研究発表 - 堀田 耕司
-
野外実習における VRinkai を通じた一貫教育校との連携事例
堀田耕司
一貫教育校と大学自然科学研究教育センターの 自然科学教育に関するワークショップ(第 12 回),
2024年11月,口頭発表（一般）
-
Application of the online teaching material for biological course to secondary education and construction of the English version
Shito, T.T. a, Totsuka, N.M. a, Kogure, Y.S. a, Mizutani, H. a, Takahashi, M. a, Ueda, L.L. a, Furukawa, R. b,Togane, D. b, Kuraishi R. b, Fujita, R. c, Fujisawa, Y. d, Yazawa, K. c, Uchiyama, M. e and Hotta, K
The 29th Biennial Conference of Asian Association for Biology Education,
2024年10月,口頭発表（一般）
-
Let’s try VRinkai!! –online teaching material for field biological course–
Shito, T.T., Totsuka, N.M., Kogure, Y.S., Mizutani, H., Takahashi, M., Ueda, L.L., Furukawa, R.,Togane, D., Kuraishi R., Fujita, R., Fujisawa, Y., Yazawa, K., Uchiyama, M. and Hotta, K.
The 29th Biennial Conference of Asian Association for Biology Education,
2024年10月,口頭発表（一般）
-
ホヤの卵からみた生体透明性獲得機構の研究
堀田耕司,紫藤拓己,宮坂駿佑
生殖若手の会,
2024年09月,口頭発表（一般）
-
Axial Rotation Consisted of Nodal-dependent Different Components, Clockwise Twisting and Bending
Yuki Kogure,Satoru Okuda,Kotaro Oka,Kohji Hotta
Self-Organization in Biology: Freiburg Spemann-Mangold Centennial Symposium 2024,
2024年09月,ポスター発表
-
自律的にCa2+振動するホヤ幼生運動神経細胞のシングルセル解析
高橋茉莉奈，内海円花，紫藤拓巳，戸塚望，小暮悠暉，岡浩太郎，堀田耕司
日本動物学会第95回長崎大会,
2024年09月,口頭発表（一般）
-
Marina Takahashi, Madoka Utsumi, Takumi Shito, Nozomu Totsuka, Yuki Kogure, Kotaro Oka, Kohji Hotta
12th International Tunicate Meeting,
2024年07月,ポスター発表
-
Hina Mizutani, Nozomu M. Totsuka, Madoka K. Utsumi, Kotaro Oka, Kohji Hotta
12th International Tunicate Meeting,
2024年07月,ポスター発表
-
Understanding Evolution and Development of Aquatic Organismal Transparency
Kohji Hotta, Shunsuke O. Miyasaka, Kotaro Oka and Takumi T. Shito
12th International Tunicate Meeting,
2024年06月,口頭発表（一般）
-
Nozomu M. Totsuka, Satoshi Kuwana, Satoshi Sawai, Kotaro Oka, Yasunori Sasakura and Kohji Hotta
NBRPホヤ主催オンラインセミナー,
2024年04月,その他
-
脊椎動物の発生・進化および生物多様性の解明
髙橋茉莉奈、内海円花、戸塚望、小暮悠暉、紫藤拓巳、堀田耕司
第６回ホヤ研究会,
2023年11月,口頭発表（一般）
-
ホヤ変態時に観察されたCa2+シグナル表皮伝搬および非自己テスト細胞と自己被嚢細胞の体外における置き換わり
戸塚望, 土方希, 塩井剛, 渡邉朋信, 岡浩太郎, 笹倉靖徳, 堀田耕司
日本比較免疫学会第34回学術集会,
2023年09月,口頭発表（一般）
-
Nozomu M. Totsuka, Go Shioi, Tomonobu M. Watanabe, Kotaro Oka, Yasunori Sasakura and Kohji Hotta
Society for Developmental Biology 82nd Annual Meeting,
2023年07月,ポスター発表
-
Evolutionary Conservation of Shaping Tailbud Embryo in Two Different Ascidians, Ciona intestinalis type A and Ascidiella aspersa.
