慶應義塾研究者情報データベース

経歴 【 表示 ／ 非表示 】

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• 2010年04月

  -

  2014年03月

  慶應義塾大学医学部内科学教室

• 2014年04月

  -

  2017年03月

  慶應義塾大学医学部内科学（呼吸器）

• 2017年04月

  -

  2021年03月

  国立病院機構東京医療センター

• 2021年04月

  -

  2023年03月

  国立がん研究センター研究所ゲノム生物学研究分野

• 2023年04月

  -

  継続中

  慶應義塾大学医学部内科学（呼吸器）

学歴 【 表示 ／ 非表示 】

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• 2004年04月

  -

  2010年03月

  慶應義塾大学

  卒業

学位 【 表示 ／ 非表示 】

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• 医学博士, 慶應義塾大学, 論文, 2018年03月

研究分野 【 表示 ／ 非表示 】

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• ライフサイエンス / ゲノム生物学 （ゲノム/トランスクリプトーム）

• ライフサイエンス / 腫瘍生物学 （ゲノム/トランスクリプトーム）

• ライフサイエンス / 呼吸器内科学 （肺癌）

論文 【 表示 ／ 非表示 】

論文 【 表示 ／ 非表示 】

• Single-cell analyses and host genetics highlight the role of innate immune cells in COVID-19 severity

  Edahiro R., Shirai Y., Takeshima Y., Sakakibara S., Yamaguchi Y., Murakami T., Morita T., Kato Y., Liu Y.C., Motooka D., Naito Y., Takuwa A., Sugihara F., Tanaka K., Wing J.B., Sonehara K., Tomofuji Y., Wang Q.S., Hasegawa T., Saiki R., Hyugaji T., Shimizu E., Katayama K., Kanai M., Naito T., Sasa N., Yamamoto K., Takahashi K., Harada N., Naito T., Hiki M., Matsushita Y., Takagi H., Ichikawa M., Nakamura A., Harada S., Sandhu Y., Kabata H., Masaki K., Kamata H., Ikemura S., Chubachi S., Okamori S., Terai H., Morita A., Asakura T., Sasaki J., Morisaki H., Uwamino Y., Nanki K., Uchida S., Uno S., Nishimura T., Ishiguro T., Isono T., Shibata S., Matsui Y., Hosoda C., Takano K., Nishida T., Kobayashi Y., Takaku Y., Takayanagi N., Ueda S., Tada A., Miyawaki M., Yamamoto M., Yoshida E., Hayashi R., Nagasaka T., Arai S., Kaneko Y., Sasaki K., Tagaya E., Kawana M., Arimura K., Takahashi K., Anzai T., Ito S., Endo A., Uchimura Y., Miyazaki Y., Honda T., Tateishi T., Tohda S., Ichimura N., Sonobe K., Sassa C.T., Nakajima J., Nakano Y., Nakajima Y., Anan R., Arai R., Kurihara Y., Harada Y., Nishio K., Ueda T., Azuma M., Saito R., Sado T.

  Nature Genetics （Nature Genetics）  55 （ 5 ） 753 - 767 2023年05月

  ISSN  10614036

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  Mechanisms underpinning the dysfunctional immune response in severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection are elusive. We analyzed single-cell transcriptomes and T and B cell receptors (BCR) of >895,000 peripheral blood mononuclear cells from 73 coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients and 75 healthy controls of Japanese ancestry with host genetic data. COVID-19 patients showed a low fraction of nonclassical monocytes (ncMono). We report downregulated cell transitions from classical monocytes to ncMono in COVID-19 with reduced CXCL10 expression in ncMono in severe disease. Cell–cell communication analysis inferred decreased cellular interactions involving ncMono in severe COVID-19. Clonal expansions of BCR were evident in the plasmablasts of patients. Putative disease genes identified by COVID-19 genome-wide association study showed cell type-specific expressions in monocytes and dendritic cells. A COVID-19-associated risk variant at the IFNAR2 locus (rs13050728) had context-specific and monocyte-specific expression quantitative trait loci effects. Our study highlights biological and host genetic involvement of innate immune cells in COVID-19 severity.

  • Access to Document (DOI)

• Diagnostic and prognostic biomarkers for progressive fibrosing interstitial lung disease

  Watase M., Mochimaru T., Kawase H., Shinohara H., Sagawa S., Ikeda T., Yagi S., Yamamura H., Matsuyama E., Kaji M., Kurihara M., Sato M., Horiuchi K., Watanabe R., Nukaga S., Irisa K., Satomi R., Oyamada Y.

