagenomic and targeted metabolomic of 71 Japanese LS subjects. A previously published Japanese sporadic CRC cohort, which includes non-LS controls, was utilized as a non-LS cohort (n = 437). LS subjects exhibited reduced microbial diversity and low-Faecalibacterium enterotypes compared to non-LS. Patients with LS-CRC had higher levels of Fusobacterium nucleatum and fap2. Differential fecal metabolites and functional genes suggest heightened degradation of lysine and arginine in LS-CRC. A comparison between LS and non-LS subjects prior to adenoma formation revealed distinct fecal metabolites of LS subjects. These findings suggest that the gut microbiota plays a more responsive role in CRC tumorigenesis in patients with LS than those without LS.

  • Association of Nonalcoholic Fatty Liver Disease with Arterial Stiffness and its Metabolomic Profiling in Japanese Community-Dwellers

    Hirata, A., Harada, S., Iida, M., Kurihara, A., Fukai, K., Kuwabara, K., Kato, S., Matsumoto, M., Sata, M., Miyagawa, N., Toki, R., Edagawa, S., Sugiyama, D., Sato, A., Hirayama, A., Sugimoto, M., Soga, T., Tomita, M., Okamura, T., Takebayashi, T.

    J. Atheroscler. Thromb. 31 ( 7 ) 1031 - 1047 2024年07月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

     概要を見る

    Aims: Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is known to be associated with atherosclerosis. This study focused on upstream changes in the process by which NAFLD leads to atherosclerosis. The study aimed to confirm the association between NAFLD and the cardio-ankle vascular index (CAVI), an indicator of subclinical atherosclerosis, and explore metabolites involved in both by assessing 94 plasma polar metabolites.

    Methods: A total of 928 Japanese community-dwellers (306 men and 622 women) were included in this study. The association between NAFLD and CAVI was examined using a multivariable regression model adjusted for confounders. Metabolites commonly associated with NAFLD and CAVI were investigated using linear mixed-effects models in which batch numbers of metabolite measurements were used as a random-effects variable, and false discovery rate-adjusted p-values were calculated. To determine the extent to which these metabolites mediated the association between NAFLD and CAVI, mediation analysis was conducted.

    Results: NAFLD was positively associated with CAVI (coefficients [95% Confidence intervals (CI)]=0.23 [0.09-0.37]; p=0.001). A total of 10 metabolites were involved in NAFLD and CAVI, namely, branched-chain amino acids (BCAAs; valine, leucine, and isoleucine), aromatic amino acids (AAAs; tyrosine and tryptophan), alanine, proline, glutamic acid, glycerophosphorylcholine, and 4-methyl-2-oxopentanoate. Mediation analysis showed that BCAAs mediated more than 20% of the total effect in the association between NAFLD and CAVI.

    Conclusions: NAFLD was associated with a marker of atherosclerosis, and several metabolites related to insulin resistance, including BCAAs and AAAs, could be involved in the process by which NAFLD leads to atherosclerosis.

    Keywords: Atherosclerosis; Branched-chain amino acids; Cardio-ankle vascular index; Insulin resistance; Metabolites; Nonalcoholic fatty liver disease.

  • The γ-glutamyl cycle serves as an amino acids supply system in colorectal cancer organoids under chronic hypoxia

    Tabata, S., Endo, H., Makinoshima, H., Soga, T., Inoue, M.

    Biochem. Biophys. Res. Commun. (Biochemical and Biophysical Research Communications)  714   149977 - 149977 2024年06月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り,  ISSN  0006291X