Yuki S. Kogure, Takumi T. Shito, Kotaro Oka, Kohji Hotta
Society for Developmental Biology 82nd Annual Meeting,
2023年07月,ポスター発表
-
The timing of the replacement of the non-self-test cells and the self-tunic cells during ascidian Ciona metamorphosis.
Nozomu M. Totsuka, Nozomi Hijikata, Kotaro Oka, Yasunori Sasakura and Kohji Hotta
Society for Developmental Biology 82nd Annual Meeting,
2023年07月,ポスター発表
-
Deciphering the whole genome sequence and the construction of gene models of Ascidiella aspersa as a new model organism for developmental biology.
Takumi T. Shito, Jayakumar Vasanthan, Shimon Kawai, Koki Nishitsutsuji, Noriyuki Satoh, Yasubumi Sakakibara, Kotaro Oka, Kohji Hotta
Society for Developmental Biology 82nd Annual Meeting,
2023年07月,ポスター発表
-
ホヤ変態開始時の表皮Ca2+波伝播および間充織細胞の溢出の動態解析
戸塚望, 土方希, 塩井剛, 渡邉朋信, 岡浩太郎, 笹倉靖徳, 堀田耕司
シンギュラリティ領域会議 成果公開シンポジウム,
2023年03月,ポスター発表
-
Transition of neural activities during the development of Half Center Modeled swimming CPG in Ciona intestinalis type A.
Madoka K. Utsumi, Kotaro Oka, Kohji Hotta
Society for Neuroscience 52nd Annual Meeting,
2022年11月,ポスター発表
-
Thaping the tailbud embryo of the ascidian, Ciona intestinalis type A - The mechanism of the ventroflexion, the twisting and the dorsiflexion -.
Yuki S. Kogure, Hiromochi Muraoka, Wataru C. Koizumi, Raphaël Gelin-alessi, Benoit Godard, C. P. Heisenberg, Kotaro Oka and Kohji Hotta
日仏合同発生生物学会,
2022年11月,ポスター発表
-
A single motor neuron determines the rhythm of early motor behavior in Ciona.
Taichi Akahoshi, Madoka K Utsumi, Kouhei Oonuma, Makoto Murakami, Takeo Horie, Takehiro G Kusakabe, Kotaro Oka, Kohji Hotta
International Congress Neuroethology 2022,
2022年07月,口頭発表（一般）
-
Transition of neural activities during the development of Ciona swimming CPG.
Madoka K. Utsumi, Yusuke Tomina, Hideharu Mikami, Kotaro Oka, Kohji Hotta
International Congress Neuroethology 2022,
2022年07月,口頭発表（一般）
-
The construction of the standard developmental table and the online 3D anatomical image resource of the transparent ascidian Ascidiella aspersa.
Takumi Shito, Haruka Funakoshi, Kotaro Oka, Kohji Hotta
Society for Developmental Biology 81st Annual Meeting Pan-American Society for Evolutionary Developmental Biology Meeting 4th Biennial Meeting,
2022年07月,ポスター発表
-
A single motor neuron determines the rhythm of early motor behavior in Ciona.
Taichi Akahoshi, Madoka K Utsumi, Kouhei Oonuma, Makoto Murakami, Takeo Horie, Takehiro G Kusakabe, Kotaro Oka, Kohji Hotta
11th International Tunicate Meeting,
2022年07月,口頭発表（一般）
-
G-protein signaling relay promotes Ciona metamorphosis.
Yasunori Sasakura, Akiko Hozumi, Arata Onodera, Nozomu M. Totsuka, Honoo Satake, Kohji Hotta, and Takeo Horie
11th International Tunicate Meeting,
2022年07月,口頭発表（一般）
-
Admp controls the pMLC localization to the apical side of the ventral epidermal cells and leads the ventral tail bending in ascidian tailbud embryo.