  PLoS ONE （PLoS ONE）  18 （ 3 March ）  2023年03月

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  No biomarkers have been identified in bronchoalveolar lavage fluid (BALF) for predicting fibrosis progression or prognosis in progressive fibrosing interstitial lung disease (PF-ILD). We investigated BALF biomarkers for PF-ILD diagnosis and prognosis assessment. Overall, 120 patients with interstitial pneumonia who could be diagnosed with PF-ILD or non PF-ILD were enrolled in this retrospective study. PF-ILD was diagnosed according to Cottin's definition. All patients underwent bronchoscopy and BALF collection. We evaluated blood and BALF parameters, high-resolution computed tomography (HRCT) patterns, and spirometry data to identify factors influencing PF-ILD diagnosis and prognosis. On univariate logistic analysis, age, sex, the BALF white blood cell fraction (neutrophil, lymphocyte, eosinophil, and neutrophil-to-lymphocyte ratio), BALF flow cytometric analysis (CD8), and an idiopathic pulmonary fibrosis/usual interstitial pneumonia pattern on HRCT were correlated with PF-ILD diagnosis. Multivariate logistic regression analysis revealed that sex (male), age (cut-off 62 years, area under the curve [AUC] 0.67; sensitivity 0.80; specificity 0.47), white blood cell fraction in BALF (NLR, neutrophil, and lymphocyte), and CD8 in BALF (cut-off 34.2; AUC 0.66; sensitivity, 0.74; specificity, 0.62) were independent diagnostic predictors for PF-ILD. In BALF, the NLR (cut-off 8.70, AUC 0.62; sensitivity 0.62; specificity 0.70), neutrophil count (cut-off 3.0, AUC 0.59; sensitivity 0.57; specificity 0.63), and lymphocyte count (cut-off 42.0, AUC 0.63; sensitivity 0.77; specificity 0.53) were independent diagnostic predictors. In PF-ILD patients (n = 77), lactate dehydrogenase (cut-off 275, AUC 0.69; sensitivity 0.57; specificity 0.78), Krebs von den Lungen-6 (cut-off 1,140, AUC 0.74; sensitivity 0.71; specificity 0.76), baseline forced vital capacity (FVC) (cut-off 1.75 L, AUC 0.71; sensitivity, 0.93; specificity, 0.46), and BALF neutrophil ratio (cut-off 6.0, AUC 0.72; sensitivity 0.79; specificity 0.80) correlated with death within 3 years. The BALF cellular ratio, particularly the neutrophil ratio, correlated with the diagnosis and prognosis of PF-ILD. These findings may be useful in the management of patients with interstitial pneumonia.

  • Access to Document (DOI)

• Most Important Things and Associated Factors With Prioritizing Daily Life in Patients With Advanced Lung Cancer

  Kameyama N., Sato T., Arai D., Fujisawa D., Takeuchi M., Nakachi I., Kawada I., Yasuda H., Ikemura S., Terai H., Nukaga S., Nakano Y., Hirano T., Minematsu N., Asakura T., Kamatani T., Tanaka K., Suzuki S., Miyawaki M., Naoki K., Fukunaga K., Soejima K.

  JCO Oncology Practice （JCO Oncology Practice）  18 （ 12 ） E1977 - E1986 2022年12月

  ISSN  26881527

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  PURPOSE:Patients' values and priorities in their lives should be appreciated from an early phase of incurable diseases such as advanced cancer. However, studies examining these characteristics have been lacking. This study attempted to determine what patients with advanced lung cancer valued most, once they had been diagnosed, and any associated factors.METHODS:Patients with newly diagnosed advanced lung cancer (N = 248) were enrolled in a questionnaire survey conducted at 16 hospitals in Japan. Their priorities were assessed using a free-text response to the question what is the most important thing to you now? at the time of diagnosis and 3 months after diagnosis. The free-text responses were classified into 10 categories for quantification. The clinical characteristics associated with the category describing daily life were further examined.RESULTS:Free-text comments were obtained from 103 (44.0%) and 66 (42.6%) patients at the time of diagnosis and at 3 months, respectively. The most frequent categories were family (at diagnosis: 50.5%; at 3 months: 50.0%) and daily life (at diagnosis: 33.0%; at 3 months: 36.4%), followed by health (at diagnosis: 32.0%; at 3 months: 27.3%) at both time points. The patients mentioning daily life, the issues related to how to spend daily life, showed significantly higher total scores and functional well-being subscale scores on the Functional Assessment of Cancer Therapy-Lung scale at both time points and lower depression scores at diagnosis and lower anxiety scores at 3 months on the Hospital Anxiety and Depression Scale.CONCLUSION:Family and daily life were highly valued by patients with advanced lung cancer at diagnosis. A better quality of life and better mood were associated with mentioning daily life, which should be taken into account in care planning to maintain patients' involvement in daily life even with incurable diseases.