     概要を見る

    Malignant tumors are characterized by a hypoxic microenvironment, and metabolic reprogramming is necessary to ensure energy production and oxidative stress resistance. Although the microenvironmental properties of tumors vary under acute and chronic hypoxia, studies on chronic hypoxia-induced metabolic changes are limited. In the present study, we performed a comprehensive metabolic analysis in a chronic hypoxia model using colorectal cancer (CRC) organoids, and identified an amino acid supply system through the γ-glutamyl cycle, a glutathione recycling pathway. We analyzed the metabolic changes caused by hypoxia over time and observed that chronic hypoxia resulted in an increase in 5-oxoproline and a decrease in oxidized glutathione (GSSG) compared to acute hypoxia. These findings suggest that chronic hypoxia induces metabolic changes in the γ-glutamyl cycle. Moreover, inhibition of the γ-glutamyl cycle via γ-glutamyl cyclotransferase (GGCT) and γ-glutamyl transferase 1 (GGT1) knockdown significantly reversed chronic hypoxia-induced upregulation of 5-oxoproline and several amino acids. Notably, GGT1 knockdown downregulated the intracellular levels of γ-glutamyl amino acids. Conclusively, these results indicate that the γ-glutamyl cycle serves as an amino acid supply system in CRC under chronic hypoxia, which provides fresh insight into cancer metabolism under chronic hypoxia.

  • Molecular subtypes of lung adenocarcinoma present distinct immune tumor microenvironments

    Fukuda, H., Arai, K., Mizuno, H., Nishito, Y., Motoi, N., Arai, Y., Hiraoka, N., Shibata, T., Sonobe, Y., Kayukawa, Y., Hashimoto, E., Takahashi, M., Fujii, E., Maruyama, T., Kuwabara, K., Nishizawa, T., Mizoguchi, Y., Yoshida, Y., Watanabe, S., Yamashita, M., Kitano, S., Sakamoto, H., Nagata, Y., Mitsumori, R., Ozaki, K., Niida, S., Kanai, Y., Hirayama, A., Soga, T., Tsukada, K., Yabuki, N., Shimada, M., Kitazawa, T., Natori, O., Sawada, N., Kato, A., Yoshida, T., Yasuda, K., Ochiai, A., Tsunoda, H., Aoki, K

    Cancer Sci. (Cancer Science)  115 ( 6 ) 1763 - 1777 2024年06月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り,  ISSN  13479032

     概要を見る

    Overcoming resistance to immune checkpoint inhibitors is an important issue in patients with non-small-cell lung cancer (NSCLC). Transcriptome analysis shows that adenocarcinoma can be divided into three molecular subtypes: terminal respiratory unit (TRU), proximal proliferative (PP), and proximal inflammatory (PI), and squamous cell carcinoma (LUSQ) into four. However, the immunological characteristics of these subtypes are not fully understood. In this study, we investigated the immune landscape of NSCLC tissues in molecular subtypes using a multi-omics dataset, including tumor-infiltrating leukocytes (TILs) analyzed using flow cytometry, RNA sequences, whole exome sequences, metabolomic analysis, and clinicopathologic findings. In the PI subtype, the number of TILs increased and the immune response in the tumor microenvironment (TME) was activated, as indicated by high levels of tertiary lymphoid structures, and high cytotoxic marker levels. Patient prognosis was worse in the PP subtype than in other adenocarcinoma subtypes. Glucose transporter 1 (GLUT1) expression levels were upregulated and lactate accumulated in the TME of the PP subtype. This could lead to the formation of an immunosuppressive TME, including the inactivation of antigen-presenting cells. The TRU subtype had low biological malignancy and "cold" tumor-immune phenotypes. Squamous cell carcinoma (LUSQ) did not show distinct immunological characteristics in its respective subtypes. Elucidation of the immune characteristics of molecular subtypes could lead to the development of personalized immune therapy for lung cancer. Immune checkpoint inhibitors could be an effective treatment for the PI subtype. Glycolysis is a potential target for converting an immunosuppressive TME into an antitumorigenic TME in the PP subtype.

