Papers - Oka, Kotaro

Genome-wide searching with base-pairing kernel functions for noncoding RNAs: computational and expression analysis of snoRNA families in Caenorhabditis elegans

Morita K, Saito Y, Sato K, Oka K, Hotta K, Sakakibara Y.

Nucleic Acids Res. 37 ( 3 ) 999-1009 2009.01

Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

Dextran Coated Gadolinium Phosphate Nanoparticles for Magnetic Resonance Tumor Imaging

Hiroki Hifumi, Seiichi Yamaoka, Akihiro Tanimoto, Tomotaka Akatsu, Yutaka Shindo, Aki Honda, Daniel Citterio, Kotaro Oka, Sachio Kuribayashi and Koji Suzuki*

OURNAL OF MATERIALS CHEMISTRY 19 ( 35 ) 6393-6399 2009

Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

Nitric Oxide-cGMP Signaling in the Local Circuit of the Cricket Abdominal Nervous System

H. Aonuma, Y. Kitamura, K. Niwa, H. Ogawa,K. Oka

Neuroscience 157 ( 4 ) 749-61 2008.12

Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

A novel biological role of tachykinins as an up-regulator of oocyte growth: identification of an evolutionary origin of tachykininergic functions in the ovary of the ascidian, Ciona intestinalis.

Aoyama M, Kawada T, Fujie M, Hotta K, Sakai T, Sekiguchi T, Oka K, Satoh N, Satake H

Endocrinology 149 ( 9 ) 4346-4356 2008.05

Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

Dendritic design inplements algorithm for synaptic extraction of sensory information

Ogawa H., G. I. Cummins., Gwen A. Jacobs and Oka K.

The Journal of Neuroscience 28 ( 18 ) 4592-4603 2008.04

Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

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Ca²⁺ influx through P2X receptors induces actin cytoskeleton reorganization by the formation of cofilin rods in neurites

Homma H., Niino Y., Hotta Y. and Oka K.

Molecular and Cellular Neuroscience 37   261 - 270 2008.02

Research paper (scientific journal), Single Work, Accepted

• Access to Document (DOI)

Algebraic method for the analysis of signaling crosstalk

Matsubara Y., Kikuchi S., Sugimoto M., Oka K. and Tomita M.

Artificial Life 14 ( 1 ) 81 - 94 2008.01

Research paper (scientific journal), Single Work, Accepted

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キンカチョウ音声識別の生物学－社会適応行動の獲得機構－

岡 浩太郎

計測と制御 (社団法人計測自動制御学会)  46   893-897 2007.12

Research paper (scientific journal), Single Work

Flagella facilitate escape of Salmonella from oncotic 1 macropharges

Sano G., Takada Y., Goto S., Maruyama K., Shindo Y., Oka K., Matsui H. and Matsuo K.

Journal of Bacteriology 189 ( 22 ) 8224 - 8232 2007.09

Research paper (scientific journal), Single Work, Accepted

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細胞内マグネシウムイオン濃度を測定する蛍光プローブの開発と細胞機能解析への応用

新藤豊、岡浩太郎、小松広和、鈴木孝治

蛋白質・核酸・酵素 52 ( 13 ) 1552 - 1557 2007

Research paper (scientific journal), Joint Work

Neurite level imaging of living PC12 cell with scanning electrochemical / near-field optical / atomic force microscopy

Akio Ueda, Osamu Niwa, Kenichi Maruyama, Yutaka Shindo, Kotaro Oka and Koji Suzuki

Angewandte Chemie 119   8386-8389 2007

Research paper (scientific journal), Single Work, Accepted

Serotonin induces the increase in intracellular Ca²⁺ which enhances neurite outgrowth in PC12 cells via the activation of 5-HT3 receptors and voltage-gated calcium channels

Homma K., Kitamura Y., Ogawa H., Oka K.

Journal of Neuroscience Research 84   316 - 325 2006.05

Research paper (scientific journal), Single Work, Accepted

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Change detection and di¡erence detection of tone duration discrimination

Okazaki S., Kanoh S., Takaura K., Tsukada M and Oka K.

Neuro Report 17 ( 4 ) 395 - 399 2006.03

Research paper (scientific journal), Single Work, Accepted

マグネシウム蛍光プローブの設計と応用・Ca²⁺、Mg²⁺マルチ蛍光プローブの開発と多成分同時解析

小松広和、岡浩太郎、鈴木孝治

生物工学会誌 84 ( 5 ) 173 - 175 2006

Research paper (scientific journal), Joint Work

細胞内シグナル伝達系のシミュレーション技法とイメージング技術

菊地進一、松原嘉哉、矢澤和明、山南春奈、冨田勝、岡浩太郎

シミュレーション 25 ( 1 ) 29 - 35 2006

Research paper (scientific journal), Joint Work

Single Molecular Multianalyte (Ca²⁺, Mg²⁺) Fluorescent Probe and Applications to Bioimaging

Komatsu H., Miki T., D. Citterio, Kubota T., Shindo Y., Kitamura Y., Oka K., and Suzuki K.

J of American Chemical Society 127 ( 31 ) 10798 - 10799 2005.07

Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

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Mitochondria are intracellular magnesium stores: investigation by simultaneous fluorescent imagings in PC12 cells

Kubota T., Shindo Y., Tokuno K., Komatsu K., Ogawa H., Kudo S., Kitamura Y., Suzuki K. and Oka K.

BBA-Molecular Cell Research 1744 ( 1 ) 19 - 28 2005.05

Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

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PC12細胞内Mg動員を、新規蛍光色素KMG-104を用いたCa-Mg同時イメージング法により解析した。細胞内Ca動員を誘導する、カフェイン刺激、細胞内でのケイジド化合物（IP3, Ca）の光解除を行ったところ、細胞内Ca濃度上昇は観察されたが、Mg濃度は変化しなかった。ミトコンドリア脱共役剤FCCPを細胞に添加すると、細胞内で一過的なMgイオン濃度上昇が観測され、これはミトコンドリア膜電位およびミトコンドリアからのCa放出に遅れて生じた。このことから、ミトコンドリアは細胞内でのMg貯蔵器官であると結論した。

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Inhibiton of RANKL-induced osteoclastogenesis by (-)-DHMEQ, a novel NF-kB inhibitor, through downregulation of NFATc1.

Takatsuna H., Asagiri M., Kubota T., Oka K., Osada T., Sugiyama C., Saito H., Aoki K., Ohya K., Takayanagi H. and Umezawa K.

J. Bone and Miner. Res. 20 ( 4 ) 653 - 662 2005.04

Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

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マルチカラーイメージング法による細胞機能の可視化

新野祐介、岡浩太郎

日本レーザ医学会会誌 26   338 - 345 2005

Research paper (scientific journal), Joint Work

Influence of mRNA and protein synthesis inhibitors on the long-term memory acquisition of classically conditioned earthworms.

H.Watanabe, T.Takaya, T.Shimoi, H.Ogawa, Y.Kitamura, and K.Oka

Neurobiol. Learning and Memory 83   151-157 2005

Research paper (scientific journal), Single Work

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ミミズの振動ー光の古典的条件付けは古くから研究が行われてきているものの、その成立メカニズムについては不明な点が多い。我々は詳細な行動実験系を構築し、振動ー光の古典的条件付けに与える学習間隔の効果を調べたところ、学習間隔を調整することにより3時間しか維持できない短期記憶と24時間以上維持できる長期記憶の切り替えができることを初めて明らかにした。また学習後１時間以内に転写阻害剤、またはタンパク質合成阻害剤をミミズ腹腔に注射すると、長期記憶形成は阻害されることも示した。