清水 史郎 (シミズ シロウ)

Simizu, Siro

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所属(所属キャンパス)

理工学部 応用化学科 (矢上)

職名

教授

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HP

総合紹介 【 表示 / 非表示

  • ケミカルバイオロジー、糖質科学、がん生物学を中心に研究を行っています。講義では化学の視点で生物学を理解できるように取り組んでいます。

学歴 【 表示 / 非表示

  • 1993年03月

    慶應義塾, 理工学部, 応用化学科

    大学, 卒業

  • 1998年03月

    慶應義塾, 理工学研究科

    大学院, 修了, 博士

学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(工学), 慶應義塾, 課程, 1998年03月

 

研究分野 【 表示 / 非表示

  • 生体関連化学

  • 分子生物学

研究キーワード 【 表示 / 非表示

  • がん生物学

  • ケミカルバイオロジー

  • 糖質科学

 

著書 【 表示 / 非表示

  • 実験医学

    宮崎 功、奥村 英夫、清水 史郎、長田 裕之, 2011年

    担当範囲: 79-83

  • 化学と工業

    叶 直樹、清水 史郎, 2011年

    担当範囲: 37-39

論文 【 表示 / 非表示

  • C-mannosylation of R-spondin2 activates Wnt/β-catenin signaling and migration activity in human tumor cells

    Mizuta, H., Kuga, K., Suzuki, T., Niwa, Y., Dohmae, N. & Simizu, S.

    Int. J. Oncol. 2019年

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

  • Unified total synthesis of madangamine alkaloids

    Suto, T., Yanagita, Y., Nagashima, Y., Takikawa, S., Kurosu, Y., Matsuo, N., Miura, K., Simizu, S., Sato, T. & Chida, N.

    Bull. Chem. Soc. Jpn.  92   545 - 571 2019年

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

  • Integrin β1 is an essential factor in vasculogenic mimicry of human cancer cells

    Kawahara R., Niwa Y., Simizu S.

    Cancer Science (Cancer Science)  109 ( 8 ) 2490 - 2496 2018年08月

    ISSN  13479032

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    © 2018 The Authors. Cancer Science published by John Wiley & Sons Australia, Ltd on behalf of Japanese Cancer Association. Vasculogenic mimicry (VM) formation by cancer cells is known to play a crucial role in tumor progression, but its detailed mechanism is unclear. In the present study, we focused on integrin β1 (ITGB1) and assessed the role of ITGB1 in VM formation. We used in vitro methods to seed cancer cells on Matrigel to evaluate the capability of VM formation. We carried out ITGB1 gene deletion using the CRISPR/Cas9 system, and these ITGB1-knockout cells did not show a VM-like network formation. Further, reintroduction of ITGB1 rescued VM-like network formation in ITGB1-knockout cells. In conclusion, ITGB1 is a critical factor in VM of human cancer cells, and inhibition of ITGB1 may be a novel therapeutic approach for malignant cancer.

  • Regulation of granulocyte colony-stimulating factor receptor-mediated granulocytic differentiation by C-mannosylation

    Otani K., Niwa Y., Suzuki T., Sato N., Sasazawa Y., Dohmae N., Simizu S.

    Biochemical and Biophysical Research Communications (Biochemical and Biophysical Research Communications)  498 ( 3 ) 466 - 472 2018年04月

    ISSN  0006291X

     概要を見る

    © 2018 Elsevier Inc. Granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF) receptor (G-CSFR) is a type I cytokine receptor which is involved in hematopoietic cell maturation. G-CSFR has three putative C-mannosylation sites at W253, W318, and W446; however, it is not elucidated whether G-CSFR is C-mannosylated or not. In this study, we first demonstrated that G-CSFR was C-mannosylated at only W318. We also revealed that C-mannosylation of G-CSFR affects G-CSF-dependent downstream signaling through changing ligand binding capability but not cell surface localization. Moreover, C-mannosylation of G-CSFR was functional and regulated granulocytic differentiation in myeloid 32D cells. In conclusion, we found that G-CSFR is C-mannosylated at W318 and that this C-mannosylation has role(s) for myeloid cell differentiation through regulating downstream signaling.

  • Therapeutic activity of plant-derived alkaloid conophylline on metabolic syndrome and neurodegenerative disease models

    Umezawa K., Kojima I., Simizu S., Lin Y., Fukatsu H., Koide N., Nakade Y., Yoneda M.

    Human Cell (Human Cell)  31 ( 2 ) 95 - 101 2018年04月

    ISSN  09147470

     概要を見る

    © 2017, Japan Human Cell Society and Springer Japan KK, part of Springer Nature. Increasing metabolic syndromes including type-2 diabetes mellitus, obesity, and steatohepatitis are serious problems in most countries in the world. Neurodegenerative diseases such as Alzheimer, Parkinson’s, and Huntington’s diseases are increasing in many countries. However, therapy for these diseases is not sufficient yet. Thus, effective chemotherapy for these diseases is being expected. Conophylline is an alkaloid isolated from the leaves of Ervatamia microphylla and related plants. It was found to induce beta-cell differentiation in the precursor pancreatic cells. Oral administration of this compound ameliorated type-2 diabetes mellitus model in mice and rats. Later, fibrosis of the pancreatic islets was found to be greatly reduced by conophylline in the pancreatic islets. It also inhibited chemically induced liver cirrhosis. Further study indicated that conophylline inhibited non-alcoholic steatohepatitis in the model mice. On the one hand, loss of autophagy often causes protein aggregation to give neural cell death. Conophylline was found to activate autophagy in cultured neural cells. Activation of autophagy ameliorated cellular models of Parkinson’s and Huntington’s diseases. Thus, conophylline is likely to be useful for the development of chemotherapy for metabolic and neurodegenerative diseases.