Yuki S. Kogure, Hiromochi Muraoka, Wataru C. Koizumi, Raphaël Gelin-alessi, Benoit Godard, C. P. Heisenberg, Kotaro Oka and Kohji Hotta
11th International Tunicate Meeting,
2022年07月,口頭発表（一般）
-
Timing of the replacementreplacement of the non-self-test cells and the self-tunic cells during ascidian Ciona metamorphosis.
Nozomu M. Totsuka, Nozomi Hijikata, Kotaro Oka, Yasunori Sasakura and Kohji Hotta
11th International Tunicate Meeting,
2022年07月,口頭発表（一般）
-
Admp regulates tail bending by controlling the intercalation of the ventral epidermis through myosin phosphorylation.
Yuki S. Kogure, Hiromochi Muraoka, Wataru C. Koizumi, Raphaël Gelin-alessi, Benoit Godard, C. P. Heisenberg, Kotaro Oka and Kohji Hotta
EURO EVO DEVO 2022,
2022年05月-2022年06月,口頭発表（一般）
-
A single motor neuron determines the rhythm of early motor behavior in Ciona.
Kohji Hotta, Kohei Oonuma, Makoto Murakami, Takehiro G. Kusakabe, Takeo Horie, Taichi Akahoshi, Madoka K. Utsumi, Kotaro Oka
EURO EVO DEVO 2022,
2022年05月-2022年06月,口頭発表（一般）
-
Phylogenetic comparison of ascidian eggs transparency and analysis of the UV transmittance in ascidians.
Takumi T. Shito, Naohiro Hasegawa, Noburu Sensui, Euichi Hirose, Kotaro Oka, and Kohji Hotta
EURO EVO DEVO 2022,
2022年05月-2022年06月,ポスター発表
-
Transition in Neural Activities during late developmental stages of Ciona Motor Circuit.
Madoka K. Utsumi, Yusuke Tomina, Hideharu Mikami, Kotaro Oka, Kohji Hotta
EURO EVO DEVO 2022,
2022年05月-2022年06月,ポスター発表
-
Admp regulates ventral tail bending by controlling the cell polarity of the ventral epidermis through myosin phosphorylation.
Yuki Kogure, Hiromochi Muraoka, Wataru C. Koizumi, Raphaël Gelin-alessi, Benoit Godard, Kotaro Oka, Carl-Philipp Heisenberg, Kohji Hotta
3rd JSDB-GfE Young Scientist Exchange Meeting (JSDB & GfE),
2021年11月,口頭発表（一般）
-
Ca2+ signaling contributes the beginning of metamorphosis via mechanical stimuli in palps.
Maiki Wakai, Kohji Hotta, and Kotaro Oka
10th International Tunicate Meeting,
2019年07月,口頭発表（一般）
-
Comparative Anatomy of Ascidian Miniature Tailbud.
Kaoru Matsumura, Mitsuru J. Nakamura, Wataru Koizumi, Kohji Hotta and Kotaro Oka
10th International Tunicate Meeting,
2019年07月,ポスター発表
-
Relationship between Tail Beating and Ca2+ Oscillation in the Motor Ganglion of Developing Ascidian Embryo.
Taichi Akahoshi, Kohji Hotta, and Kotaro Oka
10th International Tunicate Meeting,
2019年07月,ポスター発表
-
Relationship between swimming behavior and Ca2+ oscillation in the visceral ganglion of developing ascidian embryo.
Akahoshi T, Hotta K, Oka K
GfE school Imaging and Modeling Development,
2018年10月,口頭発表（一般）
-
SPATIOTEMPORAL CHANGE IN CELL STIFFNESS DURING EARLY EMBRYOGENESIS INVESTIGATED BY ATOMIC FORCE MICROSCOPY.
Yuki Fujii, Taichi, Imai, Wataru Koizumi, Kohji Hotta, Kotaro Oka, Takaharu Okajima
62nd Annual Meeting Biophysical Society (BPS18) ,
2018年02月,ポスター発表
-
BHF MEDIATES INDUCTION AND LOSS OF TOLERANCE IN Botryllus schlosseri CHIMERAS
Ayelet Voskoboynik, Mark Kowarsky, Benyamin Rosental, Aaron M. Newman, Kohji Hotta, Katherine J. Ishizuka, Karla J. Palmeri, Norma F. Neff, Stephen R. Quake & Irving L. Weissman
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月 -
AMPA glutamate receptors are essential for sensory-organ formation and morphogenesis in the basal chordate.
