Harada, Ayaka

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Affiliation

Faculty of Pharmacy, Department of Pharmaceutical Sciences 生命機能物理学講座 (Shiba-Kyoritsu)

Position

Research Associate/Assistant Professor/Instructor

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東京都港区芝公園1-5-30

Telephone No.

+81-3-5400-2490

Career 【 Display / hide

  • 2014.04
    -
    2016.03

    総合研究大学院大学, Japan Society for the Promotion of Science, Research Fellowships for Young Scientists

  • 2016.10
    -
    2019.09

    高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所 構造生物学研究センター, 研究員

  • 2019.10
    -
    Present

    慶應義塾大学, 薬学部 生命機能物理学講座, 助教

Academic Background 【 Display / hide

  • 2013.04
    -
    2016.09

    The Graduate University for Advanced Studies, 高エネルギー加速器科学研究科, 物質構造科学専攻

    日本, Graduate School, Completed, Doctoral course

Academic Degrees 【 Display / hide

  • 博士(学術), The Graduate University for Advanced Studies, Coursework, 2016.09

 

Research Areas 【 Display / hide

  • Structural biochemistry

Research Keywords 【 Display / hide

  • Native-SAD法

  • X線結晶構造解析

  • 生物物理学

 

Papers 【 Display / hide

  • Characterization of Heme Orientational Disorder in a Myoglobin Reconstituted with a Trifluoromethyl-Group-Substituted Heme Cofactor

    Y. Kanai, A. Harada, T. Shibata, R. Nishimura, K. Namiki, M. Watanabe, S. Nakamura, F. Yumoto, T. Senda, A. Suzuki, S. Neya, and Y. Yamamoto

    Biochemistry 56 ( 34 ) 4500 - 4508 2017.08

    Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

  • The crystal structure of a new O-demethylase from Sphingobium sp. strain SYK-6

    A. Harada, N. Kamimura, K. Takeuchi, H. Y. Yu, E. Masai, and T. Senda

    FEBS Journal 284 ( 12 ) 1855 - 1867 2017.01

    Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

  • Overcoming a hemihedral twinning problem in tetrahydrofolate-dependent O-demethylase crystals by the microseeding method

    A. Harada, Y. Sato, N. Kamimura, N. Venugopalan, E. Masai, and T. Senda

    Acta Crystallographica Section F 72 ( 12 ) 897 - 902 2016.12

    Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

  • Complete pyridine-nucleotide-specific conversion of an NADH-dependent ferredoxin reductase

    A. Nishizawa, A. Harada, M. Senda, Y. Tachihara, D. Muramatsu, S. Kishigami, S. Mori, K. Sugiyama, T. Senda, and S. Kimura

    Biochemical Journal 462 ( 2 ) 257 - 265 2014.09

    Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

  • Structural basis of the γ-lactone-ring formation in ascorbic acid biosynthesis by the senescence marker protein-30/gluconolactonase

    S. Aizawa, M. Senda, A. Harada, N. Maruyama, T. Ishida, T. Aigaki, A. Ishigami, and T. Senda

    PLos ONE 8 ( 1 ) e53706 2013.01

    Research paper (scientific journal), Joint Work, Accepted

Reviews, Commentaries, etc. 【 Display / hide

  • SMP30の生理学的機能解明に向けた構造解析

    原田彩佳, 相澤真悟, 千田美紀, 丸山直記, 石神昭人, 千田俊哉

    Photon Factory Activity Report (高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所 放射光科学研究施設)   2013

    Other article

  • Crystal structure analysis of mouse SMP30

    Ayaka Harada, Shingo Aizawa, Miki Senda,Naoki Maruyama, Akito Ishigami, Toshiya Senda

    Photon Factory Activity Report (高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所 放射光科学研究施設)   2012

    Other article, Joint Work

Presentations 【 Display / hide

  • Native-SAD phasing at Photon Factory

    Ayaka Harada, Naohiro Matsugaki, Masahide Hikita, Yusuke Yamada, Toshiya Senda

    The 13th international conference on biology and synchrotron radiation (Shanghai) , 2019.09, Oral Presentation(guest/special)

