堀田　耕司 （ ホッタ　コウジ ）

Hotta, Kohji

写真a

所属（所属キャンパス）

理工学部 生命情報学科 （ 矢上 ）

職名

准教授

HP
Scopus 論文情報  
総論文数: 86 総引用数: 3902 h-index: 27

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学歴 【 表示 ／ 非表示 】

  • 1997年03月

    北海道大学, 理学部

    大学, 卒業

  • 2002年03月

    京都大学, 理学研究科

    大学院, 修了, 博士

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学位 【 表示 ／ 非表示 】

  • 博士（理学）, 京都大学, 課程, 2002年03月

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研究分野 【 表示 ／ 非表示 】

  • ライフサイエンス / 発生生物学 （Developmental Biology）

  • ライフサイエンス / 形態、構造

  • ライフサイエンス / 生物物理学

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研究キーワード 【 表示 ／ 非表示 】

  • バイオイメージング

  • ホヤ

  • メカノバイオロジー

  • 進化発生

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研究テーマ 【 表示 ／ 非表示 】

  • 尾芽胚の曲がりを支える３Ｄ形態ロジック, 

    2016年04月
    -
    2018年03月

  • 脊索動物尾芽伸長のロジック, 

    2013年
    -
    2014年

  • 個体まるごと用いた4次元イメージングによる形態形成運動の定量解析, 

    2009年
    -
    2011年

    　研究概要を見る

    　ナメクジウオ、ホヤ、ヒトはそれぞれ、頭索動物、尾索動物、脊椎動物に属し、これらは発生過程において脊索や、背側神経管と鰓孔、肛門より後方に伸びる尾など、共通のボディープランをもつ。このような共通の特長はどのようにしてつくられるのであろうか。脊索動物の発生過程は卵割期、胞胚期、原腸陥入期、神経板期、神経胚期、尾芽胚期といった共通の発

  • 脳胞形成の4次元定量解析, 

    2012年
    -
    2013年

    　研究概要を見る

    Purpose of the Research Project

    Different region of central nervous system, fore brain, mid brain, hind brain and spinal cord originates from one neural tube at organogenesis period. Defects of neural tube formation cause severe diseases, including anencephaly and spina bifida. While understanding of differentiation at the molecular level has been deepened, the molecular mechanism of the morphogenesis of neural tubes at different regions remains to be clarified.

    One of chordate, ascidian a

  • ファイロティピック段階における形態の個体差とロバスト性, 

    2012年
    -
    2014年

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論文 【 表示 ／ 非表示 】

  • Residual Tail Twisting in Ascidian Larvae Is Stabilized by Asymmetric Myofibrils Against Bilateral Symmetry Restoration

    Kogure Yuki, Nishio Misaki, Okuda Satoru, Hotta Kohji

    FEBS Letters 25 （ 1064R.2 ）  2026年04月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 責任著者, 査読有り

  • Genomic and Transcriptomic Resources for the Tropical Ascidian Phallusia philippinensis

    Shunsuke O Miyasaka, Takumi T Shito, Noburu Sensui, Euichi Hirose, Kotaro Oka, Kohji Hotta

    G3: Genes, Genomes, Genetics 2026年03月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

  • Optogenetic activation of primary sensory neurons induces metamorphosis in Ciona

    Nozomu M Totsuka and Kohji Hotta

    Developmental Biology 530   77 - 88 2026年02月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 最終著者, 責任著者, 査読有り

  • Axial rotation comprises concurrent twisting and bending as distinct morphogenetic components in Ciona

    Yuki S. Kogure, Satoru Okuda, Kotaro Oka, Kohji Hotta

    Developmental Biology 530   234 - 247 2025年12月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 責任著者, 査読有り

  • Stimulatory and inhibitory G-protein signaling relays drive cAMP accumulation for timely metamorphosis in the chordate Ciona

    Akiko Hozumi, Nozomu M Totsuka, Arata Onodera, Yanbin Wang, Mayuko Hamada, Akira Shiraishi, Honoo Satake, Takeo Horie, Kohji Hotta, Yasunori Sasakura

    eLife 2025年06月

    研究論文（学術雑誌）, 共著, 査読有り

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KOARA（リポジトリ）収録論文等 【 表示 ／ 非表示 】

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総説・解説等 【 表示 ／ 非表示 】

  • 超透明生物！？ーガラスと同等の透明度を持つホヤ卵への進化と生存戦略

    紫藤拓巳、長谷川尚弘、岡浩太郎、堀田耕司

    academist Journal  2020年12月

  • Corrigendum to “Optical dissection of synaptic plasticity for early adaptation in Caenorhabditis elegans” [Neuroscience 428C (2020) 112–121] (Neuroscience (2020) 428 (112–121), (S0306452219308814), (10.1016/j.neuroscience.2019.12.026))

    Ashida K., Shidara H., Hotta K., Oka K.

