競争的研究費の研究課題 - 大家　基嗣

腎細胞癌の免疫環境と血管新生阻害後のリモデリングの統合的解析による新規治療の開発

2018年04月

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2021年03月

文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 大家　基嗣、三上 修治, 浅沼 宏, 菊地 栄次, 水野 隆一, 小坂 威雄, 篠島 利明, 田中 伸之, 基盤研究(B), 補助金,  研究代表者

腎細胞癌における血管新生阻害薬に対する耐性の機序の解明と新規治療の探索

2015年04月

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2018年03月

文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 大家　基嗣, 基盤研究(B), 補助金,  研究代表者

腎細胞癌における上皮間葉転換に着目した新規標的分子の探索

2013年04月

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2015年03月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 大家　基嗣, 基盤研究（Ｂ）, 補助金,  研究代表者

泌尿器がんのクローン進化と腫瘍間質の空間解析による免疫治療耐性メカニズムの解明

2024年04月

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2028年03月

大家 基嗣, 基盤研究(A), 補助金,  研究代表者

腎癌におけるlong non-coding RNAの臨床的意義の解明

2021年04月

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2024年03月

慶應義塾大学, 久冨木原 良平、大家 基嗣, 田中 伸之, 基盤研究(C), 未設定

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Long non-coding RNA (lncRNA)と癌の関連は様々な癌種で報告され始めているが、その機能解析は未だ不十分である。今回我々は、分子標的療法が治療軸を担っている進行性腎癌に着目し、lncRNAとの関連を明らかにすべきと考えた。ハイスループットな新規RNA detection systemと膨張顕微鏡法(expansion microscopy)を組み合わせることで、lncRNAの細胞内局在を定量的に可視化して機能解析を進める。

新規3次元イメージングによる腎がん微小脈管の異質性解析

2021年04月

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2024年03月

慶應義塾大学, 桝田 司、大家 基嗣, 田中 伸之, 基盤研究(C), 未設定

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本研究は、ヒト腎がんに拡がる腫瘍内脈管構造（血管/リンパ管）およびB細胞の集簇である、Tertiary Lymphoid Structure (TLS)を３次元で可視化し、その特徴を１細胞レベルの解像度で解析することで、組織型・臓器特異的なヒト腎がんの病態解明に努める。また分子標的治療が行われた腎がんの脈管構造も３次元で評価し、治療後の壊死組織中の極度の低酸素・低栄養に曝露される癌微小環境で、幹細胞性の維持や腫瘍増殖の原動力を担う腫瘍脈管に一体何が起きているのかを空間的に解き明かす。最終的に、分子標的治療後の腫瘍空間で生き残る癌細胞や浸潤免疫細胞で構成される異質な細胞ニッチを立体的に再現する。

難治性前立腺癌のシングルセル解析によるゲノムエピゲノム進化と腫瘍内不均一性の解明

2020年04月

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2023年03月

慶應義塾大学, 科学研究費助成事業, 小坂 威雄、植田 幸嗣, 西原 広史, 三上 修治, 田中 伸之, 大家 基嗣, 基盤研究(B), 未設定

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進行前立腺がんの薬物療法は近年大きく進歩し、新規アンドロゲン受容体阻害薬に加え、新規タキサン系抗がん剤カバジタキセルが導入されたが効果は限定的である。本研究では最先端の流体力学に基づく血中からの血液循環腫瘍細胞濃縮システムを駆使して前立腺癌患者からリアルタイムに血液循環腫瘍細胞を回収し、シングルセルレベルで多層性解析をを実施する。同時に逐次的に血中のcfDNAを回収し、治療前後の腫瘍検体の免疫組織学的にまた、FFPE検体のDNA/RNA解析を施行することで、難治性前立腺癌におけるゲノム・エピゲノム進化と腫瘍内不均一性を解明し、新規バイオマーカーならびに新規治療標的の同定を試みる。

シングルセルシークエンスを用いたBCG不応性膀胱癌の解明

2020年04月

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2023年03月

慶應義塾大学, 科学研究費助成事業, 丹羽 直也、大家 基嗣, 三上 修治, 田中 伸之, 基盤研究(C), 未設定

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再発進展リスクが高い表在性膀胱癌に対してはBCG膀胱内注入療法が行われるが、奏効率は6-7割に留まる。BCG療法が無効なBCG抵抗性膀胱癌は予後が不良であるが、現在までBCG抵抗性癌に対して膀胱全摘術以外の薬物療法は存在しない。
このBCG抵抗性膀胱癌を克服するアプローチとして、腫瘍が異なる細胞集団から構成されているとする「腫瘍内不均一性」に着目した。本研究では、1細胞レベルで遺伝子発現が解析できるシングルセルRNAシークエンス法を用い、膀胱癌マウスモデルのBCG治療前後の遺伝子発現変化を解析し、BCG治療抵抗性に寄与する標的分子を明らかにすることを目的とする。

