古川 亮平 (フルカワ リョウヘイ)

Furukawa, Ryohei

写真a

所属(所属キャンパス)

文学部 (日吉)

職名

助教

HP

研究室住所

神奈川県横浜市港北区日吉4−1−1 第2校舎2309

研究室電話番号

045-566-1340

その他の所属・職名 【 表示 / 非表示

  • 自然科学研究教育センター

学歴 【 表示 / 非表示

  • 2010年04月
    -
    2012年09月

    慶應義塾大学, 理工学研究科, 基礎理工学

    大学院, 修了, 博士後期

学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(理学), 慶應義塾大学, 課程, 2012年09月

    棘皮動物イトマキヒトデ幼生に着目した原始的な生体防御システム及びその制御メカニズムの解析

 

研究分野 【 表示 / 非表示

  • 免疫生物学

  • ライフサイエンス / 発生生物学 (Developmental Biology)

  • ライフサイエンス / 細胞生物学 (Cell Biology)

  • ライフサイエンス / 分子生物学 (Molecular Biology)

  • ライフサイエンス / 進化生物学 (Evolutionary Biology)

研究キーワード 【 表示 / 非表示

  • 個体性

  • 免疫進化

研究テーマ 【 表示 / 非表示

  • 棘皮動物ヒトデの免疫システムの解析, 

    2005年
    -
    継続中

  • 棘皮動物ヒトデにおける再構築現象の解析, 

    2019年
    -
    継続中

  • 棘皮動物ヒトデの変態現象の解析, 

    2019年
    -
    継続中

 

著書 【 表示 / 非表示

  • 動物学の百科事典

    古川 亮平, 丸善出版, 2018年09月

    担当範囲: マクロファージの起源

  • Advances in Comparative Immunology

    Smith, LC., Arriza, V., Barela Hudgell, MA., Barone, G., Bodnar, AG., Buckley, KM., Cunsolo, V., Dheilly, N., Franchi, N., Fugmann, SD., Furukawa, R., Garcia-Arraras, J., Henson, JH., Hibino, T., Irons, ZH., Li, C., Lun, CM., Majeske, AJ., Oren, M., Pagliara, P., Pinsino, A., Raftos, DA., Rast, JP., Samasa, B., Schillaci, D., Schrankel, CS., Stabili, L., Stensväg, K., Sutton, E., Springer International Publishing, 2018年07月

    担当範囲: Echinodermata: The Complex Immune System in Echinoderms.

  • 実験医学別冊 RNA-Seq実験ハンドブック

    大桃 秀樹、古川 亮平、清水 厚志, 羊土社, 2016年03月

    担当範囲: ヒト血液検体のトランスクプトーム解析

  • 実験医学増刊 エピゲノム研究 就職の全体像の理解から先制・個別化医療へ

    古川 亮平、八谷 剛史、清水 厚志, 羊土社, 2016年

    担当範囲: 全エピゲノム関連解析(EWAS)

論文 【 表示 / 非表示

  • Evaluation of short-term epigenetic age fluctuation

    Komaki S., Ohmomo H., Hachiya T., Sutoh Y., Ono K., Furukawa R., Umekage S., Otsuka-Yamasaki Y., Minabe S., Takashima A., Tanno K., Sasaki M., Shimizu A.

    Clinical Epigenetics (Clinical Epigenetics)  14 ( 1 )  2022年12月

    ISSN  18687075

     概要を見る

    Considerable effort has been spent on lowering and maintaining the epigenetic age. However, the extent to which epigenetic age fluctuates under normal conditions is poorly understood. Therefore, we analyzed methylation data from monocytes and peripheral blood mononuclear cells collected from two Japanese men. The ranges of the Pan-tissue, Skin and blood, and DNAm PhenoAge epigenetic age during 3 months were ≥ 5.62, ≥ 3.04, and ≥ 8.23 years, and the maximum daily changes were 5.21, 3.20, and 6.53 years, respectively. These fluctuations were not suppressed by correcting for cell-type composition. Although the underlying biological mechanism remains unclear, there was a nonnegligible degree of age fluctuation which should inform personalized clinical applications.

  • Longitudinal DNA methylation dynamics as a practical indicator in clinical epigenetics

    Komaki S., Ohmomo H., Hachiya T., Sutoh Y., Ono K., Furukawa R., Umekage S., Otsuka-Yamasaki Y., Tanno K., Sasaki M., Shimizu A.

    Clinical Epigenetics (Clinical Epigenetics)  13 ( 1 ) 219 2021年12月

    共著, 査読有り,  ISSN  18687075

     概要を見る

    Background: One of the fundamental assumptions of DNA methylation in clinical epigenetics is that DNA methylation status can change over time with or without interplay with environmental and clinical conditions. However, little is known about how DNA methylation status changes over time under ordinary environmental and clinical conditions. In this study, we revisited the high frequency longitudinal DNA methylation data of two Japanese males (24 time-points within three months) and characterized the longitudinal dynamics. Results: The results showed that the majority of CpGs on Illumina HumanMethylation450 BeadChip probe set were longitudinally stable over the time period of three months. Focusing on dynamic and stable CpGs extracted from datasets, dynamic CpGs were more likely to be reported as epigenome-wide association study (EWAS) markers of various traits, especially those of immune- and inflammatory-related traits; meanwhile, the stable CpGs were enriched in metabolism-related genes and were less likely to be EWAS markers, indicating that the stable CpGs are stable both in the short-term within individuals and under various environmental and clinical conditions. Conclusions: This study indicates that CpGs with different stabilities are involved in different functions and traits, and thus, they are potential indicators that can be applied for clinical epigenetic studies to outline underlying mechanisms.

