古川 亮平 (フルカワ リョウヘイ)

Furukawa, Ryohei

写真a

所属(所属キャンパス)

文学部 (日吉)

職名

助教

メールアドレス

メールアドレス

HP

研究室住所

神奈川県横浜市港北区日吉4−1−1 第2校舎2309

研究室電話番号

045-566-1340

その他の所属・職名 【 表示 / 非表示

  • 自然科学研究教育センター

学歴 【 表示 / 非表示

  • 2010年04月
    -
    2012年09月

    慶應義塾, 理工学研究科, 基礎理工学

    大学院, 修了, 博士後期

学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(理学), 慶應義塾, 課程, 2012年09月

    棘皮動物イトマキヒトデ幼生に着目した原始的な生体防御システム及びその制御メカニズムの解析

 

研究分野 【 表示 / 非表示

  • 免疫生物学

  • 発生生物学 (Developmental Biology)

  • 細胞生物学 (Cell Biology)

  • 分子生物学 (Molecular Biology)

  • 進化生物学 (Evolutionary Biology)

研究キーワード 【 表示 / 非表示

  • 個体性

  • 免疫進化

研究テーマ 【 表示 / 非表示

  • 棘皮動物ヒトデの免疫システムの解析, 

    2005年
    -
    継続中

  • 棘皮動物ヒトデにおける再構築現象の解析, 

    2019年
    -
    継続中

  • 棘皮動物ヒトデの変態現象の解析, 

    2019年
    -
    継続中

 

著書 【 表示 / 非表示

  • 動物学の百科事典

    古川 亮平, 丸善出版, 2018年09月

    担当範囲: マクロファージの起源

  • Advances in Comparative Immunology

    Smith, LC., Arriza, V., Barela Hudgell, MA., Barone, G., Bodnar, AG., Buckley, KM., Cunsolo, V., Dheilly, N., Franchi, N., Fugmann, SD., Furukawa, R., Garcia-Arraras, J., Henson, JH., Hibino, T., Irons, ZH., Li, C., Lun, CM., Majeske, AJ., Oren, M., Pagliara, P., Pinsino, A., Raftos, DA., Rast, JP., Samasa, B., Schillaci, D., Schrankel, CS., Stabili, L., Stensväg, K., Sutton, E., Springer International Publishing, 2018年07月

    担当範囲: Echinodermata: The Complex Immune System in Echinoderms.

  • 実験医学別冊 RNA-Seq実験ハンドブック

    大桃 秀樹、古川 亮平、清水 厚志, 羊土社, 2016年03月

    担当範囲: ヒト血液検体のトランスクプトーム解析

  • 実験医学増刊 エピゲノム研究 就職の全体像の理解から先制・個別化医療へ

    古川 亮平、八谷 剛史、清水 厚志, 羊土社, 2016年

    担当範囲: 全エピゲノム関連解析(EWAS)

論文 【 表示 / 非表示

  • Pmar1/phb homeobox genes and the evolution of the doublenegative gate for endomesoderm specification in echinoderms

    Yamazaki A., Morino Y., Urata M., Yamaguchi M., Minokawa T., Furukawa R., Kondo M., Wada H.

    Development (Cambridge) (Development (Cambridge))  147 ( 4 )  2020年

    ISSN  09501991

     概要を見る

    © 2020 Published by The Company of Biologists Ltd. In several model animals, the earliest phases of embryogenesis are regulated by lineage-specific genes, such as Drosophila bicoid. Sea urchin (echinoid) embryogenesis is initiated by zygotic expression of pmar1, a paired-class homeobox gene that has been considered to be present only in the lineage of modern urchins (euechinoids). In euechinoids, Pmar1 promotes endomesoderm specification by repressing the hairy and enhancer of split C (hesC) gene. Here, we have identified the basal echinoid (cidaroid) pmar1 gene, which also promotes endomesoderm specification but not by repressing hesC. A further search for related genes demonstrated that other echinoderms have pmar1-related genes named phb. Functional analyses of starfish Phb proteins indicated that, similar to cidaroid Pmar1, they promote activation of endomesoderm regulatory gene orthologs via an unknown repressor that is not HesC. Based on these results, we propose that Pmar1 may have recapitulated the regulatory function of Phb during the early diversification of echinoids and that the additional repressor HesC was placed under the control of Pmar1 in the euechinoid lineage. This case provides an exceptional model for understanding how early developmental processes diverge.

  • Transcriptomic analysis reveals differences in the regulation of amino acid metabolism in asexual and sexual planarians

    Sekii K., Yorimoto S., Okamoto H., Nagao N., Maezawa T., Matsui Y., Yamaguchi K., Furukawa R., Shigenobu S., Kobayashi K.

    Scientific Reports (Scientific Reports)  9 ( 1 ) 6132 2019年04月

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

     概要を見る

    © 2019, The Author(s). Many flatworms can alternate between asexual and sexual reproduction. This is a powerful reproductive strategy enabling them to benefit from the features of the two reproductive modes, namely, rapid multiplication and genetic shuffling. The two reproductive modes are enabled by the presence of pluripotent adult stem cells (neoblasts), by generating any type of tissue in the asexual mode, and producing and maintaining germ cells in the sexual mode. In the current study, RNA sequencing (RNA-seq) was used to compare the transcriptomes of two phenotypes of the planarian Dugesia ryukyuensis: an asexual OH strain and an experimentally sexualized OH strain. Pathway enrichment analysis revealed striking differences in amino acid metabolism in the two worm types. Further, the analysis identified serotonin as a new bioactive substance that induced the planarian ovary de novo in a postembryonic manner. These findings suggest that different metabolic states and physiological conditions evoked by sex-inducing substances likely modulate stem cell behavior, depending on their different function in the asexual and sexual reproductive modes. The combination of RNA-seq and a feeding assay in D. ryukyuensis is a powerful tool for studying the alternation of reproductive modes, disentangling the relationship between gene expression and chemical signaling molecules.

  • IMETHYL: An integrative database of human DNA methylation, gene expression, and genomic variation

    Komaki S., Shiwa Y., Furukawa R., Hachiya T., Ohmomo H., Otomo R., Satoh M., Hitomi J., Sobue K., Sasaki M., Shimizu A.

    Human Genome Variation (Human Genome Variation)  5   18008 2018年

    研究論文(学術雑誌), 共著, 査読有り

     概要を見る

    © 2018 Nature Publishing Group. All rights reserved. We launched an integrative multi-omics database, iMETHYL (http://imethyl.iwate-megabank.org). iMETHYL provides whole-DNA methylation (∼24 million autosomal CpG sites), whole-genome (∼9 million single-nucleotide variants), and whole-Transcriptome (>14 000 genes) data for CD4 + T-lymphocytes, monocytes, and neutrophils collected from approximately 100 subjects. These data were obtained from whole-genome bisulfite sequencing, whole-genome sequencing, and whole-Transcriptome sequencing, making iMETHYL a comprehensive database.

  • Characterization of TRPA channels in the starfish Patiria pectinifera: involvement of thermally activated TRPA1 in thermotaxis in marine planktonic larvae.

    Saito, S., Hamanaka, G., Kawai, N., Furukawa, R., Gojobori, J., Tominaga, M., Kaneko, H., Satta, Y.

    SCIENTIFIC REPORTS 7   315 - 321 2017年05月

    研究論文(学術雑誌),  ISSN  2045-2322

  • Genetic Predisposition to Ischemic Stroke: A Polygenic Risk Score.

    Hachiya, T., Kamatani, Y., Takahashi, A., Hata, J., Furukawa, R., Shiwa, Y., Yamaji, T., Hara, M., Tanno, K., Ohmomo, H., Ono, K., Takashima, N., Matsuda, K., Wakai, K., Sawada, N., Iwasaki, M., Yamagishi, K., Ago, T., Ninomiya, T., Fukushima, A., Hozawa, A., Minegishi, N., Satoh, M., Endo, R., Sasaki, M., Sakata, K., Kobayashi, S., Ogasawara, K., Nakamura, M., Hitomi, J., Kita, Y., Tanaka, K., Iso, H., Kitazono, T., Kubo, M., Tanaka, H., Tsugane, S., Kiyohara, Y., Yamamoto, M., Sobue, K., Shimizu, A.

    STROKE 48 ( 2 ) 253 - 258 2017年02月

    研究論文(学術雑誌),  ISSN  0039-2499

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KOARA(リポジトリ)収録論文等 【 表示 / 非表示

総説・解説等 【 表示 / 非表示

  • Echinodermata: The complex immune system in echinoderms (Advances in Comparative Immunology, 10.1007/978-3-319-76768-0_13)

    Smith L., Arizza V., Hudgell M., Barone G., Bodnar A., Buckley K., Cunsolo V., Dheilly N., Franchi N., Fugmann S., Furukawa R., Garcia-Arraras J., Henson J., Hibino T., Irons Z., Li C., Lun C., Majeske A., Oren M., Pagliara P., Pinsino A., Raftos D., Rast J., Samasa B., Schillaci D., Schrankel C., Stabili L., Stensv K., Sutton E.