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• The whole blood transcriptional regulation landscape in 465 COVID-19 infected samples from Japan COVID-19 Task Force

  Wang Q.S., Edahiro R., Namkoong H., Hasegawa T., Shirai Y., Sonehara K., Tanaka H., Lee H., Saiki R., Hyugaji T., Shimizu E., Katayama K., Kanai M., Naito T., Sasa N., Yamamoto K., Kato Y., Morita T., Takahashi K., Harada N., Naito T., Hiki M., Matsushita Y., Takagi H., Ichikawa M., Nakamura A., Harada S., Sandhu Y., Kabata H., Masaki K., Kamata H., Ikemura S., Chubachi S., Okamori S., Terai H., Morita A., Asakura T., Sasaki J., Morisaki H., Uwamino Y., Nanki K., Uchida S., Uno S., Nishimura T., Ishiguro T., Isono T., Shibata S., Matsui Y., Hosoda C., Takano K., Nishida T., Kobayashi Y., Takaku Y., Takayanagi N., Ueda S., Tada A., Miyawaki M., Yamamoto M., Yoshida E., Hayashi R., Nagasaka T., Arai S., Kaneko Y., Sasaki K., Tagaya E., Kawana M., Arimura K., Takahashi K., Anzai T., Ito S., Endo A., Uchimura Y., Miyazaki Y., Honda T., Tateishi T., Tohda S., Ichimura N., Sonobe K., Sassa C.T., Nakajima J., Nakano Y., Nakajima Y., Anan R., Arai R., Kurihara Y., Harada Y., Nishio K., Ueda T., Azuma M., Saito R., Sado T., Miyazaki Y., Sato R., Haruta Y., Nagasaki T., Yasui Y., Hasegawa Y., Mutoh Y., Kimura T., Sato T.

  Nature Communications （Nature Communications）  13 （ 1 ）  2022年12月

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  Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is a recently-emerged infectious disease that has caused millions of deaths, where comprehensive understanding of disease mechanisms is still unestablished. In particular, studies of gene expression dynamics and regulation landscape in COVID-19 infected individuals are limited. Here, we report on a thorough analysis of whole blood RNA-seq data from 465 genotyped samples from the Japan COVID-19 Task Force, including 359 severe and 106 non-severe COVID-19 cases. We discover 1169 putative causal expression quantitative trait loci (eQTLs) including 34 possible colocalizations with biobank fine-mapping results of hematopoietic traits in a Japanese population, 1549 putative causal splice QTLs (sQTLs; e.g. two independent sQTLs at TOR1AIP1), as well as biologically interpretable trans-eQTL examples (e.g., REST and STING1), all fine-mapped at single variant resolution. We perform differential gene expression analysis to elucidate 198 genes with increased expression in severe COVID-19 cases and enriched for innate immune-related functions. Finally, we evaluate the limited but non-zero effect of COVID-19 phenotype on eQTL discovery, and highlight the presence of COVID-19 severity-interaction eQTLs (ieQTLs; e.g., CLEC4C and MYBL2). Our study provides a comprehensive catalog of whole blood regulatory variants in Japanese, as well as a reference for transcriptional landscapes in response to COVID-19 infection.

  • Access to Document (DOI)

• Fusion Genes in Cancer-Toward Treatment from a Pan-Cancer Perspective

  Nukaga S., Kohno T.

  Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy （Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy）  49 （ 10 ） 1030 - 1034 2022年10月

  ISSN  03850684

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  In recent years, genetic testing using next-generation sequencers has become widespread in the field of cancer drug therapy, and treatments based on individual genetic disorders are now routinely used. Drug development is underway to target various fusion genes among the detected genetic disorders. However, the functional significance of most of the detected fusion genes is unknown, and it is necessary to understand their biological characteristics and elucidate their functions for the development of personalized medicine. We review the molecular biology, detection, and treatment of cancer fusion genes from a pan-cancer perspective.