  • dbTMM: an integrated database of large-scale cohort, genome and clinical data for the Tohoku Medical Megabank Project

    Ogishima S., Nagaie S., Mizuno S., Ishiwata R., Iida K., Shimokawa K., Takai-Igarashi T., Nakamura N., Nagase S., Nakamura T., Tsuchiya N., Nakaya N., Murakami K., Ueno F., Onuma T., Ishikuro M., Obara T., Mugikura S., Tomita H., Uruno A., Kobayashi T., Tsuboi A., Tadaka S., Katsuoka F., Narita A., Sakurai M., Makino S., Tamiya G., Aoki Y., Shimizu R., Motoike I.N., Koshiba S., Minegishi N., Kumada K., Nobukuni T., Suzuki K., Danjoh I., Nagami F., Tanno K., Ohmomo H., Asahi K., Shimizu A., Hozawa A., Kuriyama S., Yamamoto M., Abe M., Aizawa Y., Aoki Y., Chida K., Egawa S., Eto A., Funayama T., Fuse N., Hamanaka Y., Harada Y., Hashizume H., Higuchi S., Hirano S., Hirata T., Hiratsuka M., Hozawa A., Igarashi K., Inoue J., Ishida N., Ishii N., Ishii T., Ishikuro M., Ito K., Ito S., Kageyama M., Katsuoka F., Kawame H., Kawashima J., Kikuya M., Kinoshita K., Kitatani K., Kiyama T., Kiyomoto H., Kobayashi T., Kodama E., Kogure M., Kojima K., Koreeda S., Koshiba S., Koyama S., Kudo H., Kumada K., Kure S., Kuriki M., Kuriyama S., Kuroki Y., Maikusa N., Makino S., Matsubara H., Matsui H., Metoki H., Mimori T., Misawa K.

    Human Genome Variation (Human Genome Variation)  8 ( 1 )  2021年12月

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    To reveal gene-environment interactions underlying common diseases and estimate the risk for common diseases, the Tohoku Medical Megabank (TMM) project has conducted prospective cohort studies and genomic and multiomics analyses. To establish an integrated biobank, we developed an integrated database called “dbTMM” that incorporates both the individual cohort/clinical data and the genome/multiomics data of 157,191 participants in the Tohoku Medical Megabank project. To our knowledge, dbTMM is the first database to store individual whole-genome data on a variant-by-variant basis as well as cohort/clinical data for over one hundred thousand participants in a prospective cohort study. dbTMM enables us to stratify our cohort by both genome-wide genetic factors and environmental factors, and it provides a research and development platform that enables prospective analysis of large-scale data from genome cohorts.

  • D-Tryptophan enhances the reproductive organ-specific expression of the amino acid transporter homolog Dr-SLC38A9 involved in the sexual induction of the planarian Dugesia ryukyuensis.

    15. Maezawa, T., Ishikawam M., Sekii, K., Nagamatsu, G., Furukawa, R., Kobayashi, K.

    Zoological Letters 7 ( 4 )  2021年03月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

  • pmar1/phb homeobox genes and the evolution of the doublenegative gate for endomesoderm specification in echinoderms

    Yamazaki A., Morino Y., Urata M., Yamaguchi M., Minokawa T., Furukawa R., Kondo M., Wada H.

    Development (Cambridge) (Development (Cambridge))  147 ( 4 )  2020年

    共著, 査読有り,  ISSN  09501991

     概要を見る

    © 2020 Published by The Company of Biologists Ltd. In several model animals, the earliest phases of embryogenesis are regulated by lineage-specific genes, such as Drosophila bicoid. Sea urchin (echinoid) embryogenesis is initiated by zygotic expression of pmar1, a paired-class homeobox gene that has been considered to be present only in the lineage of modern urchins (euechinoids). In euechinoids, Pmar1 promotes endomesoderm specification by repressing the hairy and enhancer of split C (hesC) gene. Here, we have identified the basal echinoid (cidaroid) pmar1 gene, which also promotes endomesoderm specification but not by repressing hesC. A further search for related genes demonstrated that other echinoderms have pmar1-related genes named phb. Functional analyses of starfish Phb proteins indicated that, similar to cidaroid Pmar1, they promote activation of endomesoderm regulatory gene orthologs via an unknown repressor that is not HesC. Based on these results, we propose that Pmar1 may have recapitulated the regulatory function of Phb during the early diversification of echinoids and that the additional repressor HesC was placed under the control of Pmar1 in the euechinoid lineage. This case provides an exceptional model for understanding how early developmental processes diverge.