    Coresource 1 (Coresource 1)   2018年01月

     概要を見る

    © Springer International Publishing AG, part of Springer Nature 2018. This chapter was inadvertently published with an incorrect spelling of the author's name as V. Arriza whereas it should be V. Arizza. In addition to this the affiliation of one of the chapter authors Elisse Sutton was published incorrectly and it has now been corrected to read as Department of Biological Sciences, Macquarie University, Sydney, NSW, Australia.

  • IMMオミックスリファレンスパネルの取り組み

    古川 亮平、清水 厚志

    生化学 88 ( 1 ) 36 - 43 2016年

    総説・解説(学術雑誌), 共著

研究発表 【 表示 / 非表示

  • イトマキヒトデの変態初期過程のトランスクリプトーム解析

    田口瑞姫、田中啓介、佐藤晴香、志波優、伊藤武彦、古川亮平

    日本動物学会 第91回大会, 2020年09月, ポスター(一般)

  • イトマキヒトデの変態を誘起するバクテリアの同定と変態過程のステージ分類

    佐藤晴香、田口瑞姫、金子洋之、古川亮平

    日本動物学会関東支部 第72回大会, 2020年03月, ポスター(一般)

  • ビピンナリア期からブラキオラリア期へ:ヒトデ幼生の身体サイズの増加と神経ネットワーク形成

    古川亮平、田口瑞姫、田内珠子、倉石立、金子洋之

    日本動物学会 第90回 大阪大会, 2019年09月, 口頭(一般)

  • プラナリア有性化におけるアミノ酸の役割

    清水辰海、江川碧唯、石川正樹、関井清乃、古川亮平、小林一也、石田哲夫、前澤孝信

    2019年09月, 口頭(一般)

  • プラナリア有性化因子の給餌刺激で発現が誘導される遺伝子について

    黒田道生、成田美優、萬田冴佳、頼本隼汰、山口勝司、重信秀治、古川亮平、関井清乃、小林一也

    2019年09月, 口頭(一般)

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競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • ヒトデ幼生の自己・非自己認識に関わる種特異的糖鎖の探索

    2020年04月
    -
    2023年03月

    古川亮平, 補助金,  代表

  • 海洋プランクトン幼生の成長:摂餌の消化・吸収と栄養素の伝播・受容

    2018年04月
    -
    2021年03月

    科学研究費補助金(文部科学省・日本学術振興会), 金子 洋之, 補助金,  分担

  • DNAメチル化・トランスクリプトーム・血漿メタボロームの3層オミックス解析を用いた電気加熱式たばこの喫煙・受動喫煙の県境影響に関する疫学研究

    2018年04月
    -
    2020年03月

    日本医療研究開発機構, 循環器疾患・糖尿病等生活習慣病対策実用化研究事業, 武林 亨, その他,  分担

  • ヒトデ幼生のマクロファージ遊走阻止因子による炎症制御機構の解明

    2017年04月
    -
    2020年03月

    科学研究費補助金(文部科学省・日本学術振興会), 補助金,  代表

  • 変態を経て変化する棘皮動物人での自然免疫系の分子基盤を探る

    2009年04月
    -
    2012年03月

    科学研究費補助金(文部科学省・日本学術振興会), 補助金,  代表

受賞 【 表示 / 非表示

  • 日本比較免疫学会 古田優秀論文賞

    古川 亮平, 2016年08月, 日本比較免疫学会, 2つのマクロファージ遊走阻止因子がヒトデ幼生の間充織細胞の走化性を制御する

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  • 日本比較免疫学会 古田奨励賞

    古川 亮平, 2009年08月, ヒトデ胚の間充織細胞におけるApDOCKタンパク質の構造及び発現解析

    受賞区分: 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

 

担当授業科目 【 表示 / 非表示

  • 総合教育セミナーⅡ

    2020年度

  • 生物学Ⅱ(実験を含む)

    2020年度

  • 生物学Ⅰ(実験を含む)

    2020年度

 

所属学協会 【 表示 / 非表示

  • 日本比較免疫学会

     
  • 日本動物学会

     

委員歴 【 表示 / 非表示

  • 2016年09月
    -
    継続中

    役員, 日本比較免疫学会