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KOARA（リポジトリ）収録論文等 【 表示 ／ 非表示 】

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• 第三世代EGFR-TKIの耐性化機序の解明と臨床への還元システムの構築

  額賀, 重成

  科学研究費補助金研究成果報告書 2019年

• Imaging massspectrometryでの分子標的薬の薬物動態の解明

  額賀, 重成

  科学研究費補助金研究成果報告書 2017年

• Amplification of EGFR wild-type alleles in non-small cell lung cancer cells confers acquired resistance to mutation-selective EGFR tyrosine kinase inhibitors(要約)

  額賀, 重成

  （慶應義塾大学大学院医学研究科）  2017年

• Amplification of EGFR wild-type alleles in non-small cell lung cancer cells confers acquired resistance to mutation-selective EGFR tyrosine kinase inhibitors(要旨)

  額賀, 重成

  （慶應義塾大学大学院医学研究科）  2017年

• Amplification of EGFR wild-type alleles in non-small cell lung cancer cells confers acquired resistance to mutation-selective EGFR tyrosine kinase inhibitors(審査報告)

  額賀, 重成

  （慶應義塾大学大学院医学研究科）  2017年

総説・解説等 【 表示 ／ 非表示 】

総説・解説等 【 表示 ／ 非表示 】

• がんと遺伝子融合―Pan‒Cancer での治療をめざして―

  額賀重成, 河野隆志

  癌と化学療法 （癌と化学療法社）  49 （ 10 ） 1030 - 1034 2022年

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）, 筆頭著者

• がんの発症原因となる変異遺伝子とその診断・治療への活用：非小細胞肺癌.

  疾患原因遺伝子・タンパク質の解析技術と創薬/診断技術への応用 （技術情報協会）  1 2022年

  記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）, 筆頭著者

競争的研究費の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】

競争的研究費の研究課題 【 表示 ／ 非表示 】

• RNAスプライシング解析に基づくドライバー変異陰性肺癌の新規治療標的の同定

  2025年04月

  -

  2028年03月

  文部科学省, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 額賀 重成, 補助金,  研究代表者

• がん免疫療法に対する応答性決定因子としてのRNAプロセッシング異常の解析

  2025年04月

  -

  2028年03月

  文部科学省, 科学研究費助成事業 基盤研究（Ｂ）, 研究分担者

• 肺がんにおけるRNA多様性とゲノム異常の統合解析に基づく新規治療法の開発

  2024年04月

  -

  2026年03月

  国立研究開発法人日本医療研究開発機構, 次世代がん医療加速化研究事業, 研究分担者

• 大規模肺癌コホートの網羅的スプライシング解析に基づく新規治療標的の同定

  2024年01月

  -

  2025年12月

  公益財団法人MSD生命科学財団, 2023年度がん領域若手研究者, 補助金,  研究代表者

• 大規模がんゲノム情報に基づく異常スプライシングに対する新たな創薬標的の開発

  2023年04月

  -

  2026年03月

  国立研究開発法人日本医療研究開発機構, 日本医療研究開発機構研究費　創薬基盤推進研究事業, 研究分担者

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受賞 【 表示 ／ 非表示 】

受賞 【 表示 ／ 非表示 】

• MSD生命科学財団 2025年度医学奨励賞 最優秀賞

  2025年12月, 公益財団法人 MSD生命科学財団, 大規模肺癌コホートの網羅的スプライシング解析に基づく新規治療標的の同定

  受賞区分： 出版社・新聞社・財団等の賞

• 令和3年度 HOPE事業助成金 シニア・リサーチフェロー

  2021年, 公益財団法人 がん研究振興財団

  受賞区分： 出版社・新聞社・財団等の賞

• 第7回慶應義塾呼吸器内科同門会賞

  2018年07月

  受賞区分： 塾内表彰等

• 第58回日本肺癌学会学術集会 若手奨励賞

  2017年10月, 日本肺癌学会

  受賞区分： 国内学会・会議・シンポジウム等の賞

担当授業科目 【 表示 ／ 非表示 】

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• 内科学（呼吸器）講義

  2026年度

• 内科学（呼吸器）講義

  2024年度, 学部専門科目

• 呼吸器内科学臨床実習

  2024年度