腎癌幹細胞ニッチを掌握する解析基盤の構築とがん組織不均一性の理解

2019年04月

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2022年03月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 田中　伸之、大家 基嗣, 三上 修治, 小坂 威雄, 水野 隆一, 松本 一宏, 基盤研究（Ｂ）, 補助金,  研究分担者

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本研究は、先端の流体力学に基づく、血液中からの循環腫瘍細胞(CTC)濃縮システムを駆使し、腎がん分子標的治療患者からリアルタイムでCTC由来の癌幹細胞を回収し、シングルセルレベルで多層性解析を行う。得られる腎癌幹細胞トランスクリプトームを、ライトシート顕微鏡・膨張顕微鏡法により生体内で立体的に可視化し、治療耐性を促す癌幹細胞が生息するニッチ構造を3次元で明らかする。腫瘍内で混在するサブクローンや腫瘍免疫浸潤も全容を解明し、「がん組織多様性」克服の足掛かりとする。本研究は最終的に、癌幹細胞のオミックスデータや生息ニッチの位置・空間情報等、多角的なビックデータが閲覧可能なライブラリー構築を目指す。

全国がん登録の利活用に向けた学会研究体制の整備とその試行、 臨床データベースに基づく臨床研究の推進、及び国民への研究情報提供の在り方に関する研究

2019年04月

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2022年03月

厚生労働省, 厚生労働科学研究費補助金, 平田　公一, 応用研究, 補助金,  研究分担者

膀胱尿管逆流に対するカラードプラ法超音波検査を用いた新たな非侵襲的診断法の確立

2018年04月

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2021年03月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 浅沼　宏、大家 基嗣, 篠島 利明, 水野 隆一, 基盤研究（Ｃ）, 補助金,  研究分担者

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本研究は、健常者ボランティア、尿路感染症（UTI）患者、腎盂尿管拡張を有する患者を対象にした後方視的および前方視的な臨床研究によって膀胱尿管逆流（VUR）および逆流性腎症（RN）の診断において、カラードプラ法超音波検査による尿管口jetの方向と尿管口間隆起のなす角度（UJA）測定の有用性を検討すること、および、動物を用いた基礎研究による病理組織学的検討からその妥当性を検証することを目的とした。このうち、2018年度は以下の研究について成果を得た。
1) UJA測定の再現性、UJA値に影響する因子の検討：健常者ボランティアを被験者とし、検者3名にてUJAを測定する。UJA値のintraobserver agreementとinterobserver agreementを検証する。さらに、各被験者の膀胱容量、利尿状態、性別によるUJA値への影響を検証する。5名の男性被験者の協力を得て、上記を行い、UJA値に有意差がない結果を得た。
2) 既知の患者データを用いた後方視的検討：UTI患者を対象に、UJA値、排尿時膀胱尿道造影検査（VCUG）によるVURの有無とgrade（G）、DMSA腎シンチグラムによるRNの有無とgradeを評価する。自然消失の困難なG-III以上のVURと高度な腎瘢痕を検出できるUJAの至適なcut-off値を算出する。UTIの初期診断においてUJA測定をスクリーニング検査とした場合にVCUGをどの程度回避できるかを検討する。125症例250尿管を対象とした結果、UJAを用いたG-III以上のVUR検出においてROC曲線下面積は0.81であった。腎瘢痕が高度なほどUJAが高角度で、多発瘢痕またはsmall kidneyの全腎でUJAは50°以上であった。UTI患者でUJA50°以上でVCUGを行う方針とすると、VCUGが51.1％の症例で回避できることになった。
1) 健常者ボランティアを被験者としたUJA値測定の研究計画において、女性被験者がまだ得られておらず、現在男性被験者のみの結果となっており、性別のUJA値に与える影響が検討できていない。
2) 後方視的臨床研究のうち、腎盂尿管拡張の原因疾患として膀胱尿管逆流と尿管膀胱移行部閉塞による巨大尿管の鑑別診断において、UJA測定の有用性についての検討が登録患者数が少なく十分行えていない。
女性健常者ボランティアを募り、性別によるUJA値への影響を検証する。
尿管膀胱移行部閉塞による巨大尿管症例をさらに集積し、腎盂尿管拡張の原因疾患として膀胱尿管逆流と尿管膀胱移行部閉塞による巨大尿管の鑑別診断におけるUJA測定の有用性についての検討する。
臨床研究については、前方視的に患者を集積し、UJA値とVCUG grade、RNとの関連性、VUR診断への至適cut-off値、閉塞性尿路疾患との鑑別診断について評価する。
ヒト同様に尿管芽の発生異常から高頻度にVURを有するC3H/HeJ系またはC3H/HeN系マウスを用いて、UJA値、VUR grade、尿管膀胱移行部の解剖学的所見、腎の低・異形成と線維化について病理組織学的に検討する。

