黒田　裕樹 （ クロダ　ヒロキ ）

KURODA Hiroki

写真a

所属（所属キャンパス）

環境情報学部 （ 湘南藤沢 ）

職名

教授

メールアドレス

メールアドレス

HP

外部リンク
Scopus 論文情報  
総論文数: 23 総引用数: 1950 h-index: 15

Click to view the Scopus page. The data was downloaded from Scopus API inJune 14, 2026, via http://api.elsevier.com and http://www.scopus.com .

このページの先頭へ▲

プロフィール 【 表示 ／ 非表示 】

  • 1973年、京都府生まれ。1996年に名古屋大学理学部（分子生物学科）を卒業後、東京大学大学院総合文化研究科に進学。発生生物学の第一人者である浅島誠教授の指導のもと、アフリカツメガエルを用いた初期発生における細胞接着や形態形成のメカニズムを研究。2001年3月に博士号（学術）を取得した。大学院修了後は、米国・カリフォルニア大学ロサンゼルス校（UCLA）でのポストドクター（博士研究員）を経て、2005年より静岡大学教育学部（理科教育講座）准教授に着任。2013年に慶應義塾大学環境情報学部准教授となり、現在は同大学教授として教鞭を執りつつ、政策・メディア研究科の委員も務める。

このページの先頭へ▲

教員からのメッセージ 【 表示 ／ 非表示 】

  • たった一つの細胞（受精卵）から、複雑な体が形作られていくプロセスは、どんなテクノロジーも及ばない「奇跡」そのものです。いまこの瞬間も、我々の体の中では何兆個もの細胞が絶妙なチームワークで我々を動かしています。現代の科学は今、生命の仕組みを「知る」だけでなく、新たな可能性を「創る」領域へと進化しています。これは「人間とは何か、生きるとは何か」を捉え直す、エキサイティングな時代の到来を意味しています。「なぜ生き物はこんな形をしているんだろう？」という素朴なワクワクを抱いたことのある方は、ぜひお声がけください。

このページの先頭へ▲

学歴 【 表示 ／ 非表示 】

  • 1998年04月
    -
    2001年03月

    東京大学, 総合文化研究科広域科学専攻, 生命環境科学系

    大学院, 修了, 博士

  • 1996年04月
    -
    1998年03月

    東京大学, 総合文化研究科広域科学専攻, 生命環境科学系

    大学院, 修了, 修士

  • 1992年04月
    -
    1996年03月

    名古屋大学, 理学部, 分子生物学科

    大学, 卒業, その他

このページの先頭へ▲

学位 【 表示 ／ 非表示 】

  • 博士（学術）, 東京大学, 課程, 2001年03月

    ツメガエル予定脊索細胞における細胞接着性の変化

  • 修士（学術）, 東京大学, 課程, 1998年03月

  • 学士, 名古屋大学, 課程, 1996年03月

このページの先頭へ▲
 

著書 【 表示 ／ 非表示 】

  • 休み時間の分子生物学 第2版

    黒田裕樹, 講談社, 2026年05月,  ページ数： 256

    　概要を見る

    2026年5月に改訂された黒田裕樹著の『休み時間の分子生物学 第2版』は、1テーマ約10分のコンパクトな解説や身近な例え話を用いたわかりやすさはそのままに、全84項目へと内容をアップデートすることで、目まぐるしく進化する生命科学の「基礎」から「最先端の今」までを無駄なく学べる仕様になっており、大学の講義対策や理科教育、医療（コメディカル）関係者の基礎固め、さらには大人の学び直しまで、通学・通勤などのすきま時間に生命科学の根本を気軽に完全マスターできる、定評ある日本の入門書の最新決定版です。

  • 希望の分子生物学: 私たちの「生命観」を書き換える

    黒田裕樹, NHK出版, 2023年11月,  ページ数： 224

    　概要を見る

    医療、環境、産業など多岐にわたる分野に革命を起こしつつある現代分子生物学の「驚きの未来像」を豊富な例え話で分かりやすく提示した新書であり、DIYバイオや遺伝子治療、AI創薬といった21世紀の最先端技術が私たちの社会や生命観をどのように一変させるのかを歴史的背景からSF世界のような未来予想図まで体系的に描いているため、慶應義塾大学SFCで履修倍率6〜7倍を誇る著者の大人気講義を追体験するように、生物学的な「わたし」という存在の解像度を格段に上げ、科学がもたらす未来への希望をワクワクしながら実感できる一冊です。

  • 休み時間の分子生物学

    黒田裕樹, 講談社, 2020年07月,  ページ数： 240

このページの先頭へ▲

論文 【 表示 ／ 非表示 】

  • Possible Horizontal Gene Transfer of Novel Transposable Elements in Anisakis simplex between Hosts and Parasites

    Naoki Hoshino, Hiroki Kuroda

    microPublication Biol. （Caltech Library）  2025年

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 最終著者, 責任著者, 査読有り,  ISSN  2578-9430

  • Comparative Metabolomics of Small Molecules Specifically Expressed in the Dorsal or Ventral Marginal Zones in Vertebrate Gastrula

    Suzuki Y., Hayasaka R., Hasebe M., Ikeda S., Soga T., Tomita M., Hirayama A., Kuroda H.