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KOARA(リポジトリ)収録論文等 【 表示 / 非表示

総説・解説等 【 表示 / 非表示

  • Echinodermata: The complex immune system in echinoderms (Advances in Comparative Immunology, 10.1007/978-3-319-76768-0_13)

    Smith L., Arizza V., Hudgell M., Barone G., Bodnar A., Buckley K., Cunsolo V., Dheilly N., Franchi N., Fugmann S., Furukawa R., Garcia-Arraras J., Henson J., Hibino T., Irons Z., Li C., Lun C., Majeske A., Oren M., Pagliara P., Pinsino A., Raftos D., Rast J., Samasa B., Schillaci D., Schrankel C., Stabili L., Stensv K., Sutton E.

    Coresource 1 (Coresource 1)   2018年01月

     概要を見る

    © Springer International Publishing AG, part of Springer Nature 2018. This chapter was inadvertently published with an incorrect spelling of the author's name as V. Arriza whereas it should be V. Arizza. In addition to this the affiliation of one of the chapter authors Elisse Sutton was published incorrectly and it has now been corrected to read as Department of Biological Sciences, Macquarie University, Sydney, NSW, Australia.

  • IMMオミックスリファレンスパネルの取り組み

    古川 亮平、清水 厚志

    生化学 88 ( 1 ) 36 - 43 2016年

    記事・総説・解説・論説等(学術雑誌), 共著

研究発表 【 表示 / 非表示

  • 自家蛍光を持つ成体ホヤ血球細胞の発生学的起源と分類

    土方希,戸塚望,田口瑞姫,古川亮平,岡浩太郎,堀田耕司

    日本比較免疫学会第33回学術集会, 

    2022年08月

    口頭発表(一般)

  • イトマキヒトデの変態はTLRシグナル伝達経路を必要とする

    田口瑞姫,古川亮平

    日本比較免疫学会第33回学術集会, 

    2022年08月

    口頭発表(一般)

  • イトマキヒトデ成体の同種異個体認識応答時における体腔液成分の分析

    南方宏太,田口瑞姫,古川亮平

    日本比較免疫学会第33回学術集会, 

    2022年08月

    口頭発表(一般)

  • イトマキヒトデの変態を制御する遺伝子ネットワークとその免疫学的意義

    古川亮平

    日本比較免疫学会 第32回学術集会, 

    2021年08月

    シンポジウム・ワークショップ パネル(指名)

  • イトマキヒトデの個体性は稚ヒトデ期に確立される

    田口瑞姫, 多米晃裕, 古川亮平

    日本比較免疫学会 第32回学術集会, 

    2021年08月

    ポスター発表

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競争的研究費の研究課題 【 表示 / 非表示

  • ヒトデ幼生の自己・非自己認識に関わる種特異的糖鎖の探索

    2020年04月
    -
    2023年03月

    古川亮平, 補助金,  研究代表者

  • 海洋プランクトン幼生の成長:摂餌の消化・吸収と栄養素の伝播・受容

    2018年04月
    -
    2021年03月

    科学研究費補助金(文部科学省・日本学術振興会), 金子 洋之, 補助金,  研究分担者

  • DNAメチル化・トランスクリプトーム・血漿メタボロームの3層オミックス解析を用いた電気加熱式たばこの喫煙・受動喫煙の県境影響に関する疫学研究

    2018年04月
    -
    2020年03月

    日本医療研究開発機構, 循環器疾患・糖尿病等生活習慣病対策実用化研究事業, 武林 亨, その他,  研究分担者

  • ヒトデ幼生のマクロファージ遊走阻止因子による炎症制御機構の解明

    2017年04月
    -
    2020年03月

    科学研究費補助金(文部科学省・日本学術振興会), 補助金,  研究代表者

  • 変態を経て変化する棘皮動物人での自然免疫系の分子基盤を探る

    2009年04月
    -
    2012年03月

    科学研究費補助金(文部科学省・日本学術振興会), 補助金,  研究代表者

受賞 【 表示 / 非表示

  • 日本比較免疫学会 古田優秀論文賞

    古川 亮平, 2016年08月, 日本比較免疫学会, 2つのマクロファージ遊走阻止因子がヒトデ幼生の間充織細胞の走化性を制御する

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 日本比較免疫学会 古田奨励賞

    古川 亮平, 2009年08月, ヒトデ胚の間充織細胞におけるApDOCKタンパク質の構造及び発現解析

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

 

担当授業科目 【 表示 / 非表示

  • 総合教育セミナーⅡ

    2022年度

  • 生物学Ⅱ(実験を含む)

    2022年度

  • 生物学Ⅰ(実験を含む)

    2022年度

  • 総合教育セミナーⅡ

    2021年度

  • 生物学Ⅱ(実験を含む)

    2021年度

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所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 日本比較免疫学会

     
  • 日本動物学会

     

委員歴 【 表示 / 非表示

  • 2016年09月
    -
    継続中

    役員, 日本比較免疫学会