  • SGLT2 inhibition eliminates senescent cells and alleviates pathological aging

    Katsuumi, G., Shimizu, I., Suda, M., Yoshida, Y., Furihata, T., Joki, Y., Hsiao, CL., Jiaqi, L., Fujiki, S., Abe, M., Sugimoto, M., Soga, T., Minamino, T

    Nat. Aging online 2024年05月

    研究論文(学術雑誌), 共著

     概要を見る

    It has been reported that accumulation of senescent cells in various tissues contributes to pathological aging and that elimination of senescent cells (senolysis) improves age-associated pathologies. Here, we demonstrate that inhibition of sodium-glucose co-transporter 2 (SGLT2) enhances clearance of senescent cells, thereby ameliorating age-associated phenotypic changes. In a mouse model of dietary obesity, short-term treatment with the SGLT2 inhibitor canagliflozin reduced the senescence load in visceral adipose tissue and improved adipose tissue inflammation and metabolic dysfunction, but normalization of plasma glucose by insulin treatment had no effect on senescent cells. Canagliflozin extended the lifespan of mice with premature aging even when treatment was started in middle age. Metabolomic analyses revealed that short-term treatment with canagliflozin upregulated 5-aminoimidazole-4-carboxamide-1-β-D-ribofuranoside, enhancing immune-mediated clearance of senescent cells by downregulating expression of programmed cell death-ligand 1. These findings suggest that inhibition of SGLT2 has an indirect senolytic effect by enhancing endogenous immunosurveillance of senescent cells.

全件表示 >>

KOARA(リポジトリ)収録論文等 【 表示 / 非表示

全件表示 >>

総説・解説等 【 表示 / 非表示

  • 腫瘍における分岐鎖アミノ酸トランスポーターの役割

    齊藤康弘、曽我朋義

    実験医学 (羊土社)  40 ( 14 ) 2239 - 2244 2022年08月

    記事・総説・解説・論説等(その他), 共著

  • アミノ酸トランスポーターを標的とした個別化医療

    Precision Medicine 4 ( 13 ) 18 - 22 2021年11月

    記事・総説・解説・論説等(その他), 共著

  • メタボロミクスによるがん幹細胞の代謝研究

    北島正二朗、曽我朋義

    (別冊 医学のあゆみ) 治療標的としてのがん幹細胞 (医歯薬出版株式会社)     117 - 121 2021年03月

    記事・総説・解説・論説等(その他), 共著

  • メタボローム解析に基づく癌診断法の開発

    曽我朋義、杉本昌弘

    消化器・肝臓内科 (科学評論社)  8 ( 2 ) 137 - 143 2020年08月

    共著

  • はじめに-メタボローム解析UPDATE

    曽我朋義

    (別冊・医学のあゆみ) メタボローム解析UPDATE (医歯薬出版株式会社)   2020年06月

    単著

全件表示 >>

研究発表 【 表示 / 非表示

  • Development of CE-MS Metabolomics and its Application in Cancer

    Tomoyoshi Soga

    Metabolomics2024, 20th Annual Confereence of the Metabolomics Society (Osaka) , 

    2024年06月

  • Multi Omics analysis of colorectal cancer metabolism

    2018 International Meeting on 22nd MDO and 33rd JSSX (Ishikawa Ongakudo, Kanazawa, Ishikawa) , 

    2018年10月

    口頭発表(招待・特別), JSSX (The Japanese Society for the Study of Xenobiotics)、MDO(Microsomes and Drug Oxidations)

  • Malti-omics reveals MYC as a master regulator of colorectal cancer metabolism

    曽我 朋義

    The 1st International Symposium for Trans-Omics (Koshiba Hall, The University of Tokyo, Hongo Campus) , 

    2017年11月

    口頭発表(招待・特別)

  • Onco-metabolites and cancer specific metabolic pathways

    SOGA TOMOYOSHI

    American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017, AACR2017, 

    2017年04月

    口頭発表(招待・特別)

  • What Causes Altered Metabolism in Colon Cancer Cells

    SOGA TOMOYOSHI

    46th International Symposium of The Princess Takamatsu Cancer Research Found (Palece Hotel Tokyo, Japan) , 

    2015年11月

    口頭発表(招待・特別)

全件表示 >>

競争的研究費の研究課題 【 表示 / 非表示

  • SUCLA2欠失疾患の治療薬開発と応用

    2024年05月
    -
    2025年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療加速化研究事業(P-PROMOTE), 髙橋 智聡, 受託研究,  研究分担者

  • 冬眠・休眠のトランスオミクス解析

    2023年06月
    -
    2025年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 学術変革領域研究(A), 黒田 真也, 補助金,  研究分担者