    Metabolites 12 （ 6 ）  2022年06月

    　概要を見る

    Many previous studies have reported the various proteins specifically secreted as inducers in the dorsal or ventral regions in vertebrate gastrula. However, little is known about the effect on cell fate of small molecules below 1000 Da. We therefore tried to identify small molecules specifically expressed in the dorsal marginal zone (DMZ) or ventral marginal zone (VMZ) in vertebrate gastrula. Small intracellular and secreted molecules were detected using explants and supernatant samples. Hydrophilic metabolites were analyzed by capillary ion chromatography–mass spectrometry and liquid chromatography–mass spectrometry, and lipids were analyzed by supercritical fluid chromatography–tandem mass spectrometry. In total, 190 hydrophilic metabolites and 396 lipids were identified. The DMZ was found to have high amounts of glycolysis-and glutathione metabolismrelated metabolites in explants, and the VMZ was richer in purine metabolism-related metabolites. We also discovered some hydrophilic metabolites and lipids differentially contained in the DMZ or VMZ. Our research would contribute to a deeper understanding of the cellular physiology that regulates early embryogenesis.

  • Protocadherin-1 is expressed in the notochord of mouse embryo but is dispensable for its formation

    Fukunaga K., Tanji M., Hanzawa N., Kuroda H., Inui M.

    Biochemistry and Biophysics Reports 27 2021年09月

    　概要を見る

    Notochord is an embryonic midline structure that serves as mechanical support for axis elongation and the signaling center for the surrounding tissues. Precursors of notochord are initially induced in the dorsal most mesoderm region in gastrulating embryo and separate from the surrounding mesoderm/endoderm tissue to form an elongated rod-like structure, suggesting that cell adhesion molecules may play an important role in this step. In Xenopus embryo, axial protocadherin (AXPC), an orthologue of mammalian Protocadherin-1 (PCDH1), is indispensable for the assembly and separation from the surrounding tissue of the notochord cells. However, the role of PCDH1 in mammalian notochord remains unknown. We herein report that PCDH1 is expressed in the notochord of mouse embryo and that PCDH1-deficient mice form notochord normally. First, we examined the temporal expression pattern of pcdh1 and found that pcdh1 mRNA was expressed from embryonic day (E) 7.5, prior to the stage when notochord cells detach from the surrounding endoderm tissue. Second, we found that PCDH1 protein is expressed in the notochord of mouse embryos in addition to the previously reported expression in endothelial cells. To further investigate the role of PCDH1 in embryonic development, we generated PCDH1-deficient mice using the CRISPR-Cas9 system. In PCDH1-deficient embryos, notochord formation and separation from the surrounding tissue were normal. Structure and marker gene expression of notochord were also unaffected by loss of PCDH1. Major vascular patterns in PCDH1-deficient embryo were essentially normal. These results suggest that PCDH1 is dispensable for notochord formation, including the tissue separation process, in mammalian embryos. We successfully identified the evolutionary conserved expression of PCDH1 in notochord, but its function may differ among species.

  • Comprehensive measurement andcomparison of ionic small molecules containedin citrus unshiu marc. using metabolomic analysis

    Hara Y., Sugawara A., Yamada K.C., Endo K., Ashitani S., Igarashi K., Soga T., Shinjo A., Kuroda H.

    Nippon Shokuhin Kagaku Kogaku Kaishi 67 （ 12 ） 499 - 513 2021年

    ISSN  1341027X

    　概要を見る

    Few studies have comprehensively screened for ionic small molecules with high water-solubility in the traditional Japanese mandarin orange Citrus unshiu Marc. Here, we performedmetabolomic analysis with capillary electrophoresismass spectrometry (CE-MS) to comprehensively identify and accumulate gross quantitative data for water-soluble components in the different varieties of.Aoshima. and 'Okitsu/ Miyagawa Wase., according to grade and processing method. In this analysis, we focusedon 151 components andshowed the characteristic components relatedto each different variety andprocessing method, e.g., Met, Gly, andAsp in var. Wase; ornithine, putrescine, synephrine, andGln in var. Aoshima; andpyroglutamate, GABA (γ -aminobutyric acid), andmalonate in the juice of var. Aoshima. Furthermore, we conductedprocessing tests andid entifiedcomponents that were affectedby squeezing or heating. These data represent basic data for further investigation of the metabolism of C. unshiu Marc. or chemical changes in their components due to external factors such as processing.

  • いのちの作り方,心臓の作り方

    黒田 裕樹森本健太, 岩宮貴紘

    Keio SFC J （Vol. No. Page.-）  15 （ 1 ） 262 - 282,IV-V 2015年09月

    共著, 筆頭著者, 責任著者,  ISSN  1347-2828

全件表示 >>

このページの先頭へ▲

KOARA（リポジトリ）収録論文等 【 表示 ／ 非表示 】

全件表示 >>

このページの先頭へ▲
 

担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

  • 地球環境技術論

    2026年度

  • 基礎分子生物学２

    2026年度

  • 卒業プロジェクト１

    2026年度

  • 研究会Ｂ

    2026年度

  • 細胞レベルの生命科学による革新

    2026年度

全件表示 >>

このページの先頭へ▲