Shinobu Hirai, Kohji Hotta, Yoshihiro Kubo, Atsuo Nishino, Shigeo Okabe, Yasushi Okamura and Haruo Okado
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,ポスター発表
-
Morphometry of Tailbud Embryo for Revealed Distinct Role on Tail Curving by Myosin-Dependent Mechanical Tension at Ventral Midline Epidermis.
Hiromochi Muraoka, Wataru Koizumi , Benoit Godard , Kohji Hotta, Carl Philipp-Heisenberg and Kotaro Oka
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,ポスター発表
-
Chemical genetics reveal the role of 14-3-3 ea in Ciona notochord tubulogenesis.
Yuji Mizotani, Mayu Suzuki, Hidenori Watanabe, Kogiku Shiba, Kazuo Inaba, Kohji Hotta, Kotaro Oka, Etsu Tashiro and Masaya Imoto
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,ポスター発表
-
The molecular signatures of development in Botryllus schlosseri.
Mark Kowarsky, Kohji Hotta, Lucia Manni, Chiara Anselmi, Norma F. Neff, Katherine J. Ishizuka, Karla J. Palmeri, Jennifer Okamoto, Stephen R. Quake, Irving L. Weissman and Ayelet Voskoboynik
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,ポスター発表
-
Spatio-Temporal Relationship between Dynamics of Actin Cytoskeleton and Cell Stiffness in Early Ascidian Embryo Development.
Taichi Imai, Wataru Koizumi, Yuki Fujii, Kohji Hotta, Takaharu Okajima and Kotaro Oka
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,口頭発表（一般）
-
TailbudProfiler: developing an automatic image analysis software for quantifying Ascidian tailbud morphogenesis.
Raphael Gelin-Alessi, Hiromochi Muraoka, Kohji Hotta and Kotaro Oka
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,ポスター発表
-
The Botryllus schlosseri embryogenesis timeline reveals heterochrony between solitary and colonial ascidian embryogenesis.
Chiara Anselmi, Kohji Hotta, Mark Kowarsky, Lucia Manni , Katherine J. Ishizuka, Karla J. Palmeri, Stephen R. Quake, Irving L. Weissman and Ayelet Voskoboynik
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,ポスター発表
-
The ontology of larval and metamorphosis stages in Ciona. II. Anatomy.
Lucia Manni , Delphine Dauga and Kohji Hotta
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,口頭発表（一般）
-
Comprehensive characterization of Ca2+ transients in early Ascidian development.
Taichi Akahoshi, Kohji Hotta and Kotaro Oka
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,口頭発表（一般）
-
Cleavage plane positioning in early ascidian embryos.
Benoit G. Godard, Kohji Hotta, Nicolas Minc and Carl-Philipp Heisenberg
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,口頭発表（一般）
-
The ontology of larval and metamorphosis stages in Ciona. I. Development.
Kohji Hotta
The 9th International Tunicate Meeting,
2017年07月,口頭発表（一般）
-
BHF MEDIATES INDUCTION AND LOSS OF TOLERANCE IN Botryllus schlosseri CHIMERAS
堀田 耕司
North America Comparative Immunology Workshop 2017,
2017年06月 -
The complete annotation of Ciona development and anatomy: the larval and metamorphosis stages.
堀田 耕司
the Italian Embryology Group Meeting,
2017年06月,口頭発表（一般）
-
Relationship between dynamics of cytoskeleton and cell stiffness in early ascidian embryo development.
堀田 耕司
The 22nd International Congress of Zoology, The 87th Meeting of The Zoological Society of Japan Joint Events in Okinawa,
2016年11月 -
In vivo-Imaging Analysis of Calcium Transients in Early Development of Ascidian Embryo.