シングルセルレベルの腫瘍内不均一性をターゲットとする革新的な創薬研究

2018年04月

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2020年03月

文部科学省・日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 田中 伸之, 補助金,  研究分担者

去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)に有効な薬剤の開発

2018年04月

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2019年03月

日本医療研究開発機構（AMED）, 橋渡し研究戦略的推進プログラム, 井本　正哉, 補助金,  研究分担者

リキッドバイオプシーによる進行性腎細胞癌新規分子標的治療アルゴリズムの確立

2017年04月

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2020年03月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 水野　隆一、大家 基嗣, 三上 修治, 篠島 利明, 浅沼 宏, 基盤研究（Ｃ）, 補助金,  研究分担者

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平成29年度は血清遊離DNA、RNAを用いたリアルタイムPCR解析を行うことを目標として各種条件設定を行った。具体的にはまず収集した検体に対応する手術摘出検体のHE染色切片を再評価して組織が腎細胞癌組織であることを確認した。さらにはキットを用いてコントロール血清からDNAとRNAの抽出を行った。プロテインキナーゼKの作用時間をやや長めに設定することでRNAではA 260/280値が2.0以上、DNAではA260/280値が1.8以上の、十分に純度が高い核酸が抽出できることを確認した。さらに、RNAを逆転写してハウスキーピングジーンのPCRで増幅可能であることを確認した。DNAに対しても反復配列（ALU）を増幅させるプライマーを用いてPCRを行い、今後のvalidation study等にも使用できるクオリティであることを確認した。また、VEGF、PD-L1、VHLの発現している腎癌細胞株を陽性コントロールとして使用して細胞株間の遺伝子発現状況の違いを検討した。この解析によって腎癌細胞株におけるVHLの発現とPD-L1の発現に相関がある可能性が示唆された。また、同時に臨床データベースの構築を行った。臨床データベースの解析により本コホートにおけるファーストライン開始から病勢進行までの中央値が12ヶ月、全生存期間中央値が40ヶ月程度であることが明らかとなった。この臨床データベースと血清遊離DNA、RNAマーカーを組み合わせた解析を今後予定している。
平成29年度に予定していた血清遊離DNA、RNAを用いたリアルタイムPCR解析は予定通りには完了できなかった。これは血清から抽出したDNA、RNAが断片化されていることから、通常のプライマーを使用したPCRでは検出が困難であったためである。これを解決するためにPCR産物を120bp程度に設定したアッセイを行うこととした。断片化されているサンプルでも使用できるようにプライマーデザインをしなおしたため時間を要したが、すでにこの問題は解決されており、2ヶ月程度で予定通りの進捗に到達する。
平成30年度はVHL/VEGF および PD-L1 経路スコアを組み入れた薬剤別治療効果の検討と新規治療アルゴリズムの確立を目標としている。このアルゴリズムには臨床的リスク分類の使用を前提としているが、臨床情報データベースとリキッドバイオプシーのスコアを組み合わせた解析を行う。現状ではベースラインのヘモグロビン値、乳酸デヒドロゲナーゼ値、補正カルシウム値、チロシンキナーゼ阻害剤投与開始までの期間、パフォーマンスステータスが独立した病勢進行までの期間を予測する因子として用いられているのでこれらを利用する。

東日本におけるiPS細胞等臨床研究推進モデル病院の構築

2016年04月

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2017年03月

国立研究開発法人日本医療研究開発機構, iPS細胞等臨床研究推進モデル事業, 竹内　勤, 研究分担者

尿路上皮癌における抗がん剤耐性獲得下の微小環境とユビキチンシステムの解明

2014年04月

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2017年03月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 田中　伸之, 基盤研究（Ｃ） , 補助金,  研究分担者

間葉系幹細胞を用いた閉塞性尿路疾患に対する新規治療方法の確立

2014年04月

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2017年03月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 浅沼　宏, 基盤研究（Ｃ）, 補助金,  研究分担者

進行性透析腎癌のｍＴＯＲ阻害薬抵抗性の克服に向けた基礎研究

2013年04月

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2015年04月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 水野　隆一, 基盤研究（Ｃ） , 補助金,  研究分担者

転写因子を制御した新規尿路上皮癌治療戦略の確立

2013年04月

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2014年03月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 菊地　栄次, 基盤研究（Ｃ）, 補助金,  研究分担者

骨髄由来間葉系幹細胞を用いた閉塞性腎症に対する新規治療方法の確立

2013年04月

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2014年03月

文部科学省, 科学研究費助成事業, 浅沼　宏, 基盤研究（Ｃ） , 補助金,  研究分担者

標準的治療の確立が望まれる難治性疾患に対する新規治療法の開発

2012年04月

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2017年03月

日本医療研究開発機構（AMED）, 中西　洋一, 補助金,  研究分担者

高悪性度筋層非浸潤癌に対する経尿道的膀胱腫瘍切除後の治療方針確立に関する研究

2010年04月

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2013年03月

塚本　泰司, 補助金,  研究分担者