  • 大腸がんにおけるオンコメタボライト・L-2HGの分子基盤の解明

    2022年06月
    -
    2025年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 田畑 祥, その他,  研究分担者

  • 時空間トランスオミクスを用いた多細胞・臓器連関代謝制御の解明

    2021年10月
    -
    2025年03月

    国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST),  戦略的創造研究推進事業 CREST, 黒田 真也, 受託研究,  研究分担者

  • SUCLA2遺伝子欠失を標的とする進行前立腺がんの新規治療法開発

    2021年05月
    -
    2023年03月

    日本医療研究開発機構(AMED), 次世代がん医療創生研究事業 , 髙橋 智聡, 受託研究,  研究分担者

全件表示 >>

Works 【 表示 / 非表示

  • 経済産業省主催「バイオ人材育成事業」メタボローム実習講師

    曽我 朋義

    2004年12月

    その他, 共同

  • 日経BP社主催バイオファイナンスギルド メタボローム講座

    曽我 朋義

    2004年08月

    その他, 共同

  • キャピラリー電気泳動による無機陰イオン、有機酸、アミノ酸の分析

    曽我朋義

    2001年10月
    -
    継続中

    その他

     発表内容を見る

    キャピラリー電気泳動法の装置、測定法の原理および様々な測定例を解説した

知的財産権等 【 表示 / 非表示

  • カテコールアミン類の分析方法

    出願日: 特願平01-272206  1989年10月 

    公開日: 特開平03-134561  1991年06月 

    発行日: 特許第2833058号  1998年10月

    特許権, 単独

  • 陰イオン性化合物の分析方法

    出願日: 特願平08-143048  1996年06月 

    公開日: 特開平09-325130  1997年12月 

    発行日: 特許第2912232号  1999年04月

    特許権, 単独

  • キャピラリー電気泳動による陰イオン、アミノ酸、糖類の分析方法及び装置

    出願日: 特願平10-145244  1998年05月 

    公開日: 特開平11-337524  1999年12月 

    発行日: 特許第3038184号  2000年02月

    特許権, 単独

  • 陰イオン性化合物の分離分析方法及び装置

    出願日: 特願2001-224341  2001年07月 

    公開日: 特開2003-035698  2003年02月 

    発行日: 特許第3341765号  2002年08月

    特許権, 単独

  • 電気泳動測定によるイオン性化合物の移動時間予想方法

    出願日: 特願2004-245728  2004年08月 

    公開日: 特開2006-064472  2006年03月 

    発行日: 特許第3871689号  2006年10月

    特許権, 共同

全件表示 >>

受賞 【 表示 / 非表示

  • 福澤賞

    曽我 朋義, 2022年11月, 慶應義塾, メタボローム(細胞内全代謝物質)解析技術の開発と実用化

    受賞区分: 塾内表彰等

  • 第2回寺部茂賞

    2015年11月, 日本分析化学会 電気泳動分析研究懇談会, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 義塾賞

    曽我 朋義, 2011年11月, 慶應義塾大学, CE-MSメタボローム測定技術の開発と実用化

    受賞区分: 塾内表彰等

  • 第7回酸化ストレスと肝研究会 奨励賞

    曽我 朋義, 2010年11月, 酸化ストレスと肝研究会, メタボロミクスによる新規酸化ストレスマーカーの同定と肝臓疾患スクリーニング

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

     説明を見る

    第7回酸化ストレスと肝研究会における研究発表による

  • 平成21年度全国発明表彰 発明協会会長賞

    曽我 朋義, 2009年07月, 社団法人 発明協会, メタボローム測定装置の発明

    受賞区分: その他

全件表示 >>

 

担当授業科目 【 表示 / 非表示

  • 先端研究(BI)

    2024年度

  • アカデミックプロジェクト(先端生命科学B)

    2024年度

  • アカデミックプロジェクト(先端生命科学A)

    2024年度

  • 卒業プロジェクト1

    2024年度

  • 研究会B

    2024年度

全件表示 >>