堀田 耕司
The 22nd International Congress of Zoology, The 87th Meeting of The Zoological Society of Japan Joint Events in Okinawa （沖縄） ,
2016年11月,ポスター発表
-
Morphometry of tailbud embryo for understanding mechanism of conserved chordate phylotypic embryo shape.
堀田 耕司
The 22nd International Congress of Zoology, The 87th Meeting of The Zoological Society of Japan Joint Events in Okinawa,
2016年11月,ポスター発表
-
Mechanical properties of early ascidian embryos.
堀田 耕司
8th Tunicate Meeting （Aomori City Cultural Hall、青森） ,
2015年06月,ポスター発表
-
Comparative Anatomy of Ascidian Miniature Tailbud.
堀田 耕司
7th Tunicate Meeting （ナポリ大学、ナポリ、イタリア） ,
2013年07月,ポスター発表
-
Imaging Analysis of Peripheral Nervous System in Ciona intestinalis larva.
堀田 耕司
ナポリ大学、ナポリ、イタリア,
2013年07月,ポスター発表
-
Four-dimensional Imaging of Brain Morphogenesis in Ciona intestinalis.
堀田 耕司
7th International Tunicate Meeting （Napli, Italy） ,
2013年07月,口頭発表（一般）
-
Comparative Anatomy of Ascidian Miniature Tailbud.
堀田 耕司
Riken CDB meeting 2013 （理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター（神戸）） ,
2013年03月,ポスター発表
-
Anatomy and Annotation of the Ciona intestinalis tailbud embryo at single-cell resolution.
堀田 耕司
2nd workshop tunicate info system （京都大学理学部） ,
2012年11月,口頭発表（一般）
-
Three-Dimensional Anatomy of the Ciona intestinalis Tailbud Embryo at Single-cell Resolution.
堀田 耕司
2012 Asia-Pacific Developmental Biology Conference (APDBC) （台北谷國際會議中心） ,
2012年10月,口頭発表（一般）
-
Construction of 3D Virtual Tailbud Embryo For Quantitative Approach.
堀田 耕司
CDB Symposium 2012 "Quantitative Developmental Biology" （理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター） ,
2012年03月,ポスター発表
-
カタユウレイボヤ尾芽胚の１細胞レベルイメージングと３Dコンピュータ・モデリングによる形態解析
堀田 耕司
生物物理学会シンポジウム 一個体イメージング （兵庫県立大学姫路キャンパス） ,
2011年09月,口頭発表（招待・特別）
-
Analysis of phenotype caused by temporal treatment of SU4984 in Ciona intestinalis embryo
堀田 耕司
The 6th International Tunicate Meeting （McGill Univ., Montreal, Canada） ,
2011年07月,口頭発表（一般）
-
Construction of 3D Virtual Tailbud Embryo For Quantitative Approach
堀田 耕司
CDB Symposium 2012 "Quantitative Developmental Biology" （理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター（神戸）） ,
2011年03月,ポスター発表
-
カタユウレイボヤ尾芽胚の３次元モデリング
堀田 耕司
画像科学シンポジウム・バイオイメージングフォーラム （自然科学研究機構岡崎コンファレンスセンター） ,
2011年03月,口頭発表（招待・特別）
-
Current status of tunicate databases, FABA
堀田 耕司
1st Tunicate Information System Meeting （Nice, France） ,
2010年11月,口頭発表（招待・特別）
-
ACBD: Database for Ascidian Chemical Genomics
Yuichiro Hira, Jun Terai, Mitsuru Nakamura, Etsu Tashiro, Masaya Imoto, Kotaro Oka, Kohji Hotta>
BioCuration Meeting （東京国際交流館） ,
2010年10月,ポスター発表
-
CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein Database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses, and curated annotation, with ability for user rating and comments
Toshinori Endo, Keisuke Ueno, Kouki Yonezawa, Katsuhiko Mineta, Kohji Hotta, Yutaka Satou, Lixy Yamada, Michio Ogasawara, Hiroki Takahashi, Ayako Nakajima, Mia Nakachi, Mamoru Nomura, Junko Yaguchi, Alu Konno, Yasunori Sasakura, Akiyasu C. Yoshizawa, Hisaaki Taniguchi, Chisato Yamasaki, Miho Sera, Tadashi Imanishi and Kazuo Inaba