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KOARA(リポジトリ)収録論文等 【 表示 / 非表示

総説・解説等 【 表示 / 非表示

  • C-Mannosylation: Previous studies and future research perspectives

    Niwa Y., Simizu S.

    Trends in Glycoscience and Glycotechnology (Trends in Glycoscience and Glycotechnology)  30 ( 177 ) E231 - E238 2018年11月

    ISSN  09157352

     概要を見る

    © 2018 FCCA (Forum: Carbohydrates Coming of Age). C-linked glycosylation, one of the protein glycosylations, is a unique type of glycosylation in which an α-mannose is attached to the indole C2 carbon of a tryptophan residue via a C–C linkage and is so named C-mannosylation. C-mannosylation is enzymati-cally catalyzed in the endoplasmic reticulum (ER) lumen, and the N-terminal side Trp residue of the consensus amino acid sequence Trp-Xaa-Xaa-Trp/Cys (Xaa represents any amino acid) is often C-mannosylated. It has been reported that about 30 proteins are C-mannosylated, and the functions of C-mannosylation are becoming clear. In 2013, C. elegans dumpy-19 (dpy-19) was identified as a C-mannosyltransferase, and we revealed that DPY19L3, one of the human homologs of dpy-19, has similar activity in 2016. In this review, we describe previous studies about C-mannosylation, including our results and future research perspectives.

  • C-Mannosylation: Previous studies and future research perspectives

    Niwa Y., Simizu S.

    Trends in Glycoscience and Glycotechnology (Trends in Glycoscience and Glycotechnology)  30 ( 177 )  2018年11月

    ISSN  09157352

     概要を見る

    © 2018 FCCA (Forum: Carbohydrates Coming of Age). C-linked glycosylation, one of the protein glycosylations, is a unique type of glycosylation in which an α-mannose is attached to the indole C2 carbon of a tryptophan residue via a C–C linkage and is so named C-mannosylation. C-mannosylation is enzymati-cally catalyzed in the endoplasmic reticulum (ER) lumen, and the N-terminal side Trp residue of the consensus amino acid sequence Trp-Xaa-Xaa-Trp/Cys (Xaa represents any amino acid) is often C-mannosylated. It has been reported that about 30 proteins are C-mannosylated, and the functions of C-mannosylation are becoming clear. In 2013, C. elegans dumpy-19 (dpy-19) was identified as a C-mannosyltransferase, and we revealed that DPY19L3, one of the human homologs of dpy-19, has similar activity in 2016. In this review, we describe previous studies about C-mannosylation, including our results and future research perspectives.

研究発表 【 表示 / 非表示

  • R-spondin1 におけるリン酸化の機能解析

    西谷 拓海, 鈴木 健裕, 丹羽 祐貴, 三浦 一輝, 堂前 直, 清水 史郎

    日本農芸化学会関東支部会2018年度大会 (千葉) , 2018年10月, ポスター(一般)

  • Vibsanin A誘導体の生物活性評価および標的分子の同定

    三浦 一輝、松木 渉、高尾 賢一、清水 史郎

    日本農芸化学会関東支部会2018年度大会  (千葉) , 2018年10月, ポスター(一般)

  • ヒトC型糖転移酵素DPY19L3のプロモーター解析

    吉本 哲、三浦 一輝、清水 史郎

    日本農芸化学会関東支部会2018年度大会  (千葉) , 2018年10月, ポスター(一般)

  • トポロジー解析によるDPY19L1のC-mannosyltransferase活性中心の探索

    横山 典弘, 柳原 凌太郎, 三浦 一輝, 丹羽 祐貴, 清水 史郎

    日本農芸化学会関東支部会2018年度大会 (千葉) , 2018年10月, ポスター(一般)

  • C-mannosylation-基質と酵素の探索

    清水 史郎

    日本農芸化学会中部支部 第183回例会 (名古屋) , 2018年09月, シンポジウム・ワークショップ パネル(指名)

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競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • 新たなC型糖修飾責任酵素の同定と基質タンパク質の解析

    2018年04月
    -
    2021年03月

    文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 清水 史郎, 基盤研究(C), 補助金,  代表

受賞 【 表示 / 非表示

  • 日本がん転移学会 研究奨励賞

    清水 史郎, 2012年07月, 日本がん転移学会, ケミカルバイオロジーによる転移関連分子の理解と制御

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • B.B.B.論文賞

    宮崎功、清水 史郎、一宮治美、川谷誠、長田裕之, 2009年03月, 日本農芸化学会, Robust and systematic drug screening method using chemical arrays and the protein library: identification of novel inhibitors of carbonic anhydrase II

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 日本癌学会奨励賞

    清水 史郎, 2004年10月, 日本癌学会, 薬剤耐性・転移に関与するがん分子標的の機能解析

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

 

担当授業科目 【 表示 / 非表示

  • 応用化学輪講

    2019年度

  • 微生物学

    2019年度

  • 応用化学実験D

    2019年度

  • 基礎理工学課題研究

    2019年度

  • 基礎理工学特別研究第2

    2019年度

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所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 日本糖質学会, 

    2015年
    -
    継続中
  • 日本がん分子標的治療学会, 

    2009年
    -
    継続中
  • 日本ケミカルバイオロジー学会, 

    2008年
    -
    継続中
  • 日本がん転移学会, 

    2006年
    -
    継続中
  • 日本癌学会, 

    1992年
    -
    継続中

委員歴 【 表示 / 非表示

  • 2015年
    -
    継続中

    評議員, 日本がん転移学会

  • 2009年
    -
    継続中

    評議員, 日本がん分子標的治療学会

  • 2008年
    -
    継続中

    会員, 日本ケミカルバイオロジー学会

  • 1992年
    -
    継続中

    会員, 日本癌学会