  • 深紫外レーザー加工を行った結晶を利用したNative-SAD法による位相決定

    原田彩佳,松垣直宏,引田理英,山田悠介,千田俊哉

    第92回日本生化学会大会 (横浜) , 2019.09, Oral Presentation(general)

  • X線結晶構造解析を利用したGTPセンサーの分子進化の解明に向けて

    原田彩佳,千田俊哉

    第41回日本分子生物学会年会 (横浜) , 2018.01, Symposium, Workshop, Panelist (nomination)

  • Laser processing of protein crystals for native SAD data collection

    原田彩佳, 松垣直宏, 河野能顕, 山本雅貴, 千田俊哉

    第55回日本生物物理学会年会, 2017.09, Oral Presentation(general)

  • ビタミンC合成におけるSMP30によるγラクトン環形成の構造的基盤

    原田彩佳, 相澤真悟, 千田美紀, 丸山直記, 石田哲夫, 石神昭人, 千田俊哉

    第85回日本生化学会大会, 2012.12, Oral Presentation(general)

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Research Projects of Competitive Funds, etc. 【 Display / hide

  • SMP30/GNLとGLOを例にした不安定中間代謝の輸送メカニズムの解明

    2014.04
    -
    2016.03

    日本学術振興会, 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費, 原田彩佳, Research grant, Principal Investigator

Awards 【 Display / hide

  • Journal on Structural Dynamics poster prize

    2016.07, American Crystallographic Association

    Type of Award: Awards of International Conference, Council and Symposium

  • 丹羽保次郎賞

    2013.03, 東京電機大学

    Type of Award: Other Awards

  • 鈴木紘一メモリアル賞

    2011.09, 日本生化学会

    Type of Award: Awards of National Conference, Council and Symposium

 

Courses Taught 【 Display / hide

  • STUDY OF MAJOR FIELD:(PHYSICS FOR LIFE FUNCTIONS)

    2020

  • SEMINAR:(PHYSICS FOR LIFE FUNCTIONS)

    2020

  • RESEARCH FOR BACHELOR'S THESIS 1

    2020

  • PHYSICAL CHEMISTRY 3

    2020

  • PHARMACEUTICAL-ENGLISH SEMINAR

    2020

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Courses Previously Taught 【 Display / hide

  • 実験法概論

    慶應義塾大学, 2019, Autumn Semester, Lecture, Within own faculty

  • 薬学基礎実習

    慶應義塾大学, 2019, Autumn Semester, Laboratory work/practical work/exercise, Within own faculty

 

Social Activities 【 Display / hide

  • PF-UA タンパク質結晶構造解析 第1回中級者講習会  講師

    PF-UA タンパク質結晶構造解析ユーザーグループ, S-SAD法による位相決定 (東京医科歯科大学)

    2016.06
  • PF-UA タンパク質結晶構造解析 第4回中級者講習会 パネリスト

    PF-UA タンパク質結晶構造解析ユーザーグループ, 精密化はいつ完了したと言えるか (東京大学山上会館)

    2019.10
  • 女子中高生夏の学校 運営支援

    NPO法人女子中高生理工系キャリアパスプロジェクト, 女子中高生夏の学校2019 (国立女性教育会館)

    2019.08
  • 実験イベント 実験支援

    多摩六都科学館, イマドキの生物学者になってみよう~タンパク質の結晶を作ろう~ (多摩六都科学館)

    2019.05
  • 実験イベント 実験支援

    筑波大学 科学技術人材育成プログラム, つくばSKIPアカデミー (高エネルギー加速器研究機構)

    2019.01

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Memberships in Academic Societies 【 Display / hide

  • 日本結晶学会, 

    2019
    -
    Present
  • 日本分子生物学会, 

    2019
    -
    Present
  • 日本生化学会, 

    2019
    -
    Present
  • 日本蛋白質科学会, 

    2017
    -
    Present
  • American Crystallographic Association, 

    2016
    -
    Present