Beyond the Genome: The true gene count, human evolution and disease genomics （Joseph B. Martin Conference Center, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts） ,
2010年10月,ポスター発表
-
ASNET: Actin-based network structure in the tunic of ascidian larva
Kohji HOTTA, Hiroshi Q TERAKUBO, Mitsuru Nakamura, Yoko NAKAJIMA, Yasunori SASAKURA, Takeo HORIE, Alu KONNO, Hiroki TAKAHASHI, Kazuo INABA, Kotaro OKA
Society for Developmental Biology 69th Annual Meeting -Jointly with Japanese Society of Developmental Biologists （Albuquerque, New Mexico, USA） ,
2010年08月,ポスター発表
-
Quantitative analysis of ascidian tailbud stage embryo at single cell level by constructing 3D Virtual Embryo
Mitsuru Nakamura, Jun Terai, Kohji Hotta and Kotaro Oka
Society for Developmental Biology 69th Annual Meeting -Jointly with Japanese Society of Developmental Biologists （Albuquerque, New Mexico, USA） ,
2010年08月,ポスター発表
-
FGFR inhibitor affect proliferation of tail epidermal cells and cause neural tube closure defect in ascidian Ciona intestinalis
Jun Terai, Mayu Suzuki, Masaya Imoto, Etsu Tashiro, Kotaro Oka, Kohji Hotta
Society for Developmental Biology 69th Annual Meeting -Jointly with Japanese Society of Developmental Biologists （Albuquerque, New Mexico, USA） ,
2010年08月,ポスター発表
-
ACDB: Database for Ascidian Chemical Genomics
Kohji Hotta, Yuichiro Hira, Etsu Tashiro, Masaya Imoto, Kotaro Oka
Society for Developmental Biology 69th Annual Meeting -Jointly with Japanese Society of Developmental Biologists （Albuquerque, New Mexico, USA） ,
2010年08月,ポスター発表
-
CIONA INTESTINALIS PROTEIN DATABASE CIPRO SHOWS A VARIETY OF PROTEOMES FOR A SINGLE SPECIES
Toshinori Endo, Keisuke Ueno, Kouki Yonezawa, Katsuhiko Mineta, Kohji Hotta, Yutaka Satou, Lixy Yamada, Michio Ogasawara, Hiroki Takahashi, Ayako Nakajima, Mia Nakachi, Mamoru Nomura, Junko Yaguchi, Alu Konno, Yasunori Sasakura, Akiyasu Yoshizawa, Hisaaki Taniguchi, Tadashi Imanishi and Kazuo Inaba
Computational Biology Research Center Workshop 2010 （Computational Biology Research Center, Tokyo Japan） ,
2010年07月,ポスター発表
-
Actin-based network structure in the tunic of ascidian larva revealed by confocal laser scanning and transmission electron microscopes
KOHJI HOTTA, Hiroshi Terakubo, Yoko Nakajima, Yasunori Sasakura, Takeo Horie, Alu Konno, Hiroki Takahashi, Kazuo Inaba, Kotaro Oka
43rd Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists Jointly Sponsored by the Asia-Pacific Developmental Biology Network （Kyoto, International Conference Center） ,
2010年06月,ポスター発表
-
Ascidian dendritic network in tunic
Kohji HOTTA, Hiroshi Q TERAKUBO, Yoko NAKAJIMA, Alu KONNO, Takeo HORIE, Hiroki TAKAHASHI, Yasunori SASAKURA, Kazuo INABA, Kotaro OKA
2ND JOINT MEETING OF THE SFBD AND JSDB 2010 - From Cells to Organs （Institut Pasteur, Paris, France） ,
2010年05月,ポスター発表