    Neuroscience （Neuroscience）  434   212 - 213 2020年05月

    ISSN  03064522

    　概要を見る

    The author regret that, Fig. 5 in the above article was incorrect. The correct figure is published below. [Figure presented]

  • 細胞から個体へつなぐ組織としてのルール

    堀田耕司

    生命の教養学15組織としての生命　荒金 直人 編    3 - 22 2019年

  • ラマン分光イメージングによる非標識条件下でのホヤ胚の細胞分化識別

    堀田耕司、中村允、岡浩太郎

    比較内分泌学 （比較内分泌学）  42 （ 158 ） 52 - 53 2016年01月

    記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）, 共著

  • Dual FRETイメージング法による細胞内シグナルの同時可視化生物物理トピック

    新野祐介、堀田耕司、岡浩太郎

    生物物理 50 （ 1 ） 028 - 029 2010年

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研究発表 【 表示 ／ 非表示 】

  • ナツメボヤ科ホヤノックアウト実験系のための基盤構築

    高田晨生，堀田耕司

    [国内会議]  日本動物学会関東支部第78回大会, 

    2026年03月
    , 

    ポスター発表

  • ⽣物分類ゲームVRinkaiの⽔族館への応⽤可能性について

    紫藤拓巳，戸塚望，上田理名，猿渡敏郎，堀田耕司

    [国内会議]  東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会 第11回水族館シンポジウム, 

    2025年12月
    , 

    ポスター発表

  • 尾芽胚期におけるRTTN遺伝子の役割

    小川玲奈，嘉代冴絵，堀田耕司

    [国内会議]  第7回 ホヤ研究会, 

    2025年11月
    , 

    口頭発表（一般）

  • ヨーロッパザラボヤのゲノム解読と尾索動物の包括的ゲノムDB 構築の試み

    紫藤拓巳，Jayakumar Vasanthan，西辻光希，西辻淑恵，河合思聞，宮坂 駿佑，岡浩太郎，榊原康文，堀田耕司

    [国内会議]  第7回ホヤ研究会 , 

    2025年11月
    , 

    ポスター発表

  • ヨーロッパザラボヤのゲノム解読および近縁な被嚢類の遺伝子モデル作成に よる比較解析基盤の構築

    紫藤 拓巳，Jayakumar Vasanthan，西辻 光希， 西辻 淑恵， 河合 思聞，宮坂 駿佑，岡 浩太郎，榊原 康文，堀田 耕司

    [国内会議]  日本動物学会第96回名古屋大会, 

    2025年09月
    , 

    ポスター発表

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競争的研究費の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】

  • 器官形成期における体軸回転をうみだす生体秩序と力の解明

    2025年04月
    -
    2027年03月

    堀田 耕司, 学術変革領域研究(A), 補助金,  研究代表者

  • 脊索動物器官形成期における左右相称性補正機構の解明

    2024年04月
    -
    2028年03月

    独立行政法人日本学術振興会(JSPS), 科学研究費補助金(文部科学省・日本学術振興会, 堀田耕司, 研究代表者

  • 脊索動物器官形成期における左右相称性補正機構の解明

    2024年04月
    -
    2028年03月

    堀田 耕司, 基盤研究(B), 補助金,  研究代表者

  • 尾芽胚の軸回転を制御する生体秩序と力の解明

    2023年04月
    -
    2025年03月

    独立行政法人日本学術振興会(JSPS), 科学研究費助成金(文部科学省・日本学術振興会, 堀田耕司, 学術変革領域研究(A), 研究代表者

  • ホヤ変態開始機構の定量解析

    2021年04月
    -
    2023年03月

    独立行政法人日本学術振興会(JSPS), 科学研究費助成事業, 堀田 耕司, 新学術領域研究（研究領域提案型）, 研究代表者

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受賞 【 表示 ／ 非表示 】

  • 武田科学財団　一般研究奨励

    堀田 耕司, 2008年11月, 脊索動物個体全体を用いた神経細胞ネットワークの網羅的解明

    受賞区分： 出版社・新聞社・財団等の賞

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担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

  • 基礎生命実験

    2026年度

  • 人間・社会システム情報科学修士研究Ａ１

    2026年度

  • 発生生物学

    2026年度

  • 卒業研究

    2026年度

  • 生命情報特別講義第１

    2026年度

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担当経験のある授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

  • 生物学序論

    慶應義塾

    2018年04月
    -
    2019年03月
    , 

    春学期, 講義, 専任, 2時間, 200人

    biology

  • 基礎生命実験

    慶應義塾

    2018年04月
    -
    2019年03月
    , 

    秋学期, 実習・実験

  • 発生生物学

    慶應義塾

    2018年04月
    -
    2019年03月
    , 

    秋学期, 講義, 専任, 30人

  • 生命情報実験

    慶應義塾

    2018年04月
    -
    2019年03月
    , 

    秋学期, 実習・実験, 専任, 40人

  • 細胞生物学第三

    慶應義塾

    2018年04月
    -
    2019年03月
    , 

    秋学期, 講義, 専任, 40人

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社会活動 【 表示 ／ 非表示 】

  • International Tunicate Information System Meeting

    2010年04月
    -
    継続中
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所属学協会 【 表示 ／ 非表示 】

  • 日本動物学会

    　

  • 日本発生生物学会

    　

  • 日本進化学会

    　

  • 日本分子生物学会

    　

  • 日本遺伝学会

    　
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委員歴 【 表示 ／ 非表示 】

  • 2010年04月
    -
    継続中

    国際ホヤ情報システム会議委員, International Tunicate